代文娟 作品数:10 被引量:61 H指数:4 供职机构: 广西壮族自治区中国科学院广西植物研究所 更多>> 发文基金: 广西科技创新能力与条件建设项目 国家自然科学基金 广西壮族自治区自然科学基金 更多>> 相关领域: 生物学 农业科学 更多>>
狭叶坡垒RAPD-PCR反应体系优化 被引量:3 2013年 以濒危物种狭叶坡垒硅胶干燥的叶片为材料,研究其RAPD-PCR体系优化条件。结果表明,优化的狭叶坡垒RAPD-PCR反应体系为:25μL体系中1×PCR buffer,3 mmol/L Mg2+,0.2 mmol/L dNTPs,0.5 U/25μL Taq聚合酶,0.4μmol/L引物,5 ng/μL DNA模板;最佳扩增程序为:94℃预变性5 min;94℃变性1 min,35℃退火1 min,72℃延伸1.5min,35个循环;72℃最后延伸7 min。 代文娟 黎乾坤 骆文华 唐文秀 赵博 盘波 黄仕训关键词:RAPD 广西火桐基因组DNA提取方法的研究 被引量:3 2013年 以广西火桐[Erythropsis kwangsiensis(Hsue)Hsue]叶片为试料,比较了改良CTAB法、试剂盒法和改良SDS法提取基因组DNA的提取效果及对干燥叶和鲜叶提取的基因组DNA进行了比较研究。结果表明,改良CTAB法和试剂盒法提取的基因组DNA质量较好、杂质少,适合广西火桐基因组DNA的提取。改良SDS法提取的基因组DNA无完整条带,质量较差,不适合广西火桐基因组DNA提取。硅胶干燥90 d的叶样和新鲜叶样所得的基因组DNA纯度相当,产率前者多于后者。 骆文华 黄仕训 马虎生 符支宏 代文娟 唐文秀 盘波 赵博关键词:基因组DNA 正交设计优化狭叶坡垒ISSR-PCR反应体系 被引量:6 2011年 以狭叶坡垒DNA为模板,利用正交试验分别对ISSR-PCR反应的MgCl2浓度、dNTPs浓度、Taq聚合酶浓度、引物浓度、模板DNA浓度进行了优化,并通过梯度PCR确定最佳退火温度和循环次数,最终确定狭叶坡垒最佳反应体系及扩增条件为:25μL体系中1×PCRbuffer,2mmol/LMgCl2,0.25mmol/LdNTPs,0.04U/μLTaq聚合酶,0.2μmol/L引物,4ng/μLDNA模板;最佳扩增程序为:94℃预变性5min;94℃变性45s,53℃退火45s,72℃延伸1.5min,共35个循环;72℃最后延伸7min。 代文娟 唐文秀 邓涛 丁莉 骆文华 黄仕训关键词:正交设计 ISSR-PCR 濒危植物资源冷杉种子败育机理及保育对策 胡兴华 丁涛 代文娟 蒋水元 钟树华 符支宏 课题来源:《濒危植物资源冷杉种子败育机理及保育对策》(合同编号:2013GXNSFAA019079)是广西壮族自治区科学技术厅“桂财教[2013]19”号文件下达的,由广西壮族自治区中国科学院广西植物研究所独立承担的自然...关键词:关键词:冷杉 针叶树种 人工授粉 正交设计优化广西火桐ISSR-PCR反应体系 被引量:3 2013年 以广西火桐DNA为模板,利用正交试验分别对ISSR-PCR反应的MgCl2浓度、dNTPs浓度、TaqDNA聚合酶浓度、模板DNA浓度进行了优化,并通过梯度PCR确定最佳退火温度和循环次数,最终确定广西火桐最佳反应体系及扩增条件。25μL体系中1×PCR buffer,2.5 mmol/L MgCl2,0.15 mmol/L dNTPs,0.06 U/μL TaqDNA聚合酶,3 ng/μL DNA模板,0.2μmol/L引物;最佳扩增程序为:94℃预变性5 min;94℃变性45 s,52℃退火45 s,72℃延伸1.5 min,共30个循环;72℃最后延伸7 min。扩增后的PCR产物在4℃保存。应用该ISSR体系对10个广西火桐样品进行了扩增,证实了该体系的适用性和稳定性。 代文娟 骆文华 马虎生 符支宏 唐文秀 赵博 盘波 黄仕训关键词:正交设计 叶绿体微卫星分析濒危植物资源冷杉的遗传多样性 被引量:24 2006年 用叶绿体微卫星(cpSSR)分子标记研究资源冷杉(Abies z iyuanensis)的遗传变异。