徐晋麟
- 作品数:22 被引量:184H指数:8
- 供职机构:上海交通大学生命科学技术学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家高技术研究发展计划国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域:生物学医药卫生农业科学更多>>
- 肿瘤中neu基因的过量表达及其抑制被引量:1
- 1998年
- neu基因编码一种和表皮生长因子受体同源的磷酸蛋白,具有酪氨酸激酶的活性.近年来在多种人类肿瘤中发现neu基因的扩增和(或)过量表达.一些蛋白质因子或化学药物可以在转录水平阻遏neu基因的过量表达或者降低其产物p185neu的酪氨酸激酶活性,抑制具有neu基因过量表达的癌细胞的转移和增殖.
- 龚海彪张惟杰徐晋麟
- 关键词:NEU基因肿瘤转移肿瘤细胞增殖
- 大规模蛋白质相互作用数据的分析与应用被引量:14
- 2005年
- 蛋白质相互作用在生命活动中起着重要的作用.目前已开发出几种实验和计算方法能够得到大规模蛋白质相互作用数据.但是,与传统的实验结果相比,蛋白质相互作用大规模数据中存在着比例较高的假阳性.为了能够充分利用这些数据,需要建立生物信息学方法对这些数据进行系统的评价,进而提高数据的可信度,并从中挖掘出有价值的生物信息.本文对目前蛋白质相互作用大规模数据的计算分析和应用进行了总结,包括蛋白质相互作用数据评估方法、与蛋白质其他信息的关系以及在生物学研究中的应用,并提出了开发分析和挖掘蛋白质相互作用数据工具的主要方向,以期有助于这些数据的研究和应用.
- 孙景春徐晋麟李亦学石铁流
- 关键词:蛋白质相互作用蛋白质功能预测生物途径大规模数据生物学研究生命活动
- 钩端螺旋体蛋白质相互作用网络预测与系统分析被引量:4
- 2006年
- 问号钩端螺旋体是一种致病菌,能够引起人畜共患病.该细菌全基因组序列测序的完成,为从全蛋白质组学的角度分析蛋白质相互作用网络提供了基础.本研究通过整合4种计算方法(基因融合法、基因邻居法、系统发生谱法和操纵子法)来预测钩端螺旋体赖株蛋白质相互作用网络.对运动和趋化系统、信号传导系统、脂多糖生物合成以及黏附、侵袭等有关蛋白质之间的相互作用进行了详细分析.除此以外,根据蛋白质的相互作用网络以及功能分类,预测了203个未知蛋白质可能的功能.这不仅为进一步研究钩端螺旋体赖株的致病机制提供了一个资料,也为在基因组范围内应用生物信息学方法研究微生物提供了一个实例.
- 孙景春徐晋麟曹建平刘琪郭晓奎石铁流李亦学
- 关键词:问号钩端螺旋体
- 大规模蛋白质功能预测方法的进展被引量:3
- 2005年
- 全基因组测序的快速发展在获得大量序列信息的同时也迫切需要获取功能信息,用生物信息学方法进行大规模蛋白质功能预测在这种需求中获得发展。这些预测方法从基于序列同源性发展到基于genomic -context获得功能相关蛋白质对。基于genomic- context的方法具体有基因融合、染色体邻近、相似系统发生谱等。由于各种方法的偏向性,最新的趋势是整合多种方法的数据,组成蛋白质相互作用网络,通过分析网络的结构进行蛋白质功能预测。
- 曾岚徐晋麟李亦学石铁流
- 关键词:网络
- 哺乳动物性别决定和性反转被引量:22
- 1998年
- 目前已知SRY仅是涉及性别决定过程的基因之一.近年来又发现和克隆了许多可能参与性腺分化与发育的基因,如副中肾抑制基因MIS,也称抗副中肾激素基因AMH;SRY相关基因SOX9编码甾类因子的基因SF1;X连锁的DAX基因;Wilm′s肿瘤抑制基因WT1;以及X连锁的剂量敏感基因DSS等,并新建立了性别决定的Z基因模型,DSS基因模型和Jimenez等的模型,较合理地解释了哺乳动物性别决定的分子机理和以前难以解释的各种奇特的性反转现象,使性别决定的研究取得了长足的进展,但仍有一些悬而未决的问题有待于进一步探索.
