黄宏斌
- 作品数：9 被引量：37H指数：4
- 供职机构：中南大学更多>>
- 发文基金：中央高校基本科研业务费专项资金中南大学博士后科学基金湖南省自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- 一个肝癌相关长链非编码RNA的克隆及序列分析被引量：5
- 2014年
- 最近我们利用新一代测序(next generation sequencing,NGS)技术对肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者活检标本及正常对照肝组织样品进行高通量RNA测序(RNA-sequencing,RNA-Seq),在肝癌样品中染色体11q13.1区域检测到几个相邻的RNA-Seq信号峰,而在正常对照组织中没有检测到,且该染色体区域目前尚无已知基因登录,提示这几个RNA-Seq峰可能代表一个或多个未知的新基因.以此为线索,证实这几个RNA-Seq峰来自同一个新基因,并克隆了该基因全长序列,在克隆该基因全长序列时,发现该基因编码的RNA存在多种剪接形式,最长的转录本为3 562 bp.将该基因编码的12条代表性RNA转录本序列递交到美国国立生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)的GenBank数据库中,GenBank ID号分别为KC136297~KC136308.该基因编码的RNA没有发现明显的开放阅读框(open reading fragment,ORF),提示该基因可能编码长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA).为了探讨该lncRNA基因可能的转录调控机制,我们用生物信息学方法预测了该lncRNA基因潜在启动子区域,发现在其转录起始位点上游-719^-469 bp处有一个潜在的启动子,其中包含7个Sp1、1个STAT5和1个EGR1转录因子结合位点.该lncRNA在肝细胞癌发生发展过程中的作用机制值得进一步深入研究.
- 唐珂魏芳孛昊黄宏斌张文玲龚朝建李夏雨宋亚莉廖前进彭淑平向娟娟周鸣马健李小玲熊炜李勇曾朝阳李桂源
- 关键词：长链非编码RNA肝细胞癌基因克隆生物信息学
- 长链非编码RNA LINC01420的应用方法
- 本发明公开了一种肺癌辅助诊断或者疗效预测用的生物标记物及其应用，主要是用于制备肺癌辅助诊断或者疗效预测的实时荧光定量检测试剂。通过研究证实高表达LINC01420的肺癌患者比低表达LINC01420的肺癌患者预后差，因此...
- 郭灿熊炜曾朝阳李桂源熊芳黄宏斌李小玲喻建军唐艳艳杨丽婷魏芳龚朝建
- 文献传递
- lncRNAs参与基因表达调控机制的研究进展被引量：7
- 2014年
- 长链非编码RNAs(long non-coding RNAs,lncRNAs)是一组内源性、长度超过200 nt、缺少特异完整的开放阅读框(open reading frame,ORF)、无或很少有蛋白编码功能的RNAs分子。近年来的研究发现,lncRNAs与许多重要的生物学过程相关,如基因组印记、细胞分化、免疫反应等。lncRNAs在表观遗传水平、转录水平和转录后水平等多个层面调节基因的表达,通过介导染色质重塑和组蛋白修饰、干扰转录、调节选择性剪接模式、生成小RNAs、调节蛋白质活性、改变蛋白质定位等方式,参与机体生长、发育、衰老及死亡等重要生命活动的调控。关于lncRNAs参与基因表达调控的机制有待进一步研究,这将有助于深入理解疾病的发病机制,为寻找疾病分子标记物、药物靶点提供新的方向。
- 杨倩黄宏斌龚朝建熊炜曾朝阳李桂源
- 关键词：表观遗传调控转录调控转录后调控
- 一个长链非编码RNA基因在制备干扰和抑制剂上的应用方法
- 本发明涉及一个新克隆的长链非编码RNA基因的应用方法，具体是该长链非编码RNA基因在制备干扰和抑制剂上的应用方法；根据该基因序列，设计并合成了用于RNA干扰封闭该长链非编码RNA表达的短发夹结构RNA真核表达载体，利用该...
- 李桂源熊炜曾朝阳李小玲向波李夏雨黄宏斌廖前进张文玲范松青石磊周鸣马健向娟娟彭淑平周艳宏
- 长链非编码RNA LINC01420的应用方法
- 本发明公开了一种肺癌辅助诊断或者疗效预测用的生物标记物及其应用，主要是用于制备肺癌辅助诊断或者疗效预测的实时荧光定量检测试剂。通过研究证实高表达LINC01420的肺癌患者比低表达LINC01420的肺癌患者预后差，因此...
