张楠
- 作品数:5 被引量:16H指数:1
- 供职机构:中国林业科学研究院更多>>
- 发文基金:中央级公益性科研院所基本科研业务费专项更多>>
- 相关领域:生物学环境科学与工程建筑科学农业科学更多>>
- 从狼毒大戟中克隆蓖麻烯合成酶基因
- 2012年
- 本研究采用RACE-PCR技术从狼毒大戟(Euphorbia fischeriana Steud.)根中克隆到一个蓖麻烯合成酶(casbene synthase)基因,命名为EfCS(GenBank登录号为:JN862821)。该基因长1969bp,编码602个氨基酸,具有典型的萜类合成酶的基因结构。对CS基因编码氨基酸序列进行生化特性分析发现其理论等电点为5.36,分子量为69.3648kD。通过疏水性分析,发现CS整体表现为亲水性。进行导肽分析结果发现其具有叶绿体导肽。二级结构预测表明,CS蛋白由α-螺旋、延伸链、β-转角和随意卷曲构成,它们分别占到64.95%、6.64%、3.16%和25.25%。另外,对CS蛋白质进行三级结构预测,发现蓖麻烯合成酶属Ⅰ类萜类合成酶。
- 刘洪伟唐其杨艳芳张楠邱德有
- 水文模型在湿地景观规划设计中的应用研究被引量:1
- 2023年
- 利用水文模型能概化复杂的水文现象与水文过程,输出可视化结果。水文模型的应用能够促进湿地景观规划设计由经验决断向客观可度量的循证设计转变,为景观规划设计提供科学的参考依据。文中阐述了湿地景观规划设计中模型应用的发展,对比MIKE21、WASP、EFDC、Delft3D和SWMM 5个可用于湿地景观规划设计的水文模型,概述各模型在景观规划设计领域的应用现状,提出基于临岸流速、水深分布、水质和流场模拟结果的湿地景观规划设计策略,总结水文模型在湿地景观规划设计中的研究前景和方向,可为湿地景观的设计与营造提供借鉴与指导。
- 张楠张楠张曼胤王大安王贺年刘魏魏胡宇坤
- 关键词:水文模型数值模拟湿地景观水体规划设计
- 银杏细胞转录组高通量测序及分析被引量:15
- 2013年
- 利用Illumina的Genome Analyzer IIx对银杏(Ginkgo Biloba)细胞转录组进行高通量测序,挖掘银杏内酯和紫杉醇生物合成基因,特别是新的羟基化酶基因,为今后最终完善红豆杉细胞紫杉醇生物合成途径中未知的羟基化步骤作准备。通过测序,获得了银杏细胞69 286个contig,56 387个scaffold,32 032个unigene。Unigene平均长度636bp。另外从gap分布、GC含量、基因组coverage等方面对unigene进行评估,数据显示测序质量好,可信度高。通过分析unigene的表达和功能注释等信息,发现66个属于CYP450基因家族,726个参与次生代谢物合成,其中59个与萜类合成有关,17个与二萜类合成相关。利用生物信息学方法从Michigan State University银杏成熟叶、侧根、成熟果实、无菌苗以及次生茎的转录组数据中找到了与银杏细胞CYP450高度同源的紫杉烷羟基化酶候选基因15个,为后续研究奠定了基础。
- 张楠孙桂玲戴均贵杨艳芳刘洪伟邱德有
- 关键词:GENOMEANALYZER转录组
- 狼毒不定根的诱导及组织培养的方法
- 本发明涉及一种狼毒(Euphorbia fischeriana)不定根的诱导及组织培养的方法,属于细胞工程技术领域。包括(1)种子的萌发:狼毒种子经HgCl<Sub>2</Sub>消毒后置于MS固体培养基上,于光照下萌发...
- 邱德有刘洪伟杨艳芳张楠
- 文献传递
- 紫杉烷9α-羟基化酶基因的克隆与功能分析
- 紫杉醇(Taxol)是一种著名的具有多种抗癌疗效的化合物,最早从红豆杉树皮中提取获得。寻找紫杉醇合成途径中的关键酶基因能为规模化生产紫杉烷类药物奠定理论基础,紫杉烷9α-羟基化酶就是关键酶中的一个,多年来该基因序列一直没...
- 张楠
- 关键词:酵母表达紫杉烷基因克隆