宋媛媛
- 作品数:38 被引量:285H指数:10
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- 发文基金:国家科技重大专项比尔和梅琳达·盖茨基金国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域:医药卫生农业科学生物学更多>>
- 单耐利福平结核分枝杆菌耐药分子机制研究被引量:6
- 2012年
- 目的探讨单耐利福平结核分枝杆菌中耐药相关基因突变以及药物外排泵两种不同耐药机制的功能。方法从国家结核病参比实验室2007—2008年全国耐药基线调查菌株库中挑选单耐利福平的菌株23株。采用直接测序法检测利福平耐药相关基因rpoB突变情况。提取rpoB无突变菌株的RNA后反转录并采用real-timePCR方法检测20个药物外排泵基因的表达量,对比菌株最低抑菌浓度(minimum inhibitory concentration,MIC)实验结果,筛选可能与利福平药物外排相关的基因,并选用大肠埃希菌为模式生物,构建表达载体,检测过表达目的外排泵的大肠埃希菌对利福平的耐药程度以验证。结果在23株单耐利福平的菌株中,有16株(69.6%)检测到rpoB突变,其中包括531位点突变9株,526位点突变6株及533位点突变1株。Ser531Leu、His526Asp表现为高浓度耐药,其MIC分别为192μg/ml和256μg/ml;而突变类型His526Gly、His526Leu、His526Arg和Leu533Pro表现为低浓度耐药,其MIC分别为0.75μg/ml、4μg/ml、2μg/ml和0.5μg/ml。在rpoB未突变菌株中,通过real-time PCR发现Rv2936、Rv0783和Rv0933的转录水平与MIC呈正相关。在对照组和转入pEASY-E1-Rv0933的大肠埃希菌中MIC均为8μg/ml,而转入pEASY-E1-Rv2936和pEASY-E1-Rv0783的大肠埃希菌的MIC均有不同程度的提高,分别为32μg/ml和16μg/ml。结论不同耐药突变类型导致的耐药程度不同,Rv2936和Rv0783可能是与利福平耐药相关的的药物外排泵基因。
- 逄宇李桂莲王玉峰宋媛媛李强欧喜超董海燕赵雁林
- 关键词:利福平
- SMIS检测分枝菌酸在分枝杆菌菌种鉴定中的作用被引量:8
- 2011年
- 目的 评估用SMIS检测分枝菌酸在分枝杆菌菌种鉴定中的作用。方法 收集北京市结核病胸部肿瘤研究所2007年1—12月的分枝杆菌118株,通过PNB培养基初筛,其中结核分枝杆菌复合群25株,非结核分枝杆菌93株。同时用测序方法和SMIS分析分枝菌酸方法鉴定118株分枝杆菌,以16SrDNA和16—23SrDNAITS测定作为菌种鉴定的标准,评估利用SMIS分离分枝菌酸鉴定分枝杆菌菌种的符合率及一致性;并验证以上两种方法鉴定结果分别与PNB初筛分结核分枝杆菌复合群和非结核分枝杆菌结果的符合率及一致性。结果 SMIS与测序鉴定分枝杆菌相比的符合率为92%(108/118),其中结核分枝杆菌复合群鉴定的符合率为95%(35/37),非结核分枝杆菌为90%(73/81),Kappa分析显示两种方法鉴定结果的一致性很好(Kappa=0.96)。回顾验证初筛结果显示,SMIS与PNB培养基方法鉴定结果符合率90%(106/118),一致性较好(Kappa=0.73);测序方法与PNB培养基方法鉴定结果符合率也为90%(106/118),一致性较好(Kappa=0.74),但有11株测序和分枝菌酸菌种鉴定方法结果相同的结核分枝杆菌复合群与PNB实验结果不一致。结论 利用分枝菌酸对临床分离的分枝杆菌进行菌种鉴定是一种快速、简便和准确的方法,对处置应急和突发公共卫生事件中的分枝杆菌菌种鉴定具有一定的参考价值,是分枝杆菌菌种多相鉴定策略的重要组成部分。
