沈晓莹
- 作品数：23 被引量：24H指数：3
- 供职机构：国家工程研究中心更多>>
- 发文基金：上海市青年科技启明星计划国家自然科学基金上海市科委科研计划项目更多>>
- 相关领域：医药卫生环境科学与工程自动化与计算机技术生物学更多>>
- SMARCC1的表达与脑胶质瘤临床指标和预后的相关性及其对肿瘤细胞增殖和凋亡的影响
- 2021年
- 目的研究SMARCC1表达与脑胶质瘤临床指标和预后的相关性,及其对肿瘤细胞增殖和凋亡的影响。方法首先采用免疫组化实验检测SMARCC1在脑胶质瘤组织的表达,实验数据和临床指标及预后的相关性分析使用SPSS软件,P<0.05为有统计学意义。利用siRNA技术下调SMARCC1基因在脑胶质瘤细胞株的表达,利用MTT方法检测细胞增殖、Hochest/PI方法检测细胞凋亡,使用qPCR实验检测增殖和凋亡相关基因ki67和Bcl2的表达水平。实验数据采用GraphPad软件分析,P<0.05为有统计学意义。结果SMARCC1表达分别和病理分级、复发等显著正相关,染色评分高的脑胶质瘤病人的总生存期和无病生存期都显著更短。使用siRNA技术下调SMARCC1的表达,随后观察到脑胶质瘤细胞株U251MG和U87MG的增殖显著降低而凋亡显著增加,同时,增殖和凋亡相关基因ki67和Bcl2的mRNA表达水平也出现下调。结论SMARCC1过表达与脑胶质瘤的病理分级、复发及更差的预后显著相关。SMARCC1基因的下调能抑制脑胶质瘤细胞的增殖并促进凋亡,其机制可能与下调ki67和Bcl2的表达有关。
- 沈晓莹刘晶晶陈曲波亓垚陈明敏杨国翠金杰孟影何红梅袁鸽郜恒骏
- 关键词：脑胶质瘤细胞增殖细胞凋亡
- 牛磺胆酸钠诱导的急性坏死性胰腺炎大鼠基因表达谱变化被引量：2
- 2011年
- 基因芯片技术是高通量的差异基因表达研究手段。通过杂交后的生物信息学分析有助于全面了解复杂基因和信号转导通路在急性坏死性胰腺炎（ANP）中的作用。因此，利用全基因组表达谱方法分析ANP基因的变化较单个基因的研究具有理论上的优势。李磊等曾报道，腹腔注射雨蛙肽诱导的急性水肿性胰腺炎（AEP）基因表达谱的变化，但尚未见类似临床重症急性胰腺炎（SAP）的ANP模型的胰腺组织基因表达谱的报道。故本实验观察ANP大鼠胰腺组织基因表达谱的变化。
- 朱国英朱风尚黄东平沈晓莹宋振云郜恒骏
- 关键词：急性坏死性胰腺炎基因表达谱牛磺胆酸钠急性水肿性胰腺炎差异基因表达
- 肺栓塞患者血小板膜糖蛋白相关基因mRNA显著性差异表达的意义
- 2010年
- 目的:研究血小板膜糖蛋白在静脉血栓形成过程中的作用。方法:基因表达谱芯片检测肺栓塞(PTE)组与对照组血小板膜糖蛋白相关基因的mRNA表达水平及其差异。结果:PTE组血小板膜糖蛋白相关因子的mRNA表达与对照组显著差异(P<0.05)者只占所测基因的45.45%。结论:血小板膜糖蛋白相关因子mRNA表达的差异性提示在静脉血栓形成过程中,血小板仅发挥少部分功能,支持了临床大规模试验所述的不提倡单独应用抗血小板药物治疗和预防静脉血栓性疾病的结论。
- 王嫱王乐民龚朱郜恒骏沈晓莹
- 关键词：血小板膜糖蛋白基因MRNA肺动脉血栓栓塞症肺栓塞静脉血栓栓塞症
- PIWI蛋白在人类结肠癌组织中的表达及临床意义被引量：3
- 2011年
- 目的 分析PIWIL1、PIWIL3和PIWIL4三种蛋白在结肠癌组织和癌旁组织中的表达与临床意义.方法 选用106例结肠癌患者的癌组织和癌旁组织标本,分别制成62点和150点2份组织芯片,采用免疫组织化学方法检测结肠组织芯片中PIWIL1、PIWIL3和PIWIL4的表达.采用SPSS 17.0统计学软件,不同组织间PIWI蛋白表达差异采用配对t检验或配对Wilcoxon检验,相关性采用Pearson或Spearman等级相关分析.结果 PIWIL1、PIWIL3、PIWIL4在结肠癌组织中的表达均显著高于癌旁组织（P＜0.01）.PIWIL1、PIWIL3、PIWIL4在结肠癌和癌旁组织中的表达均呈现两两显著正相关（均P＜0.01）.