- 郭灿熊炜曾朝阳李桂源熊芳黄宏斌李小玲喻建军唐艳艳杨丽婷魏芳龚朝建
- 文献传递
- 天然免疫分子乳铁蛋白抑制鼻咽癌的发生发展被引量：1
- 2013年
- 鼻咽癌（nasopharyngeal carcinoma,NPC）的发病具有明显的区域和人种聚集性,主要高发于中国南方和东南亚一些国家;鼻咽癌发病还具有明显的家族聚集性,有癌家族史的鼻咽癌患者约占10%,而且大部分发生在一级亲属中.明显的区域和人群聚集以及高比例的家族性发病提示遗传因素在鼻咽癌的发病过程中具有重要作用．
- 黄宏斌邓敏郑瑛马健张文玲周艳宏廖前进熊炜李小玲曾朝阳李桂源
- 关键词：鼻咽癌乳铁蛋白免疫分子发病过程聚集性
- microRNAs与TP53基因调控网络研究进展被引量：20
- 2012年
- TP53基因(编码p53蛋白)作为一个重要的抑瘤基因,通过调控一系列信号转导通路广泛参与了多种恶性肿瘤的发生发展,一直是肿瘤分子生物学研究领域的热点.最近的研究发现,microRNAs(miRNAs)参与了TP53的信号通路,它们之间存在着复杂的调控网络.一方面,p53通过调控一些miRNAs的转录及转录后成熟,促进细胞周期阻滞、诱导细胞凋亡和衰老,抑制肿瘤发生.另一方面,许多miRNAs,如miR-25、miR-30d、miR-125b和miR-504等可直接调控p53的表达与活性,参与TP53信号通路的调节,还有一些miRNAs则通过调节p53上下游基因,发挥重要的生物学功能.其中,最具有代表性的是miR-34家族,它们受p53直接调控并参与TP53信号通路,通过靶向抑制多个TP53信号通路关键分子的表达,发挥抑瘤作用.此外,它们还可以通过抑制沉默信息调节子,增强p53的活性,反馈调节TP53信号通路.miRNAs与TP53之间调控网络的研究,是对TP53抑瘤机制的重要补充.
- 龚朝建黄宏斌徐柯梁芳李小玲熊炜曾朝阳李桂源
- 关键词：MIRNAS信号通路转录
- 生物信息技术加速开发旧药新用途被引量：6
- 2012年
- 传统的技术路线研发新药,不仅周期很长而且耗资巨大,开发已获批准药物新的治疗用途,又称为药物重定位,比传统的新药研发具有明显的优势.基于芯片的基因表达谱分析,已常规地广泛用于各种人类疾病的临床研究,提供了在全基因组水平描述疾病状态的特征信号.同时,基因芯片也广泛地用于对比药物处理前后细胞基因表达模式的变化,这也提供了反映药物效应的高质量信号.最近出版的Science Translational Medicine杂志同时发表了一个研究组的两篇论文,为我们展示了如何利用生物信息学手段重新解析和比较全基因组基因表达谱数据,以高效地预测药物的新用途.这两篇论文使用了公共数据库中的100种疾病基因表达谱数据,以及164种药物处理前后细胞基因表达谱数据,通过比较和配对疾病与药物基因表达谱,得到了一些可以逆转疾病异常表达基因的药物,其中证实了一些已知的药物-疾病组合,也预测了一些新的药物-疾病组合.最后通过实验验证了抗溃疡药可用于治疗肺癌,而抗癫痫药可治疗炎症性肠道疾病,进一步证实了他们所采用研究策略的正确性.于是,肺癌和炎性肠道疾病这两种临床上难治的疾病有了新的候选治疗药物,我们也有了一种挖掘已有数据快速发现药物新用途的思路和方法.
- 黄宏斌梁芳熊炜李小玲曾朝阳李桂源
- 关键词：生物信息学基因表达谱
- 一个长链非编码RNA基因在制备干扰和抑制剂上的应用方法
- 本发明涉及一个新克隆的长链非编码RNA基因的应用方法，具体是该长链非编码RNA基因在制备干扰和抑制剂上的应用方法；根据该基因序列，设计并合成了用于RNA干扰封闭该长链非编码RNA表达的短发夹结构RNA真核表达载体，利用该...
- 李桂源熊炜曾朝阳李小玲向波李夏雨黄宏斌廖前进张文玲范松青石磊周鸣马健向娟娟彭淑平周艳宏
- 文献传递