- 刘冠宋媛媛姜产路赵立平毕志强黄海荣赵雁林
- 关键词:分枝菌酸分枝杆菌属
- 荧光染色发光二极管荧光显微镜痰涂片镜检方法成本分析
- 2011年
- 目的对比分析萋尔-尼尔逊涂片镜检方法(简称"Z-N")与荧光染色发光二极管荧光显微镜(LED)涂片镜检2种方法的实验室成本。方法收集6个县(区)级结核实验室使用Z-N和LED进行痰涂片镜检的直接和间接投入,比较分析6个实验室分别使用2种方法进行3次涂片镜检的平均成本。两样本间均数差别显著性检验采用t检验,多样本间均数差别显著性检验采用F检验,P<0.05认为有统计学意义。结果 Z-N法和LED方法检测1份痰标本的成本分别为人民币(14.98±3.94)元和(13.27±4.83)元(t=5.084,P=0.001)。6个实验室采用Z-N法进行1个痰涂片镜检的成本范围为人民币9.44~17.82元,LED法进行1个痰涂片镜检的成本范围为人民币7.80~18.93元。结论 LED进行痰涂片镜检的成本比Z-N法低,从成本角度LED更值得推广。
- 夏辉欧喜超李强赵冰宋媛媛王胜芬赵雁林
- 关键词:成本及成本分析
- 结核性脑膜炎临床分离株表型耐药特点及其治疗效果研究被引量:4
- 2015年
- 目的 研究分析结核性脑膜炎(tuberculous meningitis, TBM)的致病菌对抗结核药的耐药特点及抗结核药对致病菌的治疗效果。 方法 500例疑似TBM患者脑脊液标本经MGIT(mycobacteria growth indicator tube)960液体培养出25株临床分离株,再用16S rRNA基因测序法进行菌种鉴定。继而对这25株结核分枝杆菌临床分离株分别进行14种抗结核药物的MGIT 960液体药敏试验和12种抗结核药物的传统比例法固体药敏试验、16种抗结核药物的最低抑菌浓度(MIC)测定。通过计算血药浓度峰值(Cmax)/MIC值的大小来判断药物对菌株杀菌率的高低,并由此推断药物对该致病菌的治疗效果。 结果 液体药敏试验结果和固体药敏试验结果均显示了任意耐药的TBM临床分离株有13株(13/25), 耐多药的TBM临床分离株有3株(3/25);利福平、莫西沙星、左氧氟沙星、氯法齐明、对氨基水杨酸的Cmax/MIC值分别为19.880、63.333、19.149、75.000、50.855。 结论 莫西沙星、氯法齐明、对氨基水杨酸、左氧氟沙星、利福平的Cmax/MIC值较高,提示临床上使用高剂量利福平和氟喹诺酮类药物联合治疗TBM可以提高疗效;对氨基水杨酸和氯法齐明对耐多药TBM临床分离株可能有较好效果。
- 王婷赵雁林逄宇冯国栋宋媛媛欧喜超彭晋湘赵钢战丽萍
- 关键词:结核表型微生物敏感性试验
- 中国疾病控制体系实验室第1轮结核杆菌药物敏感试验室间质量评估分析
- 2011年
- 目的评估中国疾病控制体系结核病实验室药物敏感性测试能力。方法国家结核病参比实验室下发30株结核杆菌至受评估的实验室,受评估实验室按照WHO推荐的罗氏培养基药物敏感性试验方法(比例法),进行药物敏感性试验,检测药物包括异烟肼(INH)、利福平(RFP)、链霉素(SM)、乙胺丁醇(EMB),并报告国家参比室,国家参比室将其结果与正确结果比对。结果4种药物的4个评估指标分别为,符合率:INH97%,RFP95%,SM89%,EMB93%;重复性:INH96%,RFP98%,SM86%,EMB94%;特异性:INH97%,RFP99%,SM89%,EMB96%:敏感性:INH97%,RFP65%,SM91%,EMB47%;各实验室4个评价指标均数比较,除敏感性差异有统计学意义外,其他4个检测值均高于85%,差异无统计学意义。结论除个别实验室在耐药检出能力上需提高外,其他参与实验室的药敏试验水平达到设定要求,1NH、RFP药物检测稳定,SM和EMB需要进一步标化。
