林丽
- 作品数：6 被引量：39H指数：3
- 供职机构：华中农业大学动物科学技术学院、动物医学院更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划国家杰出青年科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 利用5个多态蛋白(酶)位点分析6个地方猪品种的遗传结构被引量：7
- 2001年
- 利用 5个多态蛋白 (酶 )位点碱性磷酸酶 (Akp)、蛋白酶抑制物 1(PI 1)、后白蛋白 1(Po 1)、后白蛋白2 (Po 2 )和铜蓝蛋白 (Cp)分析了清平猪、阳新猪、南阳黑猪、南城黑猪、东乡花猪、杭猪 6个地方猪品种的遗传结构和遗传变异。 6个品种的平均杂合度大小依次为 :南阳黑猪 (0 .4 14 2 )、南城黑猪 (0 .30 5 7)、阳新猪 (0 .30 32 )、东乡花猪 (0 .2 6 0 6 )、杭猪 (0 .2 4 78)、清平猪 (0 .2 4 16 ) ,通过计算Nei(1978)标准遗传距离 ,用UPGMA进行聚类分析 ,6个品种聚成 2大类 :清平猪、南城黑猪、阳新猪、南阳黑猪聚成一大类 ;东乡花猪与杭猪聚成另一类。
- 林丽王志刚刘榜李拥军赵小丽杨述林樊斌李奎肖炜
- 关键词：蛋白多态性蛋白酶
- 猪MHC-Ⅱ类区DQA新等位基因及新突变位点的发现被引量：22
- 2003年
- 根据猪SLA DQA基因cDNA序列和人HLA DQA基因组序列设计引物 ,在猪中成功扩增了一个 731bp的片段 ,该片段包括猪SLA DQA基因的大部分第 2外显子、完整第 2内含子和少部分第 3外显子 ,通过克隆和PCR直接测序获得该片段的核苷酸序列。在家系中对第 2外显子的核苷酸序列和其编码的α1 结构域的氨基酸序列进行了分析 ,并与GenBank中所有的SLA DQA第 2外显子序列进行比较分析 ,发现有 4个新突变位点和两个新等位基因存在。新等位基因分别是DQA SLT 2 6和DQA TC 2 1 1。DQA SLT 2 6与单倍型c、d相比有 8个核苷酸的差异和 4个氨基酸的改变 :单倍型c、d在 6 0、6 5、81、93位的氨基酸分别是Val、Lys、Asp、Lys;而DQA SLT 2 6相应的氨基酸是Ala、Glu、Gly、Ile。DQA TC 2 1 1与单倍型c、d相比存在 1个氨基酸的改变 ,由单倍型c和d中 94位氨基酸His变为Tyr。
- 刘榜朱正茂余梅曹建华林丽熊统安朱猛进彭中镇李奎
- 关键词：DNA序列
- 中国部分地方鸡种MHC B-G基因第二外显子的遗传多态性被引量：3
- 2006年
- 根据鸡主要组织相容性复合体BG基因序列设计特异性引物,在9个中国地方鸡种和1个国外引进鸡种基因组中扩增了包括其第一内含子和第二外显子在内、长度为401bp的DNA片段。经PCRSSCP分型筛选后,对该片段的核苷酸序列进行克隆测序和直接PCR测序及比对分析,发现了31个MHCBG新等位基因;各等位基因主型所含有的亚型数及其在不同品种间的分布极不均衡。第二外显子核苷酸序列和其所编码的MHCBG抗原类IgV结构域氨基酸序列比较表明,在中国地方鸡种BG基因第二外显子的207bp序列中有37个多态性变异位点,其中简约性信息位点29个,单个位点的变异8个;等位基因间的遗传变异范围0.0013-0.1433;各变异位点的核苷酸变异指数0.206-1.462。该编码区核苷酸的异义替换率为9.26%±1.92%,高于同义替换率2.34%±0.90%。所估计的核苷酸转换数和颠换数随着遗传距离的增加而逐渐增加,当核苷酸转换数和颠换数达到平衡后,该片段核苷酸转换数的增加幅度逐渐高于颠换数。在其所编码的类IgV结构域氨基酸序列中,多态变异位点有22个,其中简约性信息位点6个,单变异位点16个;所估测的等电点为8.45,疏水性氨基酸占40.3%,亲水性氨基酸占29.9%;该序列具有明显的疏水性特点。等位基因间的系统发生分析表明,31个BG等位基因分为两个群,相同主型的等位基因首先聚类。
- 徐日福李奎陈国宏强巴央宗张玉波林丽樊斌刘榜
- 关键词：地方鸡种等位基因遗传多态性
- 猪五个基因的分离、辐射杂种板定位及其与经济性状的关联分析
- 分子生物学的诞生及其在猪育种中的应用,为猪遗传育种提供了新的契机.猪高密度基因图谱的建立、对基因的结构、功能以及基因与性状关系等的充分了解,是未来动物分子育种的主要依据.生物信息学的发展和大量公共数据库的共享,为分离、定...
- 林丽
- 关键词：新基因多态性表达谱
- 文献传递
- 藏鸡主要组织相容性复合体B-LBⅡ基因第二外显子序列遗传变异分析(英文)被引量：6
- 2005年
- 根据鸡主要组织相容性复合体B-LBⅡ基因序列设计特异性引物,在藏鸡基因组中扩增了一个包括其第二外显子和第二内含子在内长度为374 bp的片段,并通过克隆和PCR直接测序获得了该片段的核苷酸序列。发现了15个B-LBⅡ新等位基因。对18个B-LBⅡ等位基因核苷酸序列和其所编码的MHCB-LBⅡ分子β1结构域的氨基酸序列分析显示,第二外显子核苷酸序列遗传多态性异常丰富,存在着62个多态变异位点(共包括80个突变),其中41个为简约性多态位点;衡量该序列遗传多样性的π值为0.0718;反映其群体内遗传变异度的平均遗传距离为0.056±0.008,低于在5个外来品种所估算的平均遗传距离。该编码区核苷酸相对异义替换率(15.61±2.69%)显著高于其同义替换率(3.25±0.94%),进一步分析表明,基因重组和平衡选择机制可能是引起B-LBⅡ基因序列变异的主要因素。在β1结构域氨基酸序列中,存在11个同义替换和27个异义替换;在24个肽结合位点中有12个变异位点;与其他6个中国地方鸡品种和一个外来品种比较发现,有11个异义氨基酸替换仅出现在藏鸡群体中,并被认为与藏鸡的免疫特异性有关,可为鸡的抗病力研究提供分子依据。
- 徐日福李奎陈国宏强巴央宗张玉波林丽樊斌刘榜
- 关键词：主要组织相容性复合体等位基因结构域藏鸡
- 猪的Noggin基因DNA片段的分离与序列分析
- 根据人和鼠的Noggin基因DNA序列的高度保守区设计引物,用PCR方法从通城猪基因组中成功分离了一个266bp基因片段.将该DNA序列与GenBank的数据库进行序列同源性比较,初步鉴定为猪的Noggin基因.
- 杨金娥刘榜余梅樊斌熊统安林丽李奎
- 关键词：NOGGIN基因DNA序列基因片段
- 文献传递
