袁芳
- 作品数：22 被引量：116H指数：7
- 供职机构：宁夏疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：宁夏回族自治区自然科学基金宁夏回族自治区卫生厅科研项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学更多>>
- 宁夏2011年-2013年度职业暴露人群血清学和环境禽流感监测分析被引量：15
- 2014年
- 目的了解宁夏职业暴露人群H5N1禽流感病毒抗体水平和环境中禽流感病毒的分布情况,为禽流感的防控提供科学依据。方法采用血凝抑制试验检测职业暴露人群A(H5N1)血凝素抗体;采用Real-time RT-PCR方法对环境标本进行H5、H7、H9禽流感病毒核酸检测,从2013年4月份起,对采集的环境标本增加H7N9核酸检测。结果职业暴露人群812人份血清H5N1抗体均为阴性;环境标本760份禽流感病毒核酸检测A型阳性率为5.13%。A型禽流感病毒核酸阳性样本除原州区未检出外,其它地区均检出阳性标本。不同监测场所城乡活禽市场样本阳性率最高,不同环境样本宰杀或摆放禽肉案板表面擦拭标本阳性率最高。结论职业暴露人群血清标本中未检测出A(H5N1)禽流感病毒抗体阳性标本,宁夏监测点环境中存在H5、H9禽流感病毒,未检出H7N9禽流感病毒。城乡活禽市场是禽流感病毒重要的集散地。
- 孙晓强温秋芳马学旻袁芳马江涛詹军
- 关键词：职业暴露人群禽流感病毒
- 2013-2014年宁夏甲型H1N1流行性感冒病毒血凝素基因变异状况及序列分析被引量：7
- 2016年
- 目的了解甲型H1N1流行性感冒(流感)病毒的检测情况和血凝素(HA)基因变异情况。方法对宁夏流感监测哨点医院采集的流感样病例(ILI)标本采用RT-PCR方法进行核酸检测,对核酸检测阳性标本进行病毒分离;对甲型H1N1毒株提取病毒RNA,通过RT-PCR反应扩增HA1并测序,测定的序列利用生物信息软件进行分析。结果宁夏流感网络实验室共检测ILI标本6 122份,核酸检测阳性数917份,其中甲型H1N1498份,占54.31%,分离甲型H1N1毒株126株;变异氨基酸多数位于HA蛋白表面,其中部分位于抗原决定簇;关键位点第222位没有变化。结论 2013-2014年度,宁夏地区流行的流感毒株主要为甲型H1N1,遗传进化分析表明甲型H1N1病毒发生了一定程度的变异,造成2013-2014年在宁夏地区的再次流行。
- 孙晓强温秋芳陈晓梅袁芳马学旻马江涛詹军
- 关键词：甲型H1N1流感病毒血凝素基因测序
- 宁夏手足口病患者柯萨奇病毒A14型VP1区序列分析被引量：1
- 2016年
- 目的了解宁夏手足口病(HFMD)患者中柯萨奇病毒A14型(CVA14)分离株的基因特征。方法收集2013年实时荧光PCR法检测非EV71和非CVA16肠道病毒核酸阳性标本280份,用RD和Hep-2细胞进行肠道病毒分离培养,分离到的毒株采用RT-PCR法扩增其VP1区基因并进行核苷酸序列测定,测序结果利用BLAST进行型别鉴定。对鉴定为CVA14的毒株进行VP1区基因同源性分析和进化分析。结果从280份标本中共分离到肠道病毒36株,其中有2株鉴定为CVA14。2株CVA14宁夏分离株相互间核苷酸同源性为99.4%,氨基酸同源性为99.3%;与原型株G14的核苷酸同源性为82.3%~82.5%,氨基酸同源性为96.6%。系统进化显示,2株CVA14宁夏株与国内其他省份CVA14毒株处于同一分支。结论引起手足口病的病原除了优势病毒株EV71和CVA16外,同时还存在着CVA14等一些较少见、易忽略的肠道病毒共同循环的现象,因此应不断加强HFMD监测,以全面了解HFMD的流行趋势和抗原变异。
- 马学旻袁芳陈慧马江涛
- 关键词：手足口病
- 2009年-2013年宁夏流感病原学监测分析被引量：5
- 2015年
- 目的 对2009年7月-2013年6月宁夏流感流行状况及毒株的型别分布进行监测分析,探讨其流行特征,为流感的防控提供依据。方法 对国家级哨点医院采集的流感样病例（ILI）样本,采用荧光RT-PCR方法进行流感病毒核酸检测,对有关资料进行统计分析。结果 宁夏流感哨点医院共采集ILI标本17 785份,流感病毒核酸检测阳性标本3 325份,总阳性率为18.70%。在阳性标本中,甲型H1N1占49.41%,季节性H3N2占26.02%,季节性H1N1占0.72%,B型占23.85%。5岁-和15岁-年龄组阳性率最高为22.28%和24.20%。4个监测年度的流行高峰均出现在冬季、春季。结论 2009年-2013年,宁夏流感流行主要以甲型为主,尤其是甲型H1N1,高发人群主要是青少年和学龄儿童,流行季节为冬季、春季。2009年甲型H1N1大流行后,流感流行毒株的亚型构成发生了变化。
- 温秋芳孙晓强袁芳任科马学旻马江涛
- 关键词：流感病原学监测
- 2013-2014年手足口病患者柯萨奇病毒A10型宁夏分离株VP1区基因特征分析
- 目的 了解宁夏手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)病例中柯萨奇病毒A10型(Coxsackievirus A10,CVA10)分离株的基因特征.方法 收集2013-2014年宁夏各...