资源冷杉分别取样于广西资源县和湖南城步县交界的银竹老山、湖南东安和新宁交界处的舜黄山、湖南炎陵县大院的7个居群。样品采用CTAB法进行总DNA的提取,用6对cpSSR引物进行扩增,扩增产物经95℃变性后在6%的变性聚丙烯酰胺凝胶上进行电泳,然后应用POPGEN V ersion 1.31软件计算资源冷杉各个居群的N ei's基因多样性指数(H e),Shannon信息多样性指数(I),基因分化系数(G st)以及N ei's遗传距离。用NTSY Spc V ersion 2.10软件进行U PGMA聚类分析,并对地理距离和遗传距离相关性进行M en tal检验。用ARLEQU IN 2.000软件分析地区间、居群间和居群内的遗传变异,统计有效单型模式数量。结果6对cpSSR引物中选出3对多态性引物,共扩增出7个位点。N ei's基因多样度H e为0.2922,信息多样性指数I为0.4428,基因分化系数G st为0.5805。资源冷杉的遗传分化主要存在于居群间,分布在银竹老山和舜黄山的资源冷杉与分布在大院的资源冷杉之间产生了明显的遗传分化,两地资源冷杉之间的遗传变异占总的68.87%。 代文娟 唐绍清 刘燕华广西火桐自然种群和迁地保护种群的遗传多样性比较 被引量:16 2015年 采用ISSR标记方法,对广西火桐Erythropsis kwangsiensis 10个自然种群和1个迁地保护种群的遗传多样性和遗传结构进行了分析和比较。结果表明:用10个引物从广西火桐总DNA中共扩增出60条带,其中多态性条带51条。自然种群中以维新种群的遗传多样性最高,而三叠岭瀑布种群最低。自然种群的总遗传变异Ht为0.281 5,种群内遗传变异HS为0.076 4,种群间遗传变异为0.205 1,基因流为0.183 2。迁地保护种群的HEt和HES均为0.118 8。自然种群间存在一定程度的遗传分化(Gst=0.731 9),种群间变异占主导地位。合并后的自然种群的多态性条带百分率(RPPB)、Nei’s多样性指数(H)和Shannon信息指数(I)均高于迁地保护种群,分别为85.00%和31.67%、0.284 1和0.118 8、0.428 5和0.175 7。研究结果表明:广西火桐迁地保护种群的遗传多样性较低,未能涵盖整个种群。建议从多个自然种群中收集种子,尽可能多的采集样本,分区育苗种植,以增加遗传多样性水平。 骆文华 代文娟 刘建 胡兴华 李祥军 黄仕训关键词:野生种群 ISSR 狭叶坡垒基因组总DNA的提取和纯化方法研究 被引量:4 2011年 以狭叶坡垒叶片为材料,对基因组总DNA的提取和纯化方法进行了研究,并对改良CTAB法、高盐低pH法和改良SDS法进行比较。结果表明,改良的CTAB法更适合狭叶坡垒基因组总DNA的提取,且硅胶干燥30 d的叶样和新鲜叶样所得的DNA几乎没有区别。再对改良CTAB法的水浴时间进行探索,发现150 m in是较为合适的水浴时间。对比酚纯化法和试剂盒纯化法,发现试剂盒纯化损失的DNA少,得率高,是一种简便、快速、安全的纯化方法。 代文娟 唐文秀 邓涛 丁莉 骆文华 黄仕训关键词:总DNA提取 纯化 狭叶坡垒迁地保护种群的RAPD多样性分析 被引量:3 2013年 采用RAPD分子标记技术对2个迁地保护的狭叶坡垒种群进行遗传多样性分析,结果表明,10条引物共扩增出69个位点,其中36条具有多态性,多态位点比例为52.17%,其中,西双版纳种群的多态位点百分比为36.23%;桂林种群为15.94%。2个迁地保护种群的Shannon平均值为0.1178,Nei's多样性指数平均值为0.0757,遗传分化系数G st为0.634 0,63.41%的遗传变异存在于种群间。 代文娟 黎乾坤 骆文华 唐文秀 赵博 盘波 黄仕训关键词:RAPD 种群 迁地保护 资源冷杉的保护遗传学研究 资源冷杉(Abies ziyuanensis)是松科冷杉属常绿乔木,为国家一级保护植物,分布于广西与湖南交界的银竹老山、湖南舜黄山、湖南炎陵县大院林场及江西井冈山。资源冷杉是第四纪冰川残存的孑遗植物,对研究我国南部植物区... 代文娟关键词:一级保护植物 居群遗传结构 RAPD ISSR AFLP 文献传递