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徐潇: 作品数：42 被引量：113H指数：7; 供职机构：中国食品药品检定研究院更多>>; 发文基金：国家科技重大专项国家科技基础条件平台建设计划国家高技术研究发展计划更多>>; 相关领域：医药卫生轻工技术与工程生物学理学更多>>

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零售鸡肉中环丙沙星与头孢噻肟双耐药大肠杆菌的检测与遗传特征分析被引量：3: 2014年; 目的评估我国社区零售鸡肉中多重耐药大肠杆菌的污染危害。方法2011年4月至12月间,从陕西、广东、内蒙古采集新鲜整鸡样品207个,对环丙沙星与头孢噻肟双耐药大肠杆菌进行分离、遗传分型和药敏分析,并应用PCR扩增和测序方法对喹诺酮和三代头孢耐药机制进行分析。结果 35.7%(73/207)的零售整鸡样品中检出环丙沙星与头孢噻肟双耐药大肠杆菌,以系统发生A群为主(61.6%,45/73),所有菌株均为多重耐药株,优势耐药谱型为AMP-CAZ-CTX-CIP-CHL-SXTTET(n=34)和AMP-CAZ-CTX-CIP-CHL-GEN-SXT-TET(n=24),所有菌株的拓扑异构酶喹诺酮耐药决定区中均有点突变,多数菌株的突变数量为3个(n=56)或4个(n=12),从50个菌株中检出质粒介导喹诺酮耐药机制,包括oqxAB(n=48)、aac(6')-Ib-cr(n=5)、qnrS1(n=5)和qnrS2(n=3)。从72株大肠杆菌中共检出6个blaCTX-M型,其中blaCTX-M-55(n=62)为优势型。结论本研究检测的社区零售整鸡是环丙沙星与头孢噻肟双耐药大肠杆菌的重要储存库。; 林兰徐潇任秀崔生辉; 关键词：大肠杆菌环丙沙星头孢噻肟耐药

我国餐饮服务食品中致病菌污染及检验现状分析被引量：6: 2012年; 目的为餐饮食品致病菌检验工作提供参考。方法整理分析国内外相关法规和文献。结果与结论目前我国餐饮服务食品中致病菌检验能力尚无法满足监管需求,应进一步加强餐饮服务食品致病菌检验能力的建设,开展致病菌溯源预警平台的研究,切实保护人民群众饮食安全。; 徐潇甘辛崔生辉林兰; 关键词：餐饮服务食品食源性致病菌

食品检验用标准菌株分子水平质控方法的建立与应用被引量：4: 2018年; 目的建立食品检验用标准菌株分子水平质控方法,并进行应用。方法使用16S rRNA基因序列分析、脉冲场凝胶电泳(PFGE)、多位点序列分型等分子生物学技术手段,对食品安全国家标准中使用的标准菌株进行分子确认,并对不同的批号进行验证。结果 16S rRNA基因序列比对结果符合该菌株所在的菌属,并获得标准菌株16S rRNA基因标准序列,不同批号的标准菌株16S rRNA基因序列完全一致;确定了每株标准菌株的ST型和基因型,并对不同批号的菌株进行了基因型比较,未发现型别改变;对无PulseNet标准操作方法的菌株,开展方法学研究,获得了最适用的限制性内切酶和电泳参数,建立了标准菌株分子指纹图谱,比较不同批号菌株的PFGE图谱,相似性均为100%。结论本研究首次将分子生物学技术应用到标准菌株的质量控制,突破了使用传统质控方法的瓶颈,从分子水平实现对标准菌株稳定性的评价,保证了标准菌株在食品检验过程中的稳定性和一致性。; 徐潇石继春王春娥梁丽李康孙文媛陈翠萍叶强; 关键词：标准菌株脉冲场凝胶电泳多位点序列分型食品检验