- 马江涛袁芳林虹陈慧马学旻詹军李丽
- 关键词：手足口病基因特征
- 宁夏回族自治区2013年手足口病患者柯萨奇病毒A组10型分离株VP1区基因特征分析被引量：8
- 2015年
- 目的：了解宁夏回族自治区（宁夏）手足口病（HFMD）患者中柯萨奇病毒A组10型（Cox A10）分离株的VP1区基因特征。方法收集2013年real-time PCR 检测非EV71和非Cox A16肠道病毒标本280份，用RD细胞进行肠道病毒分离培养，分离到的毒株采用RT-PCR扩增其VP1区基因并进行核苷酸序列测定，测序结果利用BLAST进行型别鉴定。对鉴定为Cox A10的所有毒株进行VP1区基因同源性分析和进化分析。结果从280份标本中共分离到肠道病毒36株，其中有6株鉴定为Cox A10，核苷酸和氨基酸同源性分别为97.0%～99.8%和99.0%～99.7%。与A、B、C、D各基因亚型代表株之间的核苷酸同源性分别为76.3%～77.2%、81.6%～83.1%、94.4%～98.9%和80.0%～82.3%，氨基酸序列同源性分别为92.3%～93.0%、94.0%～95.3%、98.0%～99.7%和90.6%～94.0%。系统进化显示，6株Cox A10宁夏株与C基因型代表株处于同一分支。结论 Cox A10是引起宁夏2013年HFMD的常见病原体，本次分离到的Cox A10均属于C基因型。
- 马江涛袁芳陈慧马学旻詹军李丽
- 关键词：手足口病基因特征
- 2017~2018年宁夏回族自治区手足口病流行特征及CV-A6基因特征分析被引量：7
- 2020年
- 手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)是一种常见的儿童急性传染病,近年来由柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)引起的HFMD病例不断增多,CV-A6已逐渐成为HFMD的主要病原体之一。为了解2017~2018年宁夏回族自治区HFMD的流行特征及其病原谱构成,并分析CV-A6的基因特征,本研究收集2017~2018年宁夏回族自治区HFMD的流行病学资料,分析其流行特征及主要致病病原体;采集HFMD临床标本,并使用RD细胞进行病毒分离;对分离出的肠道病毒(Enterovirus,EV)毒株进行全长VP1区扩增及核苷酸序列测定,使用分子定型法鉴定其血清型,选取鉴定结果为CV-A6的序列与GenBank上下载的其他地区的CV-A6代表株共同构建系统进化树。结果显示,2017年宁夏HFMD的主要致病病原体为肠道病毒A组71型(EV-A71)(56.18%)和非EV-A71非CV-A16的其他EV(37.39%),2018年的主要病原为非EV-A71非CV-A16的其他EV(70.72%)和CV-A16(27.70%)。2017和2018年,非EV-A71非CV-A16的其他EV中CV-A6所占比例分别为64.86%(24/37)和70.59%(12/17)。35株CV-A6宁夏株获得全长VP1序列,与CV-A6原型株之间的核苷酸序列相似性为81.8%~83.8%,氨基酸序列相似性为94.0%~96.3%,所有宁夏CV-A6分离株均属于D3基因亚型的D3a进化分支。2017~2018年宁夏HFMD病原谱中,非EV-A71非CV-A16的其他EV已成为主要病原体,其中CV-A6所占比例最大。因此,应加强对CV-A6的监测,医院、疾控以及托幼机构等相关人员应提高对CV-A6引起的HFMD的识别与处置能力,这对HFMD防控具有重要意义。
- 梁月玲张勇詹军詹军马江涛韩振志宋洋宋洋陈慧袁芳马学旻严冬梅
- 关键词：基因特征
- 2013—2014年宁夏回族自治区柯萨奇病毒A10型分离株VP1区基因特征被引量：10
- 2015年
