李亦平
- 作品数：15 被引量：29H指数：4
- 供职机构：北京师范大学生命科学学院生物医学研究所更多>>
- 发文基金：国家重点实验室开放基金更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生农业科学自然科学总论更多>>
- 人类新基因WDR70的克隆及初步研究被引量：5
- 2005年
- 运用基于基因组数据库的特定基因同源新基因的克隆策略得到一个人类新基因WDR70 ,该基因编码一个包含 12个WD4 0结构域的蛋白。WDR70的cDNA序列长 2 2 6 6bp ,预测编码蛋白含 6 30个氨基酸 ,理论分子量为 70× 10 3 u ,染色体定位为 17p13.1。以小鼠胚胎为模型进行整体原位杂交 ,结果显示WDR70基因在 8.5d小鼠胚胎中没有表达 ,而在 9.5d和 10 .5d的小鼠胚胎的脑部有特异表达。由此推断该基因对胚胎期脑部的发育有重要的影响。
- 单宏爽郭丽丽慈宏亮李亦平
- 关键词：同源分析生物信息学整体原位杂交
- 小鼠脑特异表达基因Bsg4的克隆及表达
- 2004年
- 利用消减差异筛选的方法获得在小鼠头部特异表达的基因Bsg4 (BrainSpecificGene 4 ) ,基因全长 4 30 8bp .应用生物信息学方法分析基因结构 ,表明该基因定位于小鼠的第 3号染色体 ,包含 2 6个外显子 ,2 5个内含子 ,编码区长 36 39bp .用RT PCR方法扩增编码区 ,并构建到pBlue scriptSK( )载体上 ,然后采用原位杂交技术研究了Bsg4基因在小鼠胚胎发育中的表达情况 .以Bsg4基因编码区为探针的原位杂交结果显示Bsg4基因在小鼠胚胎头部和成年小鼠脑的海马中有特异表达 ,显示Bsg4基因与头部发育和海马的功能有密切关系 .对Bsg4基因的时间和空间表达模式的研究将有助于我们进一步深入地揭示它在脑发育中的作用 .
- 张晶王峦陈微薛鹏陈荣慈宏亮李亦平
- 关键词：成年小鼠特异表达基因编码区胎头脑发育小鼠胚胎
- 编码锌指蛋白的人类新基因TFL76的电子克隆被引量：8
- 2003年
- 目的 :根据基因同源同功原理电子克隆人类新基因。方法 :利用基于基因识别软件Genescan和EST拼接的同源基因克隆法得到人类新基因序列TFL76 ,再利用生物信息学数据库和软件对其进行功能的预测和分析。结果 :TFL76的cDNA序列长2 2 6 8bp ,开放阅读框编码 6 77个氨基酸残基 ,含 12个连续的C2 H2 型锌指基序 ,其分子量为 76kDa。编码区序列被 4个内含子分割。染色体定位于 19q13.4。此位点存在很多与胃癌、膀胱癌、乳腺癌等癌症相关的基因。TFL76的N末端含有多种蛋白激酶的磷酸化位点和核定位信号。结论 :TFL76可能是一个和癌症相关的核转录因子。
- 李慧李亦平慈宏亮
- 关键词：电子克隆锌指蛋白核转录因子
- 小鼠和鸡的类E1酶新基因UBAL的克隆和表达分析
- 2006年
- 根据含有UBA_NADbindingdomain的EST序列,利用同源性序列查找和EST拼接的方法,克隆得到鼠、鸡的新基因UBAL(ubiquitin-activatingenzymelikeprotein),它们都具有泛素活化酶Uba1的保守结构域Ⅰ,可能的ATP结合序列GVGGVG和Cys活性位点.用半定量RT-PCR分析11种成年小鼠组织的mUBAL表达量,显示mUBAL在成年小鼠多种组织中都有表达,在肾、睾丸、脑、心脏中尤为丰富.用mUBAL的编码区为探针进行的小鼠胚胎整体原位杂交显示,mUBAL在胚胎发育早期即开始表达,并随着前内脏内胚层(AVE)的向前迁移而迁移,随后在胚胎的端脑区特异性表达.与小鼠胚胎的表达谱相类似,gUBAL在HH14、HH16和HH18期鸡胚中的表达主要集中在头部.根据mUBAL和gUBAL的序列相似性保守结构域和活性位点,可以初步断定它们可能是类泛素活化酶E1的新成员,可能通过活化类泛素蛋白参与胚胎脑部的发育和调控成体组织的功能.
