周长品
- 作品数：35 被引量：62H指数：5
- 供职机构：中国林业科学研究院热带林业研究所更多>>
- 发文基金：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项国家高技术研究发展计划广东省自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学经济管理生物学医药卫生更多>>
- 基于SSR标记的古茶树(Camellia sinensis)遗传关系分析被引量：3
- 2020年
- 本研究利用30个SSR标记,结合已有的128个茶树品种指纹,对福建省园岭林场的4株古茶树和1株铁观音进行了遗传关系分析。结果表明,30个SSR标记共产生了124个等位片段,每个标记的等位片段数1~9个;多态性信息量较高,平均为0.507。遗传聚类分析表明,铁观音品种‘Tieguanyin2’与Fujian组的‘Tieguanyin’、‘Jinmudan’、‘Mingke1’和‘Zimudan’等遗传距离较近,属于铁观音品种。4株古茶树(YL01,YL02,YL03和YL04)间遗传距离较近,属于Fujian组,推测为八仙茶古茶树品种。本研究的5株茶树与已知的128个茶树品种间没有直接的亲子关系。YL02、YL03和YL04聚类较近,不匹配位点数较少,可能来源于共同的亲本。DNA分子指纹检测表明,8对核心SSR标记可对所有参试茶树进行有效的鉴别,这为古茶树的品种鉴定和产权保护提供了有效的分子证据。
- 周长品甘四明李发根翁启杰张照远马锦林
- 关键词：SSR标记
- KingFisher Flex核酸纯化系统上树木叶片DNA的提取方法被引量：3
- 2017年
- 以桉树4种/杂种的叶片为材料,比较了5种磁珠试剂盒在King Fisher Flex核酸纯化系统上自动提取的DNA得率和纯度,初步选出了2种较好的试剂盒。比较了King Fisher Flex上不同的洗涤速度,最优为Medium。初选的2种试剂盒所提的DNA均可有效用于PCR扩增,表明DNA纯度均较好,确定得率最高的为最优试剂盒。对比手动的改良CTAB法(DNA得率19.0μg/g,OD_(260)/OD_(280)为1.97,OD_(260)/OD_(230)为2.03),本研究优化的方法可显著提高DNA得率(103.6μg/g)且DNA纯度相似(OD_(260)/OD_(280)为1.93,OD_(260)/OD_(230)为1.89)。优化的方法可有效用于马占相思、银中杨、降香黄檀、思茅松、马尾松和短枝木麻黄叶片的DNA提取。这对树木分子生物学研究的高通量DNA提取有重要的应用价值,对非木本植物的DNA提取和其他基于磁珠法的纯化系统亦可提供有益的方法参考。
- 杨合宇李发根翁启杰李梅陈升侃姬红霞周长品甘四明
- 关键词：DNA提取FLEX
- 一种基于荧光dUTP的自动检测SSR分子标记的方法
- 本发明提供了一种基于荧光dUTP的自动检测SSR分子标记的方法，包括以下步骤：(1)配制PCR反应体系：取1.0μL 10×buffer、dNTP 25～50μM、MgCl<Sub>2</Sub>2.0mM、前向引物0....
- 甘四明李发根翁启杰李梅周长品于晓丽
- 尾细桉生长和木材密度关联SNP挖掘与候选基因定位被引量：2
- 2021年
- 【目的】生长和木材基本密度是桉树的重要经济性状,挖掘其候选功能基因可为桉树遗传改良提供参考。【方法】以尾叶桉(Eucalyptus urophylla)和细叶桉(Eucalyptustereticornis) F1全同胞子代试验林为研究对象,测定其8年生树高、胸径和木材基本密度,开展表型遗传分析。筛选极端表型个体,利用测序分型(GBS)开发SNP标记进行关联分析。挖掘与树高、胸径和木材基本密度关联的SNP位点,并进行候选基因初步定位。【结果】尾细桉F1子代树高、胸径与木材基本密度间的表型变异系数为7.51%~26.19%,生长性状与木材基本密度显著正相关。利用GBS获得了覆盖全基因组的15 185个SNP位点,关联分析共鉴定111个与生长和木材基本密度显著关联的SNP,其中2号染色体上检测到强烈的生长性状关联信号。定位40个与生长和木材基本密度相关候选基因,共富集在52个GO terms,基因功能注释分析表明其功能主要与植物抗逆性、生物与非生物胁迫、转录因子家族等相关。【结论】本研究获得了一批与尾细桉生长和材性性状关联的SNP位点和候选基因,并进行了树高、胸径及木材基本密度候选基因初步定位,挖掘的与抗逆性相关的基因可能在树木的生长和木材形成中发挥重要作用。
- 朱显亮周长品贾翠蓉翁启杰李发根
- 关键词：测序分型表型性状候选基因
- 一种SNP组合及其在桉树无性系鉴定中的应用
- 本发明提供了一种SNP组合及其在桉树无性系鉴定中的应用，属于SNP标记技术领域。采用本发明提供的70个SNP标记组合极大提高对无性系检测准确度、缩短检测时间、提高检测水平，可有效应用于桉树无性系鉴定，快速甄别假冒和错乱的...
