徐昌平
- 作品数:125 被引量:476H指数:12
- 供职机构:浙江省疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金:浙江省自然科学基金浙江省医药卫生科学研究基金国家科技重大专项更多>>
- 相关领域:医药卫生农业科学生物学更多>>
- 中国南方地区乙型流感流行株与疫苗株的HA1区氨基酸差异研究被引量:7
- 2011年
- 目的探讨1991—2007年中国南方地区乙型流感流行株与WHO疫苗推荐株在HA1区的氨基酸差异。方法收集近17年间中国南方地区乙型流感流行株与WHO疫苗推荐株的血凝素重链(HA1)区的氨基酸序列,用BioEdit生物软件进行比较,分析两者之间在HAl及其抗原决定簇位点的氨基酸差异。结果在这17年中,有近1/3的年份,中国南方地区流行株与疫苗株之间的谱系不符;而在谱系相同的状况下,WHO疫苗推荐株与前两年流行株的符合性较与当时流行株的符合性更好(P<0.05)。从系统进化树也可看出这一趋势。结论 WHO推荐的乙型流感疫苗株与中国南方地区乙型流感流行株之间,存在明显的滞后现象,中国应当推出适合于自己的流感疫苗株。
- 张冬艳冯燕茅海燕邹艳徐昌平卢亦愚
- 关键词:乙型流感疫苗株流行株
- 一种H5N1型禽流感病毒荧光扩增检测试剂盒及检测方法
- 本发明提供了一种H5N1型禽流感病毒荧光扩增检测试剂盒及及其利用试剂盒检测禽流感病毒的检测方法,试剂盒包括H5N1型禽流感病毒血凝素基因标准品、荧光扩增检测试剂以及DNA聚合酶与逆转录酶,荧光扩增检测试剂主要包括一步法R...
- 卢亦愚严菊英冯燕茅海燕徐昌平葛琼
- 文献传递
- 一种H5N1型禽流感病毒荧光扩增检测试剂盒及检测方法
- 本发明提供了一种H5N1型禽流感病毒荧光扩增检测试剂盒及及其利用试剂盒检测禽流感病毒的检测方法,试剂盒包括H5N1型禽流感病毒血凝素基因标准品、荧光扩增检测试剂以及DNA聚合酶与逆转录酶,荧光扩增检测试剂主要包括一步法R...
- 卢亦愚严菊英冯燕茅海燕徐昌平葛琼
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- 肠道病毒EV71核酸荧光定量RT-PCR检测试剂盒及检测方法
- 本发明提供了一种应用于手足口病感染实验室应急检测的肠道病毒EV71荧光RT-PCR检测试剂盒及检测方法。所述荧光定量RT-PCR检测试剂盒的引物和探针序列如下:EV 71 YG F1:5’-TGATTGAGACACGC/...
- 卢亦愚严菊英徐昌平冯燕陈寅
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- 禽流感H7N9病毒双重荧光RT-PCR检测试剂盒及检测方法
- 本发明提供了一种禽流感H7N9病毒双重荧光RT-PCR检测试剂盒,其特异性引物和探针如下:H7引物和探针:5’-GAAGAGGCAA TGCAAAATAGAATACA-3’,5’-CCGAAGCTAAACCAAAGTAT...
- 徐昌平冯燕卢亦愚陈寅
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- 登革2型病毒浙江分离株的鉴定与分子流行病学研究被引量:1
- 2006年
- 目的为了对2004年浙江省报告的输入性疑似登革热病例查明病因,从分子水平分析流行毒株的生物学特征,追踪传染源,为疾病的预防控制提供实验室依据。方法对疑似患者血清标本采用ELISA、IFA和荧光RT-PCR方法分别检测登革病毒IgMI、gG抗体和病毒核酸,并用C6/36和BHK-21细胞分离登革病毒。采用RT-PCR方法扩增病毒E基因和NS1基因后分别进行序列测定,并与不同国家和地区的登革热毒株进行同源性和进化树分析。结果从患者血清中检测到登革病毒IgM、IgG抗体和登革2型病毒核酸,并分离到登革2型病毒;浙江省登革2型病毒分离株(ZJ/01/04)与登革2型国际标准株Jamaica、国内Fujian/10/99株和Saudi/92株在E基因上氨基酸的同源性分别为97.1%、99.2%和99.6%,而与登革1、3、4型毒株相同区域氨基酸同源性分别为68.7%、66.9%和63.6%。基因进化树显示ZJ/01/04分离株与Saudi/92株亲缘关系最近,在进化树的同一分支上。结论从病原学、血清学和分子生物学特征上均证实该输入病例是由登革2型病毒引起,该毒株最有可能来源于沙特阿拉伯。
- 夏时畅严菊英卢亦愚翁景清茅海燕徐昌平
- 关键词:输入病例登革2型病毒E基因NS1基因
- 老鹳草素在制备抗新型冠状病毒药中的应用
- 本发明公开了一种老鹳草素在制备抗新型冠状病毒药中的应用。本发明首次将老鹳草素应用于治疗由新型冠状病毒引起的感染中,研究发现,老鹳草素能够有效抑制新型冠状病毒在细胞内的增殖,因此能够用于治疗由新型冠状病毒感染引起的肺炎疾病...