- 薛鹏慈宏亮陈微李亦平
- 关键词：克隆表达谱
- 小鼠胚胎脑特异表达的新基因bsg3的克隆及初步研究被引量：2
- 2004年
- 通过消减差异筛选的方法克隆到一个在小鼠胚胎脑特异表达的基因bsg3(brainspecificgene 3) .它编码的蛋白与人的KIAA0 96 1具有 80 .3%的同源性 .bsg3基因包含一个 16 4 4bp的完整阅读框 ,编码一个含 5 4 8个氨基酸 ,具有 1个KRAB结构域 (kruppel associatedbox)和 13个C2H2型锌指结构域的蛋白 .该基因定位在小鼠第 7号染色体上 ,包含 5个外显子 ,4个内含子 .以bsg3基因全长编码区为探针的原位杂交结果显示 ,bsg3在小鼠胚胎脑及鸡胚脑特异表达 .半定量反转录聚合酶链式反应 (RT PCR)的结果表明 ,在成体小鼠的组织中 ,bsg3基因脑中表达也较强 .这提示bsg3基因可能在小鼠脑发育中起着重要的作用 .
- 姚艺桑付佳琪陈微杨玮邹星李宁李亦平
- 关键词：小鼠
- 一个新的人类乙酰转移酶基因hNATL的克隆与表达谱研究
- 2006年
- 从小鼠cDNA序列入手,依据同源分析的电子克隆方法得到一个包含N末端乙酰转移酶结构域的人类新基因hNATL(Human NAT Like)。hNATL的cDNA长1803bp,编码区621bp,Genbank 登陆号AY632082。hNATL编码的蛋白长206个氨基酸残基,包含有N乙酰转移酶结构域。hNATL 基因定位于人染色体17q25．2区,包括6个外显子和5个内含子。基因表达汇编分析结果显示, hNATL在人脑和生殖腺中高表达。Northern杂交显示,在成年小鼠中hNATL在心脏,脾脏和卵巢中出现表达。整体原位杂交的结果显示,hNATL特异表达于E7．5和E8．5的小鼠胚胎脑部和HH10期鸡胚胎的头部。上述结果提示,hNATL对胚胎期脑的发育和成体中重要器官行使正常功能发挥十分重要的作用。
- 邹星慈宏亮陈微李亦平
- 关键词：胚胎发育整体原位杂交
- 人类新基因ACBP5cDNA的克隆及其同源物在小鼠/鸡胚发育过程中的表达被引量：6
- 2005年
- 利用电子克隆的方法寻找具有重要结构域的人类新基因ACBP5 ,根据得到的序列信息用RT PCR的方法获得全长基因 .通过生物信息学方法预测其结构 ,采用整体原位杂交和组织RT PCR的实验方法 ,在小鼠和鸡胚胎实验模型中研究该基因在发育过程中的表达情况 ,并对其功能进行初步的预测 ,获得一个含有乙酰辅酶A结合蛋白 (acyl CoAbindingprotein ,ACBP)结构域的人类新基因ACBP5 .ACBP5基因的cDNA长度为 10 83bp ,生物信息学方法预测其定位在人第 1号染色体上 ,包含 7个外显子 ,6个内含子 ,包含一个 35 4bp的完整阅读框架 ,编码一个 118个氨基酸残基的蛋白 .在以小鼠胚胎和鸡胚为模型的整体原位杂交中 ,以ACBP5基因全长编码区为探针的结果均显示该基因在胚胎头部特异表达 ,并且主要集中在中脑与间脑之间的峡部 .成体小鼠的组织RT PCR的结果显示 ,ACBP5的同源基因在各组织中均有表达 .这提示ACBP5基因在不同物种中的表达可能比较保守 ,并与头部发育有密切关系 ,同时也对维持细胞的正常功能起到重要的作用 .