零售猪肉中环丙沙星及头孢噻肟双耐药大肠杆菌特征分析被引量：1: 2014年; 目的对市场采集的零售猪肉样品进行环丙沙星与头孢噻肟双耐药大肠杆菌检测和耐药机制分析。方法从陕西汉中(n=81)和北京(n=37)采集新鲜零售猪肉样品,对环丙沙星与头孢噻肟双耐药大肠杆菌进行分离、药敏和耐药机制分析。结果 22.0%(26/118)的零售猪肉样品检出环丙沙星与头孢噻肟双耐药大肠杆菌,以系统发生A群为主(12株),优势耐药谱型为AMP-CAZ-CTX-CIP-CHL-GEN-SXT-TET(n=14)和AMP-CAZ-CTXCIP-CHL-SXT-TET(n=7),所有菌株的拓扑异构酶喹诺酮耐药决定区中均有点突变,从12个菌株中检出质粒介导喹诺酮耐药机制;从24株产超广谱β-内酰胺酶大肠杆菌中共检出4个blaCTX-M型,其中blaCTX-M-55(n=22)为优势型。结论社区零售猪肉是环丙沙星与头孢噻肟双耐药大肠杆菌的重要储存库,其中blaCTX-M-55为三代头孢耐药的主要机制。; 林兰徐潇任秀崔生辉; 关键词：大肠杆菌环丙沙星头孢噻肟耐药猪肉

铜绿假单胞菌核酸检测用试剂盒国家参考品的研究被引量：1: 2022年; 铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)为假单胞菌属的一种革兰氏阴性菌,也被称为绿脓杆菌。在自然界水、土壤与空气中均广泛存在[1]。铜绿假单胞菌污染常见于凉拌菜、熟肉制品、饮用水等食品领域。例如在水源水或成品水中检出铜绿假单胞菌,甚至多批次样品的检出率大于10%,为一种重要的水源和食源性致病菌[2-4]。因此在我国饮用天然矿泉水(GB 8537-2016)[5]和包装饮用水(GB 19298-2014)[6]的国家标准中均明确规定不得检出铜绿假单胞菌。此外,在2015年我国颁布的《化妆品安全技术规范》也要求化妆品中不得有铜绿假单胞菌检出[7]。铜绿假单胞菌作为医院内感染的主要病原菌之一,在机体免疫力低下时,例如术后和恶性肿瘤的患者容易感染本菌,且铜绿假单胞菌的耐药性强,在治疗时往往需要使用多种抗生素进行联合用药[8-9]。因此,快速而准确地鉴定出铜绿假单胞菌对保障食品安全和人民健康具有重要的意义。; 梁丽陈驰石继春王春娥龙新星刘茹凤黄洋李康徐潇李江姣徐颖华叶强; 关键词：铜绿假单胞菌国家参考品核酸检测饮用天然矿泉水凉拌菜熟肉制品

鼠伤寒沙门氏菌实验室诱导突变株对喹诺酮耐药机制的研究被引量：3: 2012年; 目的本研究旨在对鼠伤寒沙门氏菌LT2及其实验室诱导喹诺酮耐药株的耐药机制进行特征描述。方法使用浓度递增法进行实验室中鼠伤寒沙门氏菌LT2的环丙沙星耐药株的诱导,并通过!Red噬菌体重组系统和噬菌体P22构建缺失株,进行染色体介导的喹诺酮耐药机制研究。结果与结论实验室诱导获得喹诺酮耐药菌株LT2-4,经分析发现,其拓扑异构酶编码基因gyrA出现突变位点(S83F)。acrAB和tolC基因的缺失致使LT2-4对环丙沙星敏感,提示它们在喹诺酮耐药机制中发挥重要作用,并发现tolC在二者中可能占有主导地位。; 徐潇任秀张凤兰崔生辉; 关键词：鼠伤寒沙门氏菌喹诺酮耐药机制

多位点可变数量串联重复序列分析在细菌分子分型中的应用被引量：6: 2013年; 多位点可变数量串联重复序列分析(multiple-locus variable number tandem repeat analysis,MLVA)是通过基因组中可变数量串联重复序列(variable number tandem repeat,VNTR)的特征来实现分型的分子分型技术,其特征是简单、快速、通量高、分辨力强,目前已广泛用于多种细菌分子分型。本文就MLVA技术的原理、在细菌分子分型中的应用及与其他分型方法的比较进行综述。; 王晔茹徐潇崔生辉李凤琴; 关键词：分子分型细菌

