张志强
- 作品数：2 被引量：0H指数：0
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- 果蝇昼夜生理节律之细胞质PER-TIM间隔定时器的大聚合物模型
- 2012年
- 昼夜生理节律使得生物体的生理和行为能够适应外界环境的昼夜循环变化.实验发现在果蝇的细胞质中存在由PER-TIM复合体组成的间隔计时器.本文提出了这个间隔定时器的一种可能的数学模型.模型的特点是大聚合物,快速交换,不同磷酸化位点有不同功能.模拟结果基本与实验相符,符合PER-TIM间隔定时器的主要时间特征并重现了per^L变异细胞系中定时器的特点,以及PER和TIM蛋白进入细胞核的三种不同类型的过程.
- 张志强李丛鑫谢平王鹏业
- 利用磁镊研究促旋酶与DNA的结合
- 2012年
- 促旋酶(gyrase)在原核生物的生命活动中扮演着重要的角色,它是已知拓扑异构酶中,唯一能够向DNA引入负超螺旋的酶.本文中,我们利用磁镊(magnetic tweezers)对促旋酶和DNA的相互作用进行了单分子实时观测.实验发现,在不加入ATP时,促旋酶能够同时与两段DNA(G片段和T片段)结合,但这种结合较弱,施加0.7pN的外力就能逐渐破坏两者的结合;但加入高浓度的诺氟沙星后,促旋酶与DNA的结合明显增强,甚至能够抗衡5.9pN的外力.促旋酶还会影响超螺旋的几何尺度:不加入促旋酶时,DNA超螺旋的几何尺度由DNA所受拉力决定,而加入促旋酶后,超螺旋DNA几何尺度变小,并且主要由DNA与促旋酶的相互作用而不再是所受拉力所决定.而且促旋酶与正负超螺旋的结合能力不同,它更容易与正超螺旋结合.同时,发现促旋酶从DNA上解离的时间符合双指数分布.我们提出的模型能够很好地解释这个分布,并与他人提出的模型的结果进行了比较.
- 张志强刘玉如谢平李伟窦硕星王鹏业
- 关键词：DNA超螺旋单分子
