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马亮
作品数:
1
被引量:17
H指数:1
供职机构:
中国科学院动物研究所
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发文基金:
科技基础性工作专项
国家基础科学人才培养基金
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相关领域:
生物学
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合作作者
黄大卫
山东农业大学植物保护学院
张宪省
山东农业大学生命科学学院
孙铮
黄岛出入境检验检疫局
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2009
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Wolbachia pipientis wMel基因组水平上的密码子使用分析
被引量:17
2009年
本实验检测了黑腹果蝇的专性寄生菌Wolbachia pipientis wMel基因组的密码子使用模式,并推测影响其密码子组成的因素.选择了478条蛋白编码基因作为研究对象,它们的GC含量比较低,约0.282~0.432.本研究结果显示,关联突变(context-dependent mutation)是影响W.pipientis wMel基因组密码子组成的主要因素.同时,Nc—Plot曲线显示,基因组的密码子组成还受到了核苷酸组成偏好性(nucleotide composition bias)的影响.对应分析的结果显示,基因长度(R=0.123,P〈0.01)和基因表达水平(R=-0.312,P〈0.01)也对基因组的密码子使用偏好性起到了一定的作用.因此,关联突变、核苷酸组成、基因长度和基因表达水平都会影响到基因组的密码子使用偏好性.Wolbachia基因组的几个特征和动物线粒体基因组具有较高的相似性,而且现在已有报道说明它们有共同的起源,但仍需进一步验证.
孙铮
马亮
MURPHY Robert
张宪省
黄大卫
关键词:
PIPIENTIS
密码子使用
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