孙超 作品数:7 被引量:23 H指数:4 供职机构: 中国水产科学研究院黄海水产研究所 更多>> 发文基金: 国家科技基础条件平台建设计划 国家海洋公益性行业科研专项 国家自然科学基金 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 医药卫生 天文地球 更多>>
象山港南沙岛不同养殖模式沉积物微生物群落结构分析 被引量:3 2014年 通过构建16S rDNA克隆文库对象山港南沙岛不同养殖模式(贝类养殖、藻类养殖及网箱养殖)表层沉积物微生物多样性和群落结构特征进行了比较和分析,共获取136个OUT。其中,贝类养殖区、藻类养殖区和网箱养殖区OTU分别为58、48和57个。各站位OTU分布差异明显,表现出高度的多样性。基于16S rDNA序列的生物多样性和丰富度分析表明,网箱养殖区丰富度指数ACE为739,香浓指数H?为3.8,均为最高值,丰富度指数Chao为245,略低于于贝类养殖区。贝类养殖区丰富度指数Chao为303,在各养殖区中最高。藻类养殖区丰富度指数ACE为174、Chao为89,香浓指数H?为3.6,均为最低值。系统发育分析表明,南沙岛各养殖区的优势种群均为变形菌门(Proteobacteria),但是藻类养殖区微生物群落结构与其他养殖区域相比,16S rDNA克隆文库差异显著,其中根瘤菌属(Rhizobium)及其他光合细菌在藻类养殖区分布较多。网箱养殖区沉积物表层微生物群落中出现了与环境污染密切相关的菌群,如志贺氏菌属(Shigella)、埃希氏菌属(Escherichia)和ε-变形菌纲的微生物种群,揭示网箱养殖对底质沉积物环境的影响较大。 孙超 朱玲 毛玉泽 范艳君 周春娅 杨傲傲 朱伟 庄志猛关键词:网箱养殖 贝类养殖 藻类养殖 微生物群落结构 象山港 基于云服务的海量海岛遥感数据存储管理研究 随着对地观测技术手段的迅速发展,海洋遥感数据所需存储量也不断增加。与此同时,在海岛监视、海岛调查等领域遥感影像应用不断深入,涌现出各种计算密集型和数据密集型的应用,传统的遥感数据存储管理方法已难以达到预期要求。如何做到高... 孙超关键词:数据存储管理 云计算 高分辨率遥感影像 分布式文件系统 基于线粒体COI和16S rRNA基因研究3个地理群体黑龙江河蓝蛤的遗传多样性 被引量:4 2015年 采用通用引物对辽宁盘锦、辽宁大连、山东日照的3个地理群体黑龙江河蓝蛤(Potamocorbula amurensis)COI和16S r RNA序列进行扩增、测序分析,得到30条658bp的COI基因部分序列和27条450 bp的16S r RNA基因部分序列。其中COI和16S r RNA基因部分序列T、C、A、G和A+T的平均含量分别为45.4%和32.0%、13.5%和13.3%、20.7%和29.3%、20.4%和25.3%、66.1%和61.3%,AT含量高于GC含量,这与其他软体动物门动物的COI和16S r RNA的观测结果相近。COI和16S r RNA分别检测到了24个单倍型、43个核苷酸多态位点和9个单倍型、19个核苷酸多态性位点。AMOVA分析表明,3个群体间COI和16S r RNA部分基因总遗传分化系数分别为Fst=0.0090(P<0.001)和Fst=0.0674(P<0.001),群体内遗传分化远大于群体间、群体内存在较高的遗传分化。用NJ法构建分子进化树,3个地理群体的黑龙江河蓝蛤聚为一个族群,有少数个体和其他群体的个体聚在一起。 孙超 刘志鸿 杨爱国 周丽青 吴彪 严加坤 侯丫 董春光关键词:RRNA COI 遗传分化 光滑河蓝蛤3个野生群体线粒体COI基因遗传多样性研究 被引量:6 2013年 采用通用引物对东营、潍坊、日照的3个地理群体光滑河蓝蛤的COI序列进行扩增、测序分析,对光滑河蓝蛤3个野生群体线粒体COI基因遗传多样性进行了研究。结果表明:得到30条665 bp的COI基因部分序列。其中COI基因部分序列T、C、A、G、A+T的平均含量分别为46.2%、13.3%、21.7%、18.8%、67.9%,A+T含量高于G+C含量,这与其他软体动物门动物的COI基因的检测结果相符。COI检测到了18个单倍体型、31个核苷酸多态位点。3个群体间的遗传分化较小,用NJ法和UPGMA法构建系统发育进化树,3个地理群体的光滑河蓝蛤互相聚在一起,同一群体之间没有明显首先聚在一起的情况。 孙超 刘志鸿 杨爱国 周丽青 吴彪 严加坤 侯丫 董春光关键词:线粒体 COI 遗传分化 4种河蓝蛤线粒体COI和16S rRNA基因序列的种间遗传分析 被引量:8 2014年 对光滑河蓝蛤Potamocorbula laevis、黑龙江河蓝蛤P.amurensis、焦河蓝蛤P.ustulata、红肉河蓝蛤P.rubromuscula4个野生种共40个个体的线粒体COI和16SrRNA基因片段进行了扩增和测序,经过筛选和剪切,得到长度为650bp和450bp的片段。序列分析显示,序列的碱基组成中G+C含量较低,16SrRNA基因种间和种内的变异较低,COI基因片段种内和种间的变异较高。以沙海螂Mya arenaria为外群,用MEGA 4.0软件中的NJ法构建了系统进化树,通过遗传距离和系统进化树可以看出,4种河蓝蛤未能达到不同种之间显著的遗传分化。 孙超 刘志鸿 杨爱国 周丽青 吴彪 严加坤 侯丫 董春光关键词:RRNA COI 系统进化 河蓝蛤属贝类生物学性状及基于线粒体DNA的分子遗传学研究 河蓝蛤属(Potamocorbula)贝类在我国沿海分布广泛,目前关于河蓝蛤属贝类的分类、群体遗传学和分子遗传学研究较少,主要集中在营养成分和育种方面。本研究以我国几种主要的河蓝蛤属贝类为研究对象,探讨了两种壳色光滑河蓝... 孙超关键词:染色体核型 线粒体DNA 基因序列 文献传递 一种用于原位制备水生植物叶面附着生物膜装置和方法 本发明提供了一种用于原位制备水生植物叶面附着生物膜装置和方法,属于海洋大型植物实验装置领域,所述夹子包括上夹板、下夹板和连接机构,上夹板上有一盒状体、盒状体底部缺失,盒状体上端有一自由安装的盖子,盖子上设有一贯穿盖子的轴... 杜美荣 蒋增杰 迟永祥 蔺凡 徐筱琰 高亚平 房景辉 姜娓娓 孙超