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MOLMAP指数生成及其在化学反应分类和反应性预测中的应用: 2012年; 分子MOLMAP指数是通过递交一个分子中所有化学键描述符到Kohonen自组织映射,基于一个特定的算法所生成,其中Kohonen自组织映射已经预先由多种类型化学键所衍生的描述符进行了训练。化学键描述符由化学键的物理化学性质或(和)拓扑性质组成。MOLMAP指数是一个基于化学键类型的分子指数。若2个描述符相似的化学键激活同一个Kohonen自组织映射神经元,则2个化学键为同一类型。进一步,采用反应物与生成物的MOLMAP指数差异性描述化学反应,衍生了化学反应的MOLMAP指数。此指数能够在没有参与化学反应的化学键信息的情况下进行化学反应的相关研究,因而能够广泛地应用。本文从3个方面概述了MOLMAP指数的应用:1)在化学反应分类中的应用,例如:预测生物代谢反应分类;2)在化学反应性预测中的应用,化学反应性是指与化学反应有关的性质,例如:预测物质的变异性和抗氧化性;3)在三维数据处理中的应用,是基于MOLMAP指数算法进行的扩展,例如:预测氯酚类化合物的毒性。; 龙海林冯秀林索净洁张丹丹李静亚张庆友许禄

手性化合物表征及在手性醇催化拆分预测中的应用: 手性是自然界基本的属性之一,随着手性纯化合物需求量的增加,立体选择性地制备化合物变得越来越重要。手性选择性实验的成本很高,因而,本论文采用化学信息学技术,利用已有的实验数据建立结构-手性选择性相关模型,辅助单一异构体制备...; 索净洁; 关键词：手性化合物酮类化合物异构体; 文献传递

基于分子结构的光化学反应分类预测: 化学反应自动分类研究对于计算机辅助合成设计、反应数据库的评估和检索均非常重要。目前采用的化学反应分类方法要求预先识别参与化学反应的原子或化学键,因而应用的范围受到限制。本文在仅需要反应物和产物结构的情况下建立了化学反应分...; 冯秀林龙海林索净洁张丹丹李静亚张庆友; 关键词：RANDOM FORESTS

仲醇化合物的手性指数及其应用: 在特定催化剂条件下，主产物的绝对构型研究是不对称催化反应的关键问题之一。本文提出采用与手性中心直接键连的原子的类型，例如芳香原子，生成仲醇化合物的手性指数，并将手性指数应用于一个包含50 对手性仲醇对映体的数据集，该数据...; 李静亚赵谈封张丹丹索净洁张庆友许禄

化学计量学课程建设探讨被引量：2: 2013年; 化学计量学是分析化学专业研究生的一门必修课。化学计量学能够利用化学量测数据和提取有价值的化学信息,已经被广泛应用于多个化学领域,尤其是分析化学。由于化学计量学是应用数学,计算机科学和化学的交叉学科,故在教学中介绍了线性代数,MATLAB和图论的一些基础知识。此外还采用了多种教学手段,例如进行上机实践和举行学术报告会。; 张庆友索净洁周艳梅; 关键词：化学计量学分析化学研究生课程建设

脂肪酶催化不对称反应中伯醇产物的手性选择性预测: 近年来,纯手性化合物的需求日益提高[1],促进了手性合成技术的发展,其中一个学术和经济上最可取的方法是催化不对称合成。为了降低实验成本和提高实验效率,研究者们从理论上研究了化合物的结构与手性选择性之间的关系; 索净洁赵谈封冯秀林张庆友; 文献传递

基于MOLMAP指数的光化学反应分类预测被引量：1: 2012年; 由反应物和产物的结构衍生了反应物、产物和化学反应的MOLMAP指数,其中化合物的结构由化学键的物理化学性质和拓扑性质所表征.将前述MOLMAP指数应用于一个含七类光化学反应的数据集,通过随机森林建立了三种类型的模型:(1)预测反应物可能发生的反应类型;(2)预测可能合成产物的反应类型;(3)预测整个化学反应的类型.由于无需指定数据集中参与反应的化学键,所以,MOLMAP指数能够得到广泛的应用.所得分类预测结果好于我们此前对同一数据集的研究,表明改进化学键的描述有助于提高MOLMAP指数的预测能力.; 张庆友冯秀林龙海林索净洁张丹丹许力壮许禄

不对称反应的对映体过量值预测被引量：2: 2012年; 建立了手性催化剂结构与反应产物对映体过量值的定量结构-活性相关性模型,以辅助苯乙酮不对称氢转移反应的催化剂筛选.手性催化剂由手性氨醇配体与金属络合物合成,故采用构象独立手性指数或构象依赖手性指数描述手性氨醇配体,采用指示变量区分金属络合物,然后合并2个指数来描述手性催化剂.通过遗传算法进行变量选择,采用随机森林法建立数学模型以预测对映体过量值,测试集的相关系数R2=0.769,整个数据集的OOB(Out-of-bag)交叉验证结果为R2=0.785.; 张庆友张丹丹索净洁李静亚龙海林许禄; 关键词：对映体过量值手性催化剂

MOLMAP指数及其在变异性预测中的应用被引量：1: 2012年; 分子映射(MOLMAP)指数是以分子的化学键描述符为基础,通过Kohonen自组织映射依据一定的算法而衍生.化学键描述符是由化学键的物理化学性质,如两端原子的电荷差和拓扑性质,键连杂原子数量等所组成.本文将分子映射指数应用于4075个有机物质(Ames实验结果:2305个结构有诱变性,1770个结构无诱变性)的变异性预测.通过随机森林,分别采用三种类型的指数建立模型:(1)采用不同维数的分子映射指数;(2)采用全局分子描述符;(3)将分子映射指数与全局分子描述符相结合.整个数据集的集外(out-of-bag)交叉验证的正确预测率达到85.4%.为了检验模型的稳定性,采用所建模型预测源于另一数据库的472个化合物,正确预测率为86.7%,与此前的研究相比,两个预测结果均有所提高.; 张庆友龙海林冯秀林索净洁张丹丹李静亚许力壮许禄; 关键词：诱变性

手性指数在不对称反应催化剂虚拟筛选中的应用: 在医药化学和精细化工领域,对单一异构体分子的需求日益增长[1],由此化学家们对纯手性化合物的合成,尤其是不对称催化反应,产生了巨大的兴趣[2]。高通量筛选可以帮助化学家在一定的时间内进行更多的实验,从而更快地发现新的催化...; 张丹丹李静亚索净洁张庆友; 关键词：对映体过量值

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