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拟南芥中影响基因对胁迫响应模式的顺式元件的挖掘: 2011年; 启动子中关键元件的数量、碱基变化等影响着所调控基因的表达模式。本文基于TAIR数据库的基因组序列和表达谱数据,首先通过BLAST比对和表达模式相关性分析,在拟南芥基因组范围内获得一批启动子序列相似程度很高而下游基因表达模式相反的启动子对,进而借助于PLACE顺式元件库,运用PatSearch软件找到这些启动子对中所含顺式元件种类与数量,并通过Culster聚类,GeneDoc和ContigExpress软件分析,获得了15个能影响胁迫条件下基因表达模式的关键顺式元件,这一发现暗示了生物系统利用较少的调控元件构建稳健与复杂的转录调控系统的方式。; 王飞飞李勇吕德康朱延明才华纪巍柏锡; 关键词：启动子顺式元件

Os-miR1435基因对水稻的遗传转化及耐冷功能鉴定被引量：3: 2014年; MicroRNA(miRNA)在植物对各种逆境胁迫的反应中发挥重要的作用。本研究室在前期研究中,通过基因芯片技术构建了水稻冷胁迫miRNA基因表达谱,并筛选获得了冷胁迫诱导表达的miRNA基因2个——Os-miR1435和Os-miR535。本研究针对Os-miR1435基因,首先采用USERTM技术构建植物超量表达载体,采用农杆菌介导法侵染水稻愈伤组织,获得转基因水稻株系。通过对比野生型和转基因水稻植株的生长发育及农艺性状,发现Os-miR1435基因的超量表达降低了转基因水稻的结实率。通过对比野生型和转基因水稻在种子萌发期和幼苗期冷胁迫处理表型,表明Os-miR1435基因没有影响冷胁迫处理下水稻种子的萌发和幼苗生长。进一步采用psRNATarget软件预测了Os-miR1435的靶基因,通过Real-timePCR分析了靶基因在野生型和转基因植株中的表达量差异,并对靶基因进行了进化分析。本研究将为进一步深入研究Os-miR1435的生物学功能奠定重要的基础。; 孙明哲崔娜孙晓丽肖佳雷吕德康朱延明; 关键词：MIRNA 水稻冷胁迫转基因

水稻Os03g19020基因的克隆及亚细胞定位分析被引量：1: 2014年; Os03g19020基因是从水稻苗期冷害基因表达谱芯片中筛选到一个冷胁迫诱导表达的基因,Real-time PCR验证。结果表明,Os03g19020基因受冷诱导表达,响应迅速;氨基酸序列分析发现Os03g19020编码PHDfinger家族蛋白,具有典型的C4HC3保守结构域;同源性分析结果显示,03g19020与籼稻品种OsI_11202蛋白相似性达98%。将03g19020基因融合GFP基因,转化烟草原生质体细胞,结果表明,03g19020蛋白主要定位在细胞核内。; 柏锡贾蓓吕德康朱延明才华纪巍; 关键词：水稻亚细胞定位

野生大豆碱胁迫反应的研究被引量：28: 2009年; 从吉林省白城市盐碱地采集了野生大豆Glycine soja345份,用不同盐碱化程度的盐碱土从播种开始胁迫,随着盐碱胁迫程度增加,发芽率和株高逐渐降低,pH值为9.02可抑制50%野生大豆的萌发和生长。用浓度为0、50、75、150、300、500 mmol/L的NaHCO3胁迫3周龄幼苗,浓度为0、50 mmol/L时幼苗可以正常存活,浓度为75、150、300、500 mmol/L时幼苗分别于19、6.5、3、0.5 h左右开始萎蔫。筛选能够在pH值9.0的盐碱土中发芽、生长、开花、结实的野生大豆材料,选择其中发芽率和结实率均较高的9份材料,测定了叶绿素含量、相对电导率和丙二醛含量,编号为G07048、G07092和G07256的3份材料在胁迫前后3个指标差异不显著,具有较强的耐盐碱能力。; 葛瑛朱延明吕德康董婷婷王维世谭上进刘彩虹邹平; 关键词：野生大豆 NAHCO3 碱胁迫苏打盐碱土

生物信息学在植物miRNA研究中的应用被引量：7: 2009年; 植物miRNA的研究已经从小规模实验向大规模计算分析方向发展,生物信息学的应用成为当前植物miRNA研究的热点问题。本文回顾了最近几年生物信息学在植物miRNA研究中取得的最新进展,简要介绍了植物miRNA的形成及其作用方式,重点对植物miRNA的计算识别、靶基因预测、启动子分析方法进行了讨论,并对相关的数据库资源进行了总结,最后展望了该领域研究的发展方向,将为植物miRNA的计算研究提供理论指导。; 吕德康葛瑛柏锡李勇朱延明; 关键词：MICRORNA 生物信息学靶基因启动子

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吕德康