赵文文
- 作品数：3 被引量：6H指数：2
- 供职机构：上海理工大学医疗器械与食品学院生物系统热科学研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金上海市教育委员会重点学科基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 拟南芥Argonaute1/2/4/5序列分歧以及与特定miRNA的协同表达(英文)被引量：1
- 2015年
- Argonaute(Ago)是RNA诱导的基因沉默复合体(RISC)中的一个重要组成部分,在RNA沉默通路中结合小RNA发挥着关键的作用.本文对12个物种的85个Ago/Ago-like基因序列进行了系统发育进化分析.结果表明,植物Ago可被分为3大分支,且基因在物种产生分歧之前就已经发生了重复.3个分支之间高同义和非同义突变频率揭示了Ago蛋白家族功能的高度保守性.采用实时荧光定量PCR对拟南芥Ago1/2/4/5在不同发育阶段和胁迫条件下的表达情况进行了分析.结果显示,Ago1在拟南芥幼苗和成熟组织中表达显著;与23℃(最适温度)相比,16℃(亚适温度)条件下,Ago1表达量显著下调,Ago5表达量则显著上调;在脱水胁迫下,Ago5表达量下调,Ago4表达量上调.另外,根据5'端碱基类型不同,188 954个幼苗miRNAs和2 047 843个成熟组织miRNAs被分类.结果显示,5'端为U的miRNAs在植物中的含量最多,这与Ago1表达量最高是协同的;16℃条件下,5'端为C的miRNAs和Ago5表达协同上调.这些结果都表明,Ago蛋白及其偏好的miRNAs是协同表达的.
- 赵文文韩颖颖刘宝林王志翠
- 关键词：系统发育分析ARGONAUTE脱水胁迫
- CCND基因家族成员分子进化分析被引量：3
- 2014年
- 目的对细胞周期素（cyclinD）家族成员进行分子生物学进化及功能预测，为临床上检测骨质疏松提供更多分子生物学信息。方法对CCND基因家族成员包括CCND1、CCND2和CCND3序列进行分子进化分析，并在所有科属范围和人型总科范围内，计算了同源CCNDs之间的同义和非同义突变频率。结果CCND1和CCND2具有较高的序列相同性，而CCND3的非同义突变率较高，尤其在人型总科各属形成以后，平均每年的同义和非同义突变频率都高于CCND1和CCND2。结论CCND2与CCND1序列相同程度高．而CCND3在序列和进化速率上都显著不同，所以CCND2可以作为骨密度关联研究的候选基因。
- 赵文文朱婧颖韩颖颖
- 关键词：CCND1分子进化
- Argonaute蛋白与小RNA的作用机制被引量：3
- 2014年
- RNA干扰(RNA interference,RNAi)是在植物、动物、线虫、真菌以及昆虫等生物体中普遍存在的通过双链RNA(double-strand RNA,dsRNA)诱导的抑制同源基因表达的一种保守的调控机制.小分子RNA通过特异性地识别结合RNA诱导的沉默复合体(RNA-induced silencing complex,RISC)对目标mRNA的表达在转录和翻译水平进行抑制.作为RISC的重要组成成分,Argonaute蛋白(Ago)发挥了至关重要的作用.为了进一步阐明Ago蛋白在RNA干扰中对小分子RNA的作用机制,本文介绍了Ago蛋白的结构、分类及其在RNA干扰机制中的作用,并着重阐述了目前已知的植物Ago蛋白对小分子RNA的几种作用机制,以及目前研究发现的Ago蛋白的功能作用,从而更进一步证实Ago蛋白对小分子RNA的作用是一个复杂的过程.
- 赵文文韩颖颖
- 关键词：小RNARNA干扰
