林建成
- 作品数:9 被引量:23H指数:3
- 供职机构:上海交通大学更多>>
- 发文基金:上海市科学技术发展基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:生物学农业科学经济管理更多>>
- 数据库整合基础上的信号传导途径和代谢途径的动态重现与动态模拟
- 石铁流陈正军林建成俞晓晶刘琪袁海心陈名李亦
- 建立了拟南芥蛋白质相互作用的预测数据库;开发了新的整合蛋白质相互作用的预测方法的算法;开发了预测siRNA效率的方法。为相关研究提供信息。
- 关键词:
- 关键词:信号传导代谢途径
- 分子生物学——光辉十四年被引量:1
- 2003年
- 林建成骆建华徐晋磷
- 关键词:分子生物学
- 2株不同来源的新城疫病毒的F基因克隆和序列分析被引量:1
- 2003年
- 以1株从发病鸽中分离到的新城疫病毒(PNDV/99株)和1株从发病鹅中分离到的新城疫病毒(GNDV/00株)为研究对象,用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)对它们的F基因进行分段扩增、定向克隆到pUC119质粒载体,然后测定它们的核苷酸序列,并推导出相应的氨基酸序列。PNDV/99株和GNDV/00株的F基因全长1662bp,编码553个氨基酸,它们的裂解位点的氨基酸序列为112G-R-Q-G-R-L117,是NDV弱毒株特有的序列结构。序列分析结果表明,它们2株之间的核苷酸同源率高达99.28%,氨基酸同源率则为100%;它们与国内标准毒株F48E9的核苷酸同源率只有87.48%和87.36%,氨基酸的同源率都为91.68%;而它们与弱毒株LaSota的核苷酸同源率则为98.50%和98.74%,氨基酸同源率都为98.73%。
- 马帝谢建云邵伟娟林建成吴祖立高诚
- 关键词:新城疫病毒F基因克隆融合蛋白基因
- 一、预测蛋白质相互作用的生物信息学方法;二、在预测转录单位基础上的原核生物启动子预测
- 继多种生物基因组大规模测序完以后,蛋白质组又成为我们面临的另一个挑战,识别蛋白质相互作用既是蛋白质组的一个重要部分,也是现代生物学的一个重要目标,但识别的效率及准确性一直不理想.该文主要基于相互作用的保守性,即相互作用直...
- 林建成
- 关键词:蛋白质相互作用数据库启动子预测操纵子
- 文献传递
- 一种基于结构域的蛋白质功能分类预测新方法被引量:3
- 2004年
- 从已知的蛋白质序列数据出发,预测蛋白质的功能是生物信息学研究的一项重要任务.常见而有效的一种方法是将蛋白质按照其序列特征归并到不同的功能类中去.据此应用最大似然估计(MLE)算法,我们发展了一种以蛋白质结构域组成特征为基础的方法,对蛋白质进行功能分类.运用此方法及根据文献发展的另一种方法对酵母(Saccharomycescerevisiae)基因组进行了预测,并对2种方法进行了比较.结果表明,MLE方法预测明显优于另一种方法.MLE方法的特异性达到75.45%,敏感性达到40.26%,也说明结构域是蛋白质的一个重要特性,它与蛋白质的功能紧密相关.
- 俞晓晶林建成石铁流李亦学
- 关键词:蛋白质功能结构域敏感性蛋白质序列蛋白质结构生物信息学
- 一 预测蛋白质相互作用的生物信息学方法 二 原核生物启动子预测
- 林建成
- 关键词:蛋白质相互作用启动子预测操纵子PROTEIN-PROTEIN
- 1株猪副粘病毒的分子鉴定被引量:7
- 2003年
- 以1株从发病猪中分离到的副粘病毒(MP01株)为研究对象,用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)对它的F基因进行分段扩增、定向克隆到pUC119质粒载体,然后测定它们的核苷酸序列,并推导出相应的氨基酸序列。MP01株的F基因全长1662bp,编码553个氨基酸,它们的裂解位点的氨基酸序列为112G-K-Q-G-R-L117,是NDV弱毒株特有的序列结构。序列分析结果表明,它与国内标准毒株F48E9的核苷酸同源率为90%,氨基酸的同源率为93%;它与弱毒株LaSota的核苷酸同源率为91%,氨基酸同源率为94%。
- 马帝谢建云邵伟娟林建成吴祖立高诚
- 关键词:副粘病毒融合蛋白基因反转录-聚合酶链式反应
- 中央公积金--新加坡的社会保障计划
- 中央公积金是一项储蓄和保险兼备的社会保障计划.它主要以受薪阶层为对象,经过多年的发展后,它已构成新加坡社会保障计划的主要部分.中央公积金局于1955年成立,它的本意在于帮助工友储蓄,以供退体之用.所有新加坡公民或永久居民...
- 林建成
- 关键词:中央公积金养老保健家庭保障资产增值
- 文献传递