- 徐昌平冯燕高见葛琼卢亦愚吴卓颖张云怡
- 文献传递
- 浙江省1998-2005年甲3亚型流感病毒株HA1区和NA区基因特性分析被引量:4
- 2007年
- 目的分析近几年浙江省甲3亚型流行性感冒(流感)流行株血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)基因的特性、变异与流感流行的关系。方法选择浙江省1998—2005年流感流行期间分离的甲3亚型代表株25株,提取病毒RNA,扩增HA1和NA基因,进行序列测定,用BioEdit软件分析处理。结果浙江省近几年甲3亚型流感流行株在HA1区的核苷酸长度均为987 bp,编码329个氨基酸;在NA区的核苷酸长度为1362 bp,编码454个氨基酸。1998—2005年甲3亚型流感病毒HA1区与NA区的氨基酸同源性分别在90.9%~99.3%与95.2%~99.5%之间,HA1区的变异较NA区更大。这8年间在HA1区共发生了30个氨基酸的替代,其中14个氨基酸位点涉及HA1区的4个抗原决定簇;NA区发生了21个氨基酸替代,其中5个氨基酸位点涉及NA区的3个抗原决定簇。在1998与2002年无论是HA1区还是NA区,均产生了较大的变异,在氨基酸进化树上也形成了独立的分支。近年的甲3亚型毒株HA1区有11个糖基化位点,较早期毒株A/Aichi/2/68增加了5个,仅1998年至今的8年中就增加了3个。结论浙江省1998与2002年的二次较大规模的甲3亚型流感流行均与病毒的抗原性漂移有关。
- 卢亦愚严菊英茅海燕冯燕徐昌平周敏余蓓蓓
- 关键词:流行性感冒病毒甲3亚型基因特性
- 两种核酸检测法在副溶血性弧菌耐热直接溶血素和不耐热溶血毒素中的应用评估被引量:1
- 2016年
- 目的比较CPA-核酸试纸条法与荧光定量PCR法检测副溶血性弧菌(VP)的tlh种特异性基因和tdh毒力基因的灵敏度与特异性。方法采用CPA-核酸试纸条法和荧光定量PCR法同时对655株不同来源的VP菌株进行tlh、tdh基因检测。结果 CPA-核酸试纸条法与荧光定量PCR法检测结果相同,VP菌株的tlh基因检测阳性率均为100%(655/655)。两种方法对tdh基因的检测结果也完全一致,tdh基因临床株与海产品株阳性检测率均分别为95.8%(207/216)与2.27%(10/439)。CPA-核酸试纸条法对tlh、tdh基因检测具有高度特异性,灵敏度可达6.2×103cfu/ml菌液,从核酸制备至完成检测最快仅需1 h。结论 VP临床株与涉水产品分离株普遍携带tlh种特异性基因,而tdh毒力基因主要存在于临床标本而在涉水产品株极少存在,可采用敏感、特异的CPA-核酸试纸条法,做VP腹泻患者的床边诊断以及食物中毒事故现场的快速检测。
- 黄世旺徐昌平方叶珍李剑赵雪琴李琳
- 关键词:副溶血性弧菌TDH
- 浙江省2002-2010年急性出血性结膜炎暴发疫情病原体CA24v的全基因组序列分析被引量:3
- 2013年
- 目的分析2002--2010年浙江省急性出血性结膜炎(AHC)暴发疫情病原柯萨奇病毒A组24型变种(CA24v)流行株的全基因组序列与遗传特性。方法选取浙江省不同年份的CA24v流行株,采用RT-PCR扩增基因序列,并与国内外流行株进行全基因组及VPl、3C区序列比较分析。结果浙江省2002年和2010年CA24v全序列为7456~7458bp,编码含2214个氨基酸残基的多聚蛋白,2010年的Zhejiang/08/10较2002年的毒株在5’端非编码区的第97、119位各存在一个T碱基插入,Zhejiang/08/10与2002年以来的分离株各区段氨基酸同源性为94.7%~100.0%,与近60年来CA24流行代表株全序列中各区段氨基酸的平均差异率以2A区与3A区最大,分别达8.4%和7.3%,3D区最小,仅为1.9%。1987年与2002年以来的CA24v毒株在全序列上共存在38个和20个氨基酸的稳定变异。2002--2010年CA24v的组间遗传距离分析表明,3C区较VP1区更为稳定,CA24v的早年流行株Jamaica/10628/87在3D区上可能存在重组,而在近年流行株中未发现该现象。结论CA24v以时间序列为主逐年进化,地域间虽存在差异,但影响较小。自2002年起,由CA24v引起的AHc一直在浙江省本地散在流行。
- 李焕徐昌平严菊英卢亦愚金青青冯燕莫世华
- 关键词:急性出血性结膜炎全基因组序列分析