癌组织PIWIL1在低分化组的表达显著高于高分化组（t=-2.840,P＜0.01）.癌组织PIWIL3表达随着临床分期的升级呈现显著升高（F=3.112,P＜0.05）.癌组织PIWIL3和PIWIL4在有远处转移组的表达显著高于无远处转移组（t=-3.349,P＜0.01;t=-2.168,P＜0.05）.癌组织PIWIL3和PIWIL4的表达均与结肠癌的发生显著相关（P值均＜0.01）.结论 PIWIL1、PIWIL3、PIWIL4在结肠癌组织中的表达与结肠癌的分化、临床分期、有无远处转移等临床指标显著相关,且PIWIL3和PIWIL4的表达是结肠癌发生的独立相关因素,有望进一步研究探讨其是否能作为结肠癌早期诊断的分子标志物及分子治疗靶点.
- 李娟沈晓莹朱诗樟王维陈锡美杨长青郜恒骏
- 关键词：结肠肿瘤果蝇属基因表达
- 基因芯片技术研究清胰汤对重症急性胰腺炎大鼠基因表达谱的影响被引量：6
- 2014年
- 目的研究清胰汤(Qingyi Decoction,QYD)对重症急性胰腺炎(severe acute pancreatitis,SAP)大鼠胰腺组织基因表达谱的影响。方法 60只SD大鼠按随机数字表法分为假手术组、SAP组和QYD组,每组20只。4%牛磺胆酸钠胰胆管逆行注射复制SAP模型,QYD组3次灌胃治疗(0.75 mL/100 g)。Illumina全基因组表达谱芯片分析胰腺表达谱变化,实时定量PCR和Western blot验证芯片部分基因热休克蛋白a8(heat shock proteins a8,Hspa8)、热休克蛋白b1(heat shock proteins b1,Hspb1)及其蛋白表达。结果与SAP组比较,QYD组筛选出575个差异基因,其中上调92个,下调483个。基因本体论(Gene Ontology,GO)分析涉及到转录调节因子活性负调节、氧化还原酶类活性、酶抑制剂活性等。京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)数据库分析其主要涉及丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)信号通路、NOD样受体(NOD like receptors,NLR)信号通路、细胞周期、代谢通路、氧化还原酶类活性等。PCR和Western blot验证芯片中Hspa8和Hspb1相对mRNA表达分别升高(13.24±1.22)倍和(7.55±1.09)倍(P<0.01)。结论 QYD有效治疗实验性SAP机制涉及到MAPK信号通路、NLR信号通路、细胞周期、代谢通路、氧化还原酶类活性等。
- 朱风尚朱国英黄东平沈晓莹杨长青郜恒骏
- 关键词：清胰汤基因表达谱聚合酶链式反应蛋白质印迹法
- 肺栓塞患者白细胞介素mRNA表达及Th1/Th2失衡的临床意义
- 吕炜王乐民段强林龚朱王嫱郜恒骏沈晓莹
- 重症急性胰腺炎大鼠胰腺全基因表达谱的变化
- 2013年
- 目的观察牛磺胆酸钠诱导的重症急性胰腺炎(severe acute pancreatitis,SAP)大鼠胰腺基因表达谱的变化。方法 40只SD大鼠随机分为假手术组和SAP模型组,每组20只。经胰胆管逆行注射4%牛磺胆酸钠复制SAP模型,假手术组注射生理盐水,造模48 h后处死动物。检测血清淀粉酶和C-反应蛋白(C-reactive protein,CRP)水平;H-E染色观察胰腺和肺组织病理变化;Illumiina大鼠全基因组表达谱基因芯片分析胰腺表达谱变化:实时反转录-多聚酶链反应(Real-Time reverse transcription PCR,RT-PCR)验证部分基因(F11r、Cdh1)。