金黄色葡萄球菌核酸检测试剂盒用国家参考品的研制被引量：2: 2021年; 目的研制金黄色葡萄球菌核酸检测试剂盒用国家参考品。方法将10株金黄色葡萄球菌和10株阴性对照代表性菌株分别在适宜条件下复苏培养,制备合适浓度的菌悬液,并加热灭活和分装。随机抽样不同候选参考品样品10支进行均匀性分析,并将样品分别置于2~8、25、37℃条件下保藏以及反复冻融,评价标准物质的稳定性。同时对候选参考品的准确性、特异性、重复性、最低检出限进行分析,并组织8家实验室进行协作标定。结果制备了由阳性、阴性、重复性和最低检出限样品组成的金黄色葡萄球菌核酸检测试剂盒用候选参考品。不同候选参考品不同样品间的Ct值的变异系数在1.23%~3.86%之间,表明制备候选参考品均匀性良好。同时证实P1~10阳性和最低检出限候选参考品样品在反复冻融及加速破坏条件下稳定性良好。应用3个不同厂家生产试剂盒进行重复性验证实验显示,样本的Ct值均小于5.0%,表明候选参考品的重复性良好。除P6阳性候选参考品样品不能被部分试剂盒检出,其余阳性参考品样品均能成功检测、最低检出限为1.0×10^(3)个/m L。协作标定结果进一步表明阳性、阴性、重复性和最低检出限候选参考品均符合国家参考品的各项要求。结论研制的金黄色葡萄球菌核酸检测试剂盒用国家参考品已获得批准,可用于金黄色葡萄球菌核酸检测试剂盒的质量控制和评价。; 陈驰梁丽王春娥石继春龙新星刘茹凤黄洋李康徐潇李江姣徐颖华叶强; 关键词：金黄色葡萄球菌核酸国家参考品均匀性稳定性

细菌悬液两种计数方法的比较被引量：10: 2016年; 目的比较平板点样法与传统平板涂布计数法,建立更为简便的细菌悬液中活菌浓度的检测方法。方法将3株A群溶血性链球菌制备成多份菌悬液,稀释成不同梯度,用调理吞噬实验中的平板点样技术和传统平板涂布法同时检测,比较两种方法计数结果,分析相关性和显著差异。结果不同菌株和稀释方法中平板点样法的结果均随菌液稀释梯度呈现出较好的梯度;两种方法计数结果呈高度相关(r=0.84);二者的t检验结果比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论相对平板涂布法,平板点样法计数更客观准确,检测范围更宽,操作更便捷,适用于菌液浓度的确定。; 杜慧竟石继春李江姣王春娥徐潇陈翠萍叶强

10株A族链球菌标准菌株全基因组序列分析: 2022年; 目的分析A族链球菌(GAS)不同标准菌株的基因组特征,为进一步探讨GAS致病性、耐药机制和分子进化规律提供参考依据。方法采用高通量测序技术对中国医学细菌保藏管理中心保藏的10株GAS标准菌株进行全基因组测序,分析菌株的M蛋白(emm)基因及多位点序列分型(MLST);采用velvet 1.2.03和glimmer 3.02等生物信息学软件对测序数据进行基因组装、基因预测及功能注释,并以此分析基因组中所含耐药基因、毒力基因及插入序列(IS)种类;应用Blast比对分析不同菌株基因组中的特定致热外毒素B基因和系列超抗原基因序列,通过比较基因组学分析拟合泛基因组和核心基因组积累曲线,筛选核心基因SNP,构建系统发育分子进化树。结果10株GAS标准菌株的染色体全基因组序列大小约为1.8 Mbp,在不同菌株基因组鉴定出1682~1849个基因;通过对基因组毒力基因注释分析发现,10株GAS标准菌株基因组中含有16~22种数量不等的毒力因子,其中部分是在GAS基因组保守存在的,包括细菌致病相关的层粘连蛋白基因(lmb)、致热外毒素B基因(speB)、纤维基因结合蛋白(Fbp);基因组耐药基因注释分析发现,每株GAS标准菌株仅携带1种耐药基因,除CMCC(B)32308菌株基因组携带抗大环内脂抗生素相关的lmrP基因外,在其他9株GAS基因组中均发现与氟喹诺酮抗性相关的patB耐药基因;10株GAS标准菌株中共含有IS1562、IS1239、ISSpy1、IS1548和ISSag5等5种IS元件,不同菌株之间IS种类略有差别;比较基因组学分析结果显示,随着GAS基因组测序数量的增加,泛基因组随之增加,而核心基因组则随着不同GAS菌株数量的增加而逐渐趋于稳定;本研究10株GAS标准菌株与已发表的S10394、SF370、A20、NZ131和s6180等5株GAS代表性菌株系统发育树进化分析结果显示,15株不同GAS菌株可分成4个进化分支,其中CMCC(B)32067和CMCC(B)32301分别形成2个独立进化分支,与其他GAS�; 王春娥石继春徐潇刘茹凤李康梁丽叶强徐颖华; 关键词：标准菌株全基因组序列分析

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