朱孝轩
- 作品数：12 被引量：118H指数：6
- 供职机构：中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金长江学者和创新团队发展计划国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学更多>>
- 长春花萜类吲哚生物碱生物合成与调控研究被引量：17
- 2016年
- 长春花含有多种具有重要药理活性的萜类吲哚生物碱(TIA)。TIA的生物合成与调控及其合成生物学研究受到广泛关注。3α(S)-异胡豆苷是TIA生物合成的重要节点,由裂环马钱子苷和色胺缩合而成。前者通过环烯醚萜途径生成;后者通过吲哚途径生成。由3α(S)-异胡豆苷分别经过多步酶促反应生成文多灵和长春质碱,然后两者缩合生成α-3,4-脱水长春碱,进而生成长春碱和长春新碱。AP2/ERF和WRKY等多种转录因子参与了TIA合成的调控。长春花TIA生物合成途径的逐步解析为其合成生物学研究奠定了基础。目前已在酿酒酵母实现了3α(S)-异胡豆苷和文多灵等的异源合成。长春花TIA生物合成与调控的研究将为TIA类药物的生产和研发提供支撑。
- 匡雪君王彩霞邹丽秋朱孝轩孙超
- 关键词：萜类吲哚生物碱代谢调控合成生物学
- 基于全基因组和转录组分析的赤芝密码子使用偏好性比较研究被引量：14
- 2014年
- 密码子使用偏好性是物种在遗传信息传递过程中的一个重要特点,分析物种的密码子使用偏好性对于了解该物种遗传信息的传递规律具有重要意义。原有的密码子偏好性分析主要基于全基因组数据完成,然而由于目前可获得的高等生物全基因组数据有限,使得密码子偏好性分析受到了极大的限制。本研究通过分析赤芝[Ganoderma lucidum(Curtis:Fr.)P.Karst]全基因组及其液体培养菌丝、原基和子实体大规模转录组数据,发现基于全基因组和转录组数据分析获得的所有氨基酸的最优密码子完全一致。以上研究结果表明,利用大规模转录组数据代替基因组数据分析物种密码子使用偏好性具有可行性。通过计算26个赤芝萜类合酶(terpene synthase,TS)编码基因中大肠杆菌和酿酒酵母稀有密码子所占比例,发现酿酒酵母稀有密码子在赤芝TS基因中所占比例较高,而大肠杆菌稀有密码子所占比例相对较低,表明赤芝TS基因更难以在酿酒酵母中进行表达。参照酵母最优密码子,利用化学方法全合成TS基因将是解决外源基因与底盘系统密码子不匹配问题的有效手段。
- 朱孝轩朱英杰宋经元孙超陈士林
- 关键词：赤芝基因组转录组密码子偏好性
- 灵芝萜类合酶的克隆和表达
- 萜类是一类具有重要价值的次生代谢产物。随着一些重要的萜类化合物的发现,萜类的生物合成途径的研究受到极大关注。萜类合酶家族在催化这一庞大天然产物的生物合成中起着巨大的作用。萜类合酶主要催化单萜、倍半萜和二萜的生物合成,即分...
- 王丽芝孙超朱孝轩陈士林
- 关键词：灵芝GPP
- 文献传递
- 赤芝核基因密码子使用偏好性分析
- 赤芝(Ganoderma lucidum)是一种具有悠久药用历史的药用真菌，其主要活性成分灵芝三萜具有重要的药用价值，为了实现灵芝三萜的体外高效异源合成，就要首先了解赤芝的密码子使用特性，从而有针对性的提高关键酶基因在原...
- 朱英杰朱孝轩孙超陈士林
- 关键词：赤芝基因组转录组
- 现代生物技术在人参属药用植物研究中的应用
- 本文综述了DNA条形码等分子鉴定技术、一代和二代测序技术、基因克隆等现代生物技术在人参属药用植物的物种鉴定、转录组分析、次生代谢产物合成途径及关键酶功能鉴定等研究中的应用案例,表明现代生物技术为人参属药用植物的分子水平研...