结果 SAP模型组血清淀粉酶、CRP明显高于假手术组[(7 892±1 776.0)vs(1 296±326.2)U·L^(-1),P<0.01:(106.5±19.9)vs(61.7±15.9)μg·ml^(-1),P<0.01)];Schmidt胰腺病理半定量积分法显示,SAP组胰腺坏死、出血、炎性细胞浸润、水肿指数等较假手术组明显(均P<0.01)。与假手术组相比,胰腺组织表达谱28个基因表达明显变化,其中下调5个,上调23个。基因功能分析显示其与细胞黏附分子通路、钙钾离子通道、促分裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)信号通路、脂肪酸代谢等密切相关。RT-PCR对涉及细胞黏附的F11 r、Cdh1基因的验证证实了芯片结果。结论牛磺胆酸钠诱导的SAP大鼠基因表达谱改变涉及到细胞黏附、钙钾离子通道、MAPK信号通路和脂肪酸代谢。
- 朱风尚朱国英黄东平沈晓莹杨长青郜恒骏
- 关键词：重症急性胰腺炎基因芯片表达谱
- 804例胰腺癌患者临床病理资料分析
- 目的 分析胰腺癌的临床病理学特征及其预后.方法 回顾性分析存储于生物芯片上海国家工程研究中心所属生物样本库2002年7月至2014年4月接受了手术治疗的804例胰腺癌患者临床病理资料,分析胰腺癌患者临床病理学特征与预后的...
- 何承志段本松周红梅陈红燕沈晓莹许树长杨长青陈锡美郜恒骏
- 生物样本库中2851例肝癌的临床分析
- 目的 探讨肝癌患者的临床特点及影响其预后的危险因素.方法 回顾性分析生物芯片上海国家工程研究中心所属生物样本库(生物银行)所存储的,在2001年9月至2014年4月接受了手术治疗的2 851例肝癌患者的临床表现并对其中4...
- 段本松何承志周红梅陈红燕沈晓莹许树长杨长青陈锡美郜恒骏
- 人结直肠癌微小核糖核酸的差异表达及其临床意义被引量：3
- 2010年
- 目的:研究人结直肠癌、腺瘤和癌旁正常组织中微小核糖核酸(microRNAs,miRNAs)的差异表达谱,并初步探讨其临床意义.方法:选取2008-01/07苏州大学附属第一医院和泰州市人民医院结直肠癌、对应癌旁正常组织以及结直肠腺瘤标本,提取组织总RNA,采用illumina microRNA芯片技术检测3种不同类型组织中miRNAs的表达,采用实时定量PCR技术对芯片检测结果进行验证.将结直肠癌组织中异常表达的miRNAs与结直肠癌患者的临床病理资料进行分析.结果:3种不同类型结直肠组织中miRNAs表达有明显差异,结直肠癌与癌旁正常组织相比,有65个miRNAs表达异常(P<0.001),其中35个上调,30个下调,而腺瘤与正常结直肠组织相比,有55个miRNAs表达差异(P<0.001),其中上调29个,下调26个.有25个miRNAs相对于正常组织同时在结直肠癌和腺瘤中异常表达,其中高表达12个,低表达有13个.与腺瘤相比,结直肠癌中有25个miRNAs表达异常(P<0.01),其中13个上调,12个下调.进一步定量PCR验证结果显示与正常结直肠黏膜组织相比,在癌组织中miR-552,miR-142-3p上调(2.97±2.72vs0.98±0.48;3.64±3.41vs1.31±0.61,均P<0.05),miR-139-3p和miR-133b下调(0.10±0.26vs0.82±0.70,0.81±0.67vs1.71±1.29,均P<0.05),与芯片结果相吻合.miR-552和miR-139-3p与结直肠癌患者年龄、性别、组织学、肿瘤大小和浸润深度无关(P>0.05),而miR-552与TNM分期、淋巴结和肝转移相关(P<0.05),miR-139-3p与TNM分期和肝转移相关(P<0.05),miR-142-3p除与组织学有关外,与其他临床病理参数无关,miR-133b与年龄相关,而与其他临床病理参数无关.结论:miRNAs参与了结直肠的癌变过程,特异的miRNAs的表达可能成为结直肠癌潜在的早期诊断和治疗新靶点.
- 陈卫昌林茂松黄俊星叶玉兰郜恒骏宋振云沈晓莹
- 关键词：结直肠癌微阵列