- 姜广路尚美宋媛媛赵雁林
- 关键词:分枝杆菌结核微生物敏感性试验
- 基因芯片结核分枝杆菌耐多药检测在地市级实验室的应用性评估被引量:17
- 2013年
- 目的评估基因芯片耐多药检测利福平、异烟肼和耐多药肺结核(MDR-TB)的效能,探讨在地(市)级实验室应用基因芯片的可行性。方法对2011年1月1日至2012年3月31日在江苏省连云港市涂片阳性的745例患者痰标本进行基因芯片检查,去除传统培养和非结核分枝杆菌等原因的111例,以传统药敏为金标准,在634例患者中分析对利福平、异烟肼和MDR诊断的敏感度、特异度、阳性预测值和阴性预测值。结果评估结果表明基因芯片对于利福平检测的敏感度和特异度为84.4%(65/77)和97.7%(544/557);对于异烟肼的敏感度和特异度分别为80.9%(76/94)和97.4%(526/540);对于MDR的敏感度和特异度分别为70.0%(42/60)和98.3%(564/574)。基因芯片和传统药敏检测一例涂阳患者的成本分别为165.65元和374.07元。结论基因芯片检测方法是一种在中国基层实验室值得推广的更高效、快捷、安全,以及更符合成本-效益的耐药结核病诊断方法。
- 赵冰时金艳逄宇夏辉李强欧喜超宋媛媛王玉峰池俊英赵雁林
- 关键词:分枝杆菌寡核苷酸序列分析实验室
- 我国结核病耐药状况:2018年全国结核病耐药监测数据分析被引量:10
- 2022年
- 目的:分析我国2018年结核病耐药流行状况,为结核病治疗和防控政策的制定提供参考。方法:沿用2007—2008年全国结核病耐药性基线调查抽取的70个调查点作为监测点,以2018年新诊断的涂阳肺结核患者为研究对象,采用统一的信息表收集研究对象的社会人口学特征、病史和治疗用药史等信息;同时,在监测点采集可疑肺结核患者的痰标本并进行涂片和培养,阳性分离菌株送至省、市级疾病预防控制中心或结核病防治机构进行菌种鉴定和药物敏感性试验(简称“药敏试验”)。考虑复杂抽样设计和抽样权重,采用SAS 9.4 survey procedures相关程序计算加权耐药率,以logistic回归评估耐药率的变化。结果:3820例新涂阳和643例复治涂阳患者纳入本研究。新涂阳患者、复治涂阳患者的利福平耐药率分别为5.08%(95%CI:4.39%~5.77%)和23.31%(95%CI:20.14%~26.48%);新涂阳患者、复治涂阳患者的耐多药率分别为3.52%(95%CI:2.94%~4.11%)和18.01%(95%CI:15.36%~20.67%)。与基线调查相比,新涂阳患者[OR(95%CI)值为0.71(0.58~0.87);P<0.001]和复治涂阳患者[OR(95%CI)值为0.53(0.41~0.68);P<0.001]的利福平耐药率较基线显著下降;新涂阳患者[OR(95%CI)值为0.53(0.42~0.67);P<0.001]和复治涂阳患者[OR(95%CI)值为0.47(0.36~0.61);P<0.001]的耐多药率较基线也显著下降。估计2018年登记的病原学阳性肺结核患者中,新涂阳患者、复治涂阳患者利福平耐药例数分别为12662例(95%CI:10942~14382)和8156例(95%CI:7047~9265)。结论:2018年新涂阳和复治涂阳肺结核患者利福平耐药率、耐多药率较基线调查时均显著降低。但由于人口众多,我国耐药结核病总体负担仍然较重。建议采取综合措施以减少耐药结核病的产生和传播,进而降低我国耐药结核病总体负担。
- 王胜芬周杨欧喜超夏辉赵冰宋媛媛郑扬杜昕赵雁林
- 关键词:抗药性
- SMIS检测分枝菌酸在分枝杆菌菌种鉴定中的作用
- 2011年