- 王峦薛鹏程睿付佳琪陈微慈宏亮李亦平
- 关键词：生物信息学峡部
- 人类转录因子样新基因TFL76的初步研究被引量：2
- 2004年
- 运用基于基因组数据库特定基因同源基因的克隆策略得到人类新基因TFL76 ,它编码 12个C2 H2 型锌指基序 .其cDNA序列长 2 2 6 8bp,预测的编码蛋白含 6 77个氨基酸 ,分子量 (Mr)为 76× 10 3 .生物信息学分析表明 ,TFL76的N末端含有多种蛋白激酶的磷酸化位点和核定位信号 ,具有转录因子的特征 .染色体定位为 19q13.4 ,此位点存在很多与癌症相关的基因 .对 9.5d和 10 .5d的鼠胚进行全胚原位杂交 ,结果表明 ,此基因在前肢芽和后肢芽表达较高 .图 5表 1参
- 李慧邹星慈宏亮李亦平
- 关键词：同源基因转录因子
- 一个在小鼠头部特异表达的新基因BSG1 cDNA的克隆及研究被引量：2
- 2004年
- 目的 克隆小鼠头部发育过程中特异表达的新基因并对新基因可能的功能进行初步分析。 方法采用消减差异筛选的方法筛选小鼠头部特异表达的新基因 ,并用生物信息学的方法对克隆到的新基因进行序列分析和蛋白结构域的预测。同时 ,还采用了小鼠胚胎原位杂交、小鼠脑部切片的原位杂交以及鸡胚的原位杂交方法研究BS6 1基因的表达情况。 结果 克隆到 1个与小鼠头部发育相关的新基因BSG1(brainspecificgene 1) ,其GenBank的登录号为AY2 10 4 0 2。该基因包含 1个 2 133bp的完整阅读编码框 ,编码 1个 710aa的C2H2型锌指蛋白。它与人的KIAA0 4 4 1基因在氨基酸水平上有 82 8%的同源性。该基因定位在小鼠的第 10号染色体上 ,含 7个外显子 ,6个内含子。BSG1主要在小鼠胚胎、鸡胚的头部表达 ,并且BSG1在小鼠头部表达的部位局限在海马、齿状回和小脑。 结论 BSG1是 1个可能的转录因子 ,在脑部特异表达。对其研究有助于进一步揭示大脑发育的分子机理。
- 吴婷张晶慈宏亮陈微翟永功桑建利左明雪李亦平
- 关键词：小鼠特异表达新基因克隆锌指结构域
- 转人组织蛋白酶K基因小鼠的Southern杂交鉴定被引量：3
- 2005年
- 目的 用地高辛标记探针的方法进行Southern杂交 ,以检测转人组织蛋白酶K基因小鼠外源DNA的整合情况 ,筛选携带目的基因的阳性小鼠。方法 用地高辛标记探针的方法 ,对转人组织蛋白酶K基因小鼠 (F0代 )及首建阳性鼠与野生型ICR小鼠交配产生的F1代进行Southern杂交 ,对F0代和F1代进行筛选。结果 经显微注射法 ,共获得 2 5只转基因小鼠 ,通过Southern杂交鉴定 ,1只为阳性 ,阳性率为 4 % ;对PCR阳性的F1代小鼠 35只进行Southern杂交 ,结果全部为阳性。结论 外源基因 (人CathepsinK基因 )已整合到小鼠的染色体上 ,并且能够遗传。
- 祝梅香邹星沈洁王嫣徐凤郭金微张晶李亦平
- 关键词：小鼠SOUTHERN杂交组织蛋白酶地高辛标记探针外源DNA