- 徐晋麟徐沫
- 关键词:性别决定性反转哺乳动物
- 香菇原生质体融合菌株培养条件的优化被引量:8
- 2000年
- 对融合子F2的培养条件进行了正交试验 ,着重对温度、培养基 pH、碳源种类和氮源浓度进行了优化。结果表明 ,35℃、pH6.0、可溶性淀粉、2 %(NH4 ) 2 SO4 为其最适培养条件。其最适 pH与两个亲本的基本相近 ,其最适生长温度接近虎皮 - 0 1亲本的生长温度 。
- 何志勇王镨徐晋麟张惟杰
- 关键词:正交试验香菇
- 内含子编码蛋白与内含子的转移被引量:4
- 1999年
- 具有自我剪接能力的Ⅰ型和Ⅱ型内含子有编码蛋白质的功能。Ⅰ型内含子编码成熟酶和核酸内切酶,后者参与Ⅰ型内含子的归巢。Ⅱ型内含子编码的蛋白质呈现成熟酶核酸内切酶和逆转录酶活性,三种活性都在Ⅱ型内含子归巢中起作用。除归巢外,Ⅰ型和Ⅱ型内含子的转移还表现为转位和丢失。内含子作为可转移遗传因子,可能在进化中有一定的意义。
- 张惟杰何志勇徐晋麟
- 关键词:编码蛋白核酸内切酶逆转录酶
- PCR-DGGE对长江河口八种野生鱼类肠道菌群多样性的比较研究被引量:43
- 2007年
- 目的分析长江河口捕获的8种野生鱼类的肠道菌群多样性的差异并观察这种差异与食性的联系。方法采用PCR-DGGE(denaturing gradient gel electrophoresis)技术,DGGE图谱用PCA(principal component analy-sis)方法进行分析。结果建立了长江口8种鱼野生条件下肠道菌群的DGGE指纹图谱,观察到它们在野生条件下的肠道菌群的差异。其中,营底栖生活的舌鰕虎鱼的肠道菌群和其他7种野生鱼有着明显的差异,其他7种鱼的肠道菌群多样性的差异与它们的食性差异相关。结论PCR-DGGE技术是一种能够快速有效地分析研究鱼类肠道菌群结构的技术。8种野生鱼的肠道菌群的结构有明显的差别。
- 李可俊管卫兵徐晋麟张延赵立平
- 关键词:鱼类肠道菌群RRNA
- 黑腹果蝇杂合体中ADH杂二聚体的形成
- 2002年
- 研究了醇脱氢酶基因 (Adh)诱变体与正常基因相互作用后的部分显性现象 .所有 8个由乙基亚硝基尿素 (ENU)和 1个 X-射线诱变体仅为单碱基置换体 ,其余 3个 X-射线诱变体则为 9~2 1个碱基的缺失体 .这 1 2个诱变体 (除 1个外 )都能产生可测的突变肽 ,其中 7个不能与正常肽形成二聚体 ,杂合体酶活性约为正常纯合体的 1 /2 ;另 4个形成二聚体 .形成二聚体突变基因产物中所有氨基酸突变均发生在肽链 1 82~ 1 94氨基酸区域 ,可见该区域对于二聚化不是必需的 。
- 童耕雷郑有丽徐晋麟李坤宝
- 关键词:果蝇蛋白质印迹基因表达
- 黄鳝性逆转过程中同工酶的分析研究 Ⅰ.雌雄个体不同组织的同工酶分析被引量:19
- 1994年
- 作者采用三种垂直板聚丙烯酰胺凝胶电泳对雌雄黄鳝6种组织的乳酸脱氢酶(LDH)、酯酶(EST)进行了研究。结果表明LDH同工酶谱为细带型,可分为3区8条带,其迁移率为A>B>C,其中C_4仅出现在心、脑和肌肉中。LDH在肝中表达甚微。EST同工酶显示3区7条带。黄鳝的同工酶有明显的组织特异性,在两性中的表达也存在一定的差异,这种差异EST比LDH明显;肝、肾和性腺比其它组织较明显。这两种同工酶在雌性中的表达均比在雄性中强。以上反映了差别的基因活性。本文还讨论了黄鳝同工酶的遗传基础,亚基的组成以及LDH迁移率和黄鳝演化地位的关系。
- 徐晋麟马飞徐沁
- 关键词:黄鳝性逆转乳酸脱氢酶同功酶