- 目的评估用SMIS检测分枝菌酸在分枝杆菌菌种鉴定中的作用。方法收集北京市结核病胸部肿瘤研究所2007年1~12月的分枝杆菌118株,通过PNB培养基初筛,其中结核分枝杆菌复合群25株,非结核分枝杆菌93株。同时用测序方法和SMIS分析分枝菌酸方法鉴定118株分枝杆菌,以16SrDNA和16-23S rDNAITS测定作为菌种鉴定的标准,评估利用SMIS分离分枝菌酸鉴定分枝杆菌菌种的符合率及一致性;并验证以上两种方法鉴定结果分别与PNB初筛分结核分枝杆菌复合群和非结核分枝杆菌结果的符合率及一致性。结果SMIS与测序鉴定分枝杆菌相比的符合率为92%(108/118),其中结核分枝杆菌复合群鉴定的符合率为95%(35/37),非结核分枝杆菌为90%(73/81),Kappa分析显示两种方法鉴定结果的一致性很好(Kappa=0.96)。回顾验证初筛结果显示,SMIS与PNB培养基方法鉴定结果符合率90%(106/118),一致性较好(Kappa=0.73):测序方法与PNB培养基方法鉴定结果符合率也为90%(106/118),一致性较好(Kappa=0.74),但有11株测序和分枝菌酸菌种鉴定方法结果相同的结核分枝杆菌复合群与PNB实验结果不一致。结论利用分枝菌酸对临床分离的分枝杆菌进行菌种鉴定是一种快速、简便和准确的方法,对处置应急和突发公共卫生事件中的分枝杆菌菌种鉴定具有一定的参考价值,是分枝杆菌菌种多相鉴定策略的重要组成部分。
- 刘冠宋媛媛姜广路赵立平毕志强黄海荣赵雁林
- 关键词:分枝菌酸分枝杆菌属
- 2009-2013年全国抗结核药物敏感性试验熟练度测试结果分析
- 目的:评价和分析2009 2013年全国抗结核药物敏感性试验(简称'药敏试验')熟练度测试结果,了解中国结核病实验室药敏试验能力.
方法:2009-2013年对全国有能力开展药敏试验的省级、地市级结核病实验室每...
- 宋媛媛赵冰姜广路赵雁林
- 关键词:抗结核药物统计分析
- 文献传递
- 我国耐药结核病的危险因素——2007年全国结核病耐药基线调查资料分析被引量:83
- 2013年
- 目的探索新登记、复治患者发生耐药、耐多药结核病的危险因素。方法2007年4—12月中国进行了全国结核病耐药基线调查,调查覆盖全国31个省、自治区和直辖市,以省分层,采用多阶段整群抽样方法从全国结核病防治系统中随机抽取70个调查点,调查期间每个调查点纳入新登记涂阳新患者51例和复治患者17例。临床医师采用信息表收集患者的相关信息,通过当面询问患者填写治疗史信息,如有可能查阅患者医疗记录进行确认,治疗信息的准确性经另一位临床医师再次询问患者进行复核。采用比例法进行药敏试验,检测药物包括异烟肼、利福平、链霉素、乙胺丁醇、卡那霉素和氧氟沙星。结果多因素分析结果表明,对于新登记、治疗时间少于1个月(OR=1.6,95%CI=1.1~2.1)发生耐药结核病的风险较高;而女性(OR=1.4,95%CI=1.0~2.1)和进行过结核病药物治疗(OR=2.4,95%CI=1.5~3.7)是发生耐多药结核病的危险因素。对于复治患者,女性(OR=1.7,95%CI=1.1~2.7)、既往有过2次及以上治疗且最近1次在结核病专科医院治疗(OR=4.0,95%CI=1.2~14.0)发生耐药结核病的风险较高;而女性(OR=2.3,95%CI=1.5~3.6)、生活在实施DOTS较晚(2000年以后)的地区(OR=1.7,95%CI=1.2~2.4)、既往有过2次及以上治疗且最近1次在结核病专科医院外的其他医疗机构治疗(OR=3.3,95%CI=2.1~5.2)、既往有过2次及以上治疗且最近1次在结核病专科医院治疗(OR=13.0,95%CI=3.9~46.0)是产生耐多药结核病的危险因素。结论进行过结核病治疗的新登记产生耐药、耐多药结核病的风险较高;患者为女性、既往有过2次及以上的结核病治疗史是复治患者产生耐药、耐多药结核病的危险因素。
- 王胜芬赵冰宋媛媛周杨欧喜超李强夏辉逄宇端木宏谨傅瑜赵雁林
- 关键词:性别因素抽样研究