赵建晴
- 作品数:3 被引量:16H指数:2
- 供职机构:生物芯片北京国家工程研究中心更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 大鼠激素性股骨头坏死脂代谢基因的作用通路被引量:2
- 2010年
- 目的了解脂代谢有关基因表达谱和通路的改变与激素性股骨头坏死发病的关系。方法采用脂多糖(12S 10μg/kg)与甲泼尼龙[20 mg/(kg·d)]连续4 d肌肉注射制作大鼠股骨头坏死动物模型,取模型组(M)和对照组(C)大鼠股骨头进行组织形态计量学分析;测定血清总胆固醇(TC)含量;采用微阵列技术,测定和分析2组大鼠股骨头基因表达。结果 (1)股骨头组织形态学检测显示模型组大鼠发生激素性股骨头坏死,与对照组比较空骨陷窝率明显升高(P<0.05);骨小梁体积、骨矿化速率、毛细血管面积均明显降低(P<0.01)。(2)模型组大鼠血清总胆固醇含量明显高于正常组(P<0.001)。(3)基因表达谱芯片检测结果显示,模型组有111个较对照组差异倍数大于2.0的表达基因。经MAS系统分析后发现有18个显著性变化的通路。(4)模型组大鼠6个与脂肪酸代谢通路(FAM)上调表达的关键基因、2个与脂肪酸在线粒体延长通路的基因(FAEM)、有3个与脂肪细胞分裂素信号通路上调表达的基因(ACK)。结论脂代谢有关基因的表达上调在大鼠激素性股骨头坏死发病机制中起重要作用。
- 陈燕平薛延黄克勤张亮赵建晴贾丙申周重光张万强郎凤平
- 关键词:激素性股骨头坏死微阵列技术通路脂代谢基因
- 利用miRNA芯片筛选大鼠颅脑创伤后皮层差异表达的miRNA被引量:3
- 2009年
- 目的筛选大鼠颅脑创伤后皮层差异表达的miRNA,为颅脑创伤治疗中的miRNA干预策略提供可供选择的目标miRNA。方法利用miRNA芯片检测伤后6h、24h、48h、72h组各2例创伤大脑皮层组织与2例正常对照的差异表达基因。并随机挑选差异表达基因做PCR验证。结果创伤后6h组共有136个miRNA表达,其中2倍以上差异表达上调的13个,2倍以上差异表达下调的14个;24h组共有118个miRNA表达,其中2倍以上差异表达上调的4个,2倍以上差异表达下调的23个;48h组共有149个miRNA表达,其中2倍以上差异表达上调的16个,2倍以上差异表达下调的11个;72h组共有203个miRNA表达,其中2倍以上差异表达上调的19个,2倍以上差异表达下调的5个。其中只有miR-21在4个伤后时间点上均高表达,分别为2.0215、2.0401、2.0702、2.7910。定量PCR验证结果提示芯片结果可信。结论创伤大脑皮层的差异表达miRNA在以往文献中鲜见报道,对其干预有望成为颅脑创伤基因治疗的新靶向。
- 雷平张建宁张亮赵建晴李耀华陈心杨新宇杨树源
- 关键词:MIRNA芯片颅脑创伤
- 乙型肝炎病毒基因组转染HepG2细胞的microRNA表达研究被引量:11
- 2007年
- 目的检测乙型肝炎病毒(HBV)全基因组转染对人肝母细胞瘤细胞系HepG2细胞中microRNA(miRNA)表达的影响,为进一步探讨肝细胞中HBV复制的分子生物学机制提供平台。方法分别提取HepG2.2.15细胞(转染HBV全基因组的HepG2细胞,实验组)和其亲本HepG2细胞(对照组)的总RNA并分离miRNA,采用含509条探针的哺乳动物miRNA表达谱芯片对两组之间差异表达的miRNA进行分析。用SAM软件针对差异miRNA筛选的标准为在两组之间荧光强度差异4倍以上,差异miRNA的整体假阳性率为0。选择其中2个miRNA,应用实时荧光定量RT-PCR方法对芯片结果进行验证。结果HepG2.2.15细胞与HepG2细胞间差异表达的miRNA共27个(占5.3%),其中7个表达上调,20个表达下调。miR-181d和miR-15a的实时荧光定量RT-PCR验证结果与芯片表达结果基本一致。结论肝细胞中存在着与HBV复制相关的miRNA,这些上调和下调表达的miRNAs可能参与了HBV在肝细胞中的复制。
- 刘妍张亮戴久增王琳赵建晴徐东平
- 关键词:肝炎病毒乙型微RNAS