目的 分析致吉林省2009-2011年手足口病（hand,foot and mouth disease,HFMD）流行的柯萨奇病毒A组16型（Coxsackievirus group A type 16,CA16）分离株的基因亲缘关系.方法 对吉林省2009-2011年分离获得的54株CA16分离株的VP1编码区基因进行逆转录-聚合酶链反应扩增以及基因序列测定,使用MEGA 4.0软件进行基因亲缘关系分析.结果 吉林省2009-2011年54株CA16分离株有28株属于B1a基因亚型,26株属于B1b基因亚型;2009-2011年每年B1a基因亚型所占比例分别为86.7％、47.1％、31.8％,B1b基因亚型所占比例分别为13.3％、52.9％、68.2％.28株B1a基因亚型CA16形成了一个优势传播链和一个小传播链,26株B1b基因亚型CA16形成了一个优势传播链和两个小传播链.结论 B1a基因亚型所占比例呈现逐年下降趋势,B1b基因亚型所占比例呈现逐年增加趋势.吉林省2009-2011年呈现两个基因亚型各有一个优势传播链为主、各有1～2个小传播链为辅的共流行传播模式.
目的鉴定吉林省从急性弛缓性麻痹病例粪便标本中分离的1株VP1编码区Ⅲ/Ⅱ型疫苗重组脊髓灰质炎(脊灰)病毒[Vaccine-recombinant Poliovirus(PV),VRPV]。方法粪便标本采自1例2岁吉兰-巴雷综合征病例,使用转人PV受体的小鼠肺细胞系(Mouse Cell Line Expressing the Gene for the Human Cellular Receptor for PV,L20B)细胞和人横纹肌肉瘤(Human Rhabdomyosarcoma,RD)细胞进行病毒分离,阳性标本进行中和试验(Neutralization Test,NT)鉴定血清型,并通过逆转录-聚合酶链反应进行VP1编码区扩增和核苷酸序列测定,利用Bioedit软件对该序列结果与赛宾(Sabin)疫苗株PV进行核苷酸和氨基酸序列比对,分析重组位点的位置以及核苷酸和氨基酸的变异情况。结果该标本接种到RD和L20B细胞后,均发生了肠道病毒特征性病变,经血清学定型,结果为Ⅱ+Ⅲ型PV。VP1编码区核苷酸序列分析表明,其中的Ⅱ型PV与Sabin 2株PV比较,发生了1个核苷酸变异;Ⅲ型PV为VP1编码区Ⅲ型与Ⅱ型VRPV,与相对应的Sabin株PV相比,无核苷酸点变异,在VP1编码区重组的Ⅱ型PV序列为106个核苷酸。血清NT证明,该VRPV仍能被Ⅲ型完全中和,而不能被Ⅱ型中和。结论虽然Ⅲ型PV株中插入了Ⅱ型抗原位点NAg3a,但Ⅲ型PV株总体的型特异性抗原特征未发生改变。PV自然重组很少发生在衣壳蛋白编码区,发现的这株VRPV中和特性与Sabin株PV相比未发生变化。