- 李发根周长品甘四明翁启杰何佳悦
- 文献传递
- 基于SSR标记构建宝巾花品种的分子指纹被引量：2
- 2019年
- 【目的】针对宝巾花(Bougainvillea)品种繁多、同物异名和同名异物多有发生的现象,利用可靠的分子标记技术进行品种的有效分类。【方法】基于15个简单重复序列(SSR)位点,利用荧光标记的引物对131个宝巾花品种进行PCR扩增,扩增产物经毛细管电泳检测,分析品种多样性和遗传距离,并构建品种聚类图和指纹图谱。【结果】15个SSR位点共扩增出85个等位基因,平均每个位点的等位片段数5.60个,Shannon’s信息指数、观测杂合度和期望杂合度的变化范围分别为0.38~1.53、0.11~0.94和0.16~0.73,平均值分别为1.04、0.50和0.57,位点的多态性信息量介于0.15~0.69之间,平均0.51。宝巾花品种的遗传距离为0.00~0.65,平均0.33;聚类分析表明,同一种的品种大多数聚在一类,但同一个种仍有品种未聚在一类或亚类,也有多个种的品种聚在一类;有多对品种存在同物异名或同名异物的现象;基于11个位点可有效鉴别131个品种,建立了各品种的分子指纹图谱。【结论】对同物异名或同名异物的品种,需要进一步确认品种中文名或拉丁名;基于SSR标记的宝巾花品种的指纹图谱为宝巾花品种登记、注册和知识产权保护提供了可靠技术,也为品种鉴定提供了有效手段。
- 孙利娜孙利娜周群周长品周长品徐世松杨舒婷杜铃甘四明
- 关键词：宝巾花SSR标记指纹图谱亲缘关系
- 大花序桉SSR位点多样性和群体结构分析被引量：3
- 2019年
- 为了获得大花序桉群体变异的可靠信息,本研究基于桉树29个基因组简单序列重复(SSR)标记,筛选了既不偏离哈温平衡、又非群体间分化系数(Fst)离群值的中性SSR用于大花序桉14个群体的遗传多样性和群体结构分析。基于11个中性SSR位点,群体的每位点等位片段数(Na)和特有等位片段数(Npa)平均分别为6.88和4.5,观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He)平均分别为0.749和0.780,证明群体多样性较高;固定化指数(F)平均为0.040,表明群体内近交水平极低。位点平均Fst为0.120,分子方差分析(AMOVA)中群体间变异只占总方差分量的3.1%,表明群体为中等到低的分化水平。主坐标分析、聚类分析和群体结构分析都将昆士兰州北部与中部群体(各7个)分为不同的亚群体。这为大花序桉种质资源保存和育种策略制定提供了理论的参考依据。
- 王莉王莉李昌荣李发根周长品翁启杰李梅陈健波陈健波项东云项东云
- 关键词：大花序桉SSR
- 一种基于荧光dUTP的自动检测SSR分子标记的方法
- 本发明提供了一种基于荧光dUTP的自动检测SSR分子标记的方法，包括以下步骤：(1)配制PCR反应体系：取1.0μL 10×buffer、dNTP 25～50μM、MgCl<Sub>2</Sub>2.0mM、前向引物0....
- 甘四明李发根翁启杰李梅周长品于晓丽
- 文献传递
- 一种SNP组合及其在桉树无性系鉴定中的应用
- 本发明提供了一种SNP组合及其在桉树无性系鉴定中的应用，属于SNP标记技术领域。采用本发明提供的70个SNP标记组合极大提高对无性系检测准确度、缩短检测时间、提高检测水平，可有效应用于桉树无性系鉴定，快速甄别假冒和错乱的...
- 李发根周长品甘四明翁启杰何佳悦
- 文献传递
- 尾叶桉×细叶桉多年生生长及其与材性相关的遗传分析被引量：1
- 2022年
- [目的]了解尾叶桉×细叶桉多年生生长的遗传规律,为大径材良种培育的早期选择年龄的确定提供可靠依据。[方法]对10株尾叶桉×10株细叶桉不完全析因交配产生的59个杂种组合13、16年生树高、胸径和材积采用混合线性模型估算母本、父本和母本×父本互作的方差分量,计算狭义遗传力,检测与早期生长及10年生材性性状间的表型相关和加性遗传相关,并基于遗传相关和主成分回归分析进行生长性状早期选择年龄的确定。[结果]尾细桉×细叶桉杂种组合13、16年生树高、胸径和材积均高于母本自由授粉家系,16年生时1个组合和47株单株的胸径达到≥28 cm的大径材标准;母本效应对2个年龄的树高、胸径和材积均显著,但父本效应仅对材积显著,母本×父本互作仅对13年生树高显著,表明母本对杂种生长的影响明显大于父本;2个年龄的树高、胸径和材积的狭义遗传力为0.17~0.23,均属中等偏低的水平;16年生树高、胸径和材积与之前年龄(0.5、1.5、2.5、4、7.5、10和13年生)的相应生长性状的表型相关和加性遗传相关均达0.01或0.001的显著水平(与1.5年生材积的相关除外),2.5年生开始加性遗传相关即较稳定。16年生与早期生长性状的回归分析显示:2.5年生能够分别解释16年生树高、胸径和材积变异的73.9%、71.9%和66.2%;13年生和16年生的生长与10年生木材基本密度均呈显著的正相关,而与木质素含量均呈显著的负相关(H_(16)除外)。[结论]尾叶桉×细叶桉13、16年生生长具有一定的杂种优势,可用于选育大径材良种;生长性状持续受母本效应的显著影响,父本效应对晚期材积亦影响显著,需要重视优良杂交母本和父本的选择;早晚期生长显著相关,早期选择可在2.5年生时进行;晚期生长与10年生木材基本密度和木质素含量分别呈显著的正和负相关,可进行间接选择。
- 邱妍翁启杰李梅陈升侃周长品李发根甘四明
- 关键词：遗传力材性性状