- 目的分析宁夏回族自治区（宁夏）手足口病病例中柯萨奇病毒A10型（CV-A10）分离株的基因特征。方法于2013年1月--2014年12月，利用手足口病实验室网络监测系统，采集宁夏各市、县到当地人民医院就诊的手足口病病例标本，共采集2470份，其中粪便标本450份，咽拭子2020份。使用人横纹肌肉瘤细胞进行病毒分离，获得的各种毒株用兼并引物进行VPl区基因扩增和序列测定。测序结果利用Blast进行病毒型别鉴定后，对鉴定为CV—A10的所有毒株进行同源性和系统进化分析。结果共收集到非EV—A71和非CV。A16的肠道病毒标本450份，分离到CV．A1036株，其中，2013年6株，2014年30株。36株毒株间的核昔酸和氨基酸同源性分别为90．6％～100．0％和90．2％--100．0％。与A、B、C、D各型别代表株的同源性比较发现，36株毒株与C型代表株的核苷酸和氨基酸同源性最高，分别为90．2％～98．9％和95．7％--99．7％。系统进化分析显示，36株宁夏CV．AIO分离株与C基因型代表株处于同一分支。结论CV—A10是引起宁夏地区手足口病的常见病原体，本次分离到的CV—A10均属于C基因型，具有较宽的同源性范围。
- 马江涛袁芳林虹陈慧马学旻詹军
- 关键词：生物学监测柯萨奇病毒感染
- 宁夏地区2019-2020年诺如病毒所致感染性腹泻流行特征和病原学分析被引量：8
- 2023年
- 了解宁夏地区感染性腹泻患者中诺如病毒的流行特征和基因进化规律,为该地区诺如病毒所致腹泻防控策略的制定提供科学依据。在宁夏自治区5个市的15家哨点医院开展腹泻症状监测,收集患者粪便标本和相关信息并采用Real-time RT-PCR方法进行诺如病毒初筛检测,阳性标本扩增其聚合酶(RdRp)-衣壳蛋白(Capsid)区基因,扩增产物测序后使用Sequencher 4.1.4软件进行序列拼接和编辑,并用MEGA-X、DNASTAR生物软件进行序列比对、系统进化分析以及同源性分析,应用SPSS 25.0软件进行相关统计学分析。结果显示2019-2020年共收集感染性腹泻患者粪便标本2 358份,诺如病毒检出率为13.44%(317/2 358)。主要为GⅡ基因群(285/317),其中,0~2岁年龄组阳性率最高,为18.43%(188/1 020);60~70岁年龄组阳性率最低,为3.36%(4/119),各年龄组阳性率差异有统计学意义(P<0.05)。不同地区、年份、季节间阳性率比较,差异有统计学意义。GⅠ基因群(32/2 358)以GⅠ.P13/GⅠ.3(75.0%)为流行优势株,GⅡ基因群以GⅡ.Pe/GⅡ.4Sydney_2012(37.18%)为流行优势株。宁夏地区诺如病毒所致腹泻好发于婴幼儿,主要为GⅡ基因群,且流行的优势基因型别有显著改变,需要加强监测。
- 魏开心石安琪曹慜袁芳赵瑜赵建华马江涛
- 关键词：感染性腹泻诺如病毒基因分型
- 2012～2016年宁夏急性驰缓性麻痹病例监测系统中非脊灰肠道病毒病原鉴定分析被引量：4
- 2018年
- 对宁夏2012～2016年急性驰缓性麻痹(Acute flaccid paralysis,AFP)病例监测中分离到的非脊灰肠道病毒(Non-polio enterovirus,NPEV)进行血清型别鉴定和基因特征分析。采用RD和L20B两种细胞对采集自AFP病例及其接触者的粪便标本进行病毒分离,分离获得的毒株使用肠道病毒简并引物进行全长VP1区基因扩增、核苷酸序列测定、基因型别鉴定和基因系统发生学分析。2012～2016年共收集959份粪便标本,其中采自AFP病例粪便标本426份,密接者粪便标本533份,分离到67株NPEV,除4株未鉴定出型别外,共鉴定出23个肠道病毒血清型,其中A组肠道病毒(EV-A)23株(36.51%),包括7个血清型,以CV-A4(12.69%)、CV-A8(6.35%)和EV-A71(6.35%)为主;B组人肠道病毒(EV-B)40株(63.5%),包括17个血清型,以CV-B组4、2和3为主,分别占11.11%、9.52%和7.93.%,未鉴定出C组和D组人肠道病毒。宁夏2012～2016年从AFP病例及密接者标本中分离到的NPEV以EV-B组为主要型别,占63.49%,随着时间的推移一些主要流行的血清型别发生了变化。
- 袁芳马江涛陈慧马学旻
- 关键词：非脊灰肠道病毒基因型别