- 陈士林朱孝轩陈晓辰牛云云张鑫宋经元罗红梅孙超
- 关键词：现代生物技术物种鉴定次生代谢产物
- 文献传递
- 三萜皂苷合成生物学元件的初步开发:三七鲨烯环氧酶编码基因克隆及表达模式分析被引量：31
- 2013年
- 中药合成生物学是将合成生物学思路引入中药天然产物次生代谢途径研究的一门新兴学科,其发展初期的首要任务是进行元件的开发与标准化,建立标准化的合成生物学元件库。三七(Panax notoginseng)作为人参属重要的药用植物,具有较高的药用价值,其主要活性成分是三萜皂苷。鲨烯环氧酶(squalene epoxidase)被认为是三萜皂苷与植物甾醇次生代谢途径中的关键限速酶,是三萜皂苷合成生物学研究的重要元件之一。本研究克隆获得三七中两种类型的鲨烯环氧酶编码基因(PnSE1、PnSE2),对其进行生物信息学分析,并通过实时荧光定量PCR(real-time PCR)方法检测其在4年生三七不同组织部位的表达模式,以及受茉莉酸甲酯(MeJA)诱导处理后基因的表达量变化,为实现中药合成生物学元件挖掘与开发奠定基础。PnSE1基因与PnSE2基因预测编码蛋白分别包含537和545个氨基酸,序列相似性为79%,但N端(前70个氨基酸)序列不保守。PnSE1基因在根、茎、叶、花中均有表达,以花中表达丰度最高;PnSE2基因只在花中表达量显著,其余组织较弱。PnSE1基因响应MeJA诱导,诱导24 h后在叶中的表达量最大;相同诱导条件下,PnSE2基因未响应诱导,表达水平无显著变化。结果表明,PnSE1和PnSE2基因具有不同的表达模式,在三七次生代谢产物合成中起不同催化作用,推测PnSE1基因参与三萜皂苷合成途径,PnSE2基因则在甾醇合成途径中起催化作用。
- 牛云云朱孝轩罗红梅孙超黄林芳陈士林
- 关键词：合成生物学三萜皂苷基因表达
- 现代生物技术在人参属药用植物研究中的应用
- 本文综述了DNA条形码等分子鉴定技术、一代和二代测序技术、基因克隆等现代生物技术在人参属药用植物的物种鉴定、转录组分析、次生代谢产物合成途径及关键酶功能鉴定等研究中的应用案例,表明现代生物技术为人参属药用植物的分子水平研...
- 陈士林朱孝轩陈晓辰牛云云张鑫宋经元罗红梅孙超
- 关键词：现代生物技术DNA条形码人参皂苷功能基因
- 文献传递
- 现代生物技术在人参属药用植物研究中的应用被引量：12
- 2013年
- 该文对DNA条形码等分子鉴定技术、一代和二代测序技术、基因克隆等现代生物技术在人参属药用植物的物种鉴定、转录组分析、次生代谢产物合成途径及关键酶功能鉴定研究中的应用进行综述。现代生物技术为人参属药用植物在分子水平的研究提供保证,揭示了人参属药用植物转录组及功能基因等遗传信息,加速了人参属药用植物基因组图谱绘制,为阐明人参属植物中重要次生代谢产物——人参皂苷合成的分子机制、实现体外合成重要天然产物以及对未来新药物的研发奠定基础。
- 陈士林朱孝轩陈晓辰牛云云张鑫宋经元罗红梅孙超
- 关键词：DNA条形码人参皂苷功能基因
- 赤芝核基因密码子使用偏好性分析
- 赤芝（Ganoderma lucidum）是一种具有悠久药用历史的药用真菌,其主要活性成分灵芝三萜具有重要的药用价值,为了实现灵芝三萜的体外高效异源合成,就要首先了解赤芝的密码子使用特性,从而有针对性的提高关键酶基因在原...
- 朱英杰朱孝轩孙超陈士林
- 关键词：赤芝基因组转录组
- 文献传递
- 现代生物技术在人参属药用植物研究中的应用
- 本文综述了DNA条形码等分子鉴定技术、一代和二代测序技术、基因克隆等现代生物技术在人参属药用植物的物种鉴定、转录组分析、次生代谢产物合成途径及关键酶功能鉴定等研究中的应用案例，表明现代生物技术为人参属药用植物的分子水平研...
- 陈士林朱孝轩陈晓辰牛云云张鑫宋经元罗红梅孙超
- 关键词：现代生物技术DNA条形码高通量测序功能基因
