曹清毅
- 作品数：7 被引量：33H指数：2
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- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 霍乱弧菌和副溶血弧菌分离株的gyrB基因系统发育分析被引量：19
- 2006年
- 依据gyrB基因部分编码序列构建系统发育树以分类和鉴别霍乱弧菌和副溶血弧菌,并探讨其种系发生关系。扩增并测序13株霍乱弧菌、8株副溶血弧菌、2株嗜水气单胞菌及1株类志贺邻单胞菌的gyrB基因(编码DNA促旋酶B亚单位)序列,并采用距离法与最大似然法构建系统发育树。两种方法所构建的树结构完全一致,霍乱弧菌、副溶血弧菌、嗜水气单胞菌及类志贺邻单胞菌各自形成一个独立的簇。其中,霍乱肠毒素基因(ctxA)阳性的霍乱弧菌(8株O139群与2株O1群ElTor型)聚类成一分枝;3株副溶血弧菌临床株(1株2002年流行株,2株2004年分离株)与1日本菌株及2001年1株自环境分离的毒力株聚类。系统发育分析靶分子gyrB基因可以良好区分上述4种常见病原菌。产毒O139群霍乱弧菌与产毒O1群ElTor型霍乱弧菌关系密切。副溶血弧菌环境毒力株与本地区临床主要流行株在系统发育关系上较为接近,可能是潜在的致病菌。
- 侯晓丽曹清毅潘劲草陈智
- 关键词：系统发育分析霍乱弧菌副溶血弧菌嗜水气单胞菌类志贺邻单胞菌
- 应用系统发育分析方法鉴别近缘病原菌
- 临床常见的感染性疾病涉及的病原菌范围广泛、种类繁多，快速准确地鉴定细菌对临床诊断与治疗有重要的指导作用。本文对应用系统发育分析方法鉴别近缘病原菌进行了研究。
- 曹清毅侯晓丽吴昊陈智
- 关键词：病原细菌菌株鉴定
- 文献传递
- 应用系统发育分析方法鉴别近缘病原菌
- 目的：以 gyrB 基因序列为基础,采用系统发育分析方法构建进化树,对种系间关系密切的病原菌进行区分鉴别。方法：测序获得本地区19株大肠埃希氏菌、13株志贺菌,2株豚鼠气单胞菌、2株嗜水气单胞菌、1株维隆气单胞菌的 gy...
- 曹清毅侯晓丽陈智
- 关键词：病原菌系统发育树BLAST
- 文献传递
- ConA诱导小鼠暴发型肝炎分子机制的生物信息学研究
- 目的：运用基因芯片及生物信息学技术，研究刀豆蛋白A(ConA)诱导的小鼠暴发型肝炎（暴肝）在病情发展早期的内在分子机制，寻找主导其进展的关键生物学过程或通路，同时探索MicroRNA(miRNA)在该过程中的调控作用，为...
- 曹清毅
- 关键词：刀豆蛋白A暴发型肝炎通路分析分子机制
- 文献传递
- 基于悬浮芯片技术的56种病原微生物的高通量检测被引量：13
- 2007年
- 目的:建立高通量、快速、可靠、经济的病原微生物诊断技术平台。方法:设计和合成针对56种常见病原微生物的探针和阳性对照,采用悬浮芯片技术,对56种病原微生物的阳性标准品进行检测。结果:56种标准品的检测值显著高于阴性对照,各病原微生物的阳性标准品和各探针之间无交叉反应。结论:建立了高通量、快速、可靠、经济的病原微生物诊断技术平台,为突发传染病的病原体诊断提供技术储备。
- 朱海红蒋汉梁陈智曹清毅孙箴侯晓丽周林福陈峰羊正纲贾红宇许晓燕
- 关键词：微生物学技术基因表达病原微生物
- 应用系统发育分析方法鉴别近缘病原菌被引量：2
- 2007年
- 目的:以gyrB基因序列为基础,采用系统发育分析方法构建进化树,对种系关系密切的病原菌进行区分鉴别。方法:测序获得本地区19株大肠埃希菌、13株志贺菌、2株豚鼠气单胞菌、2株嗜水气单胞菌、1株维隆气单胞菌的gyrB基因序列,并将其同公共数据库已有序列合并,构建进化树。分析各序列在树中的聚类关系,以此对菌株进行种水平分类鉴别,并同BLA ST查询结果相比较。结果:除鲍氏和痢疾志贺菌外,对检测的所有序列,在进化树上与之最邻近的5条序列均为该种菌株。而对一部分菌株,其BLA ST查询结果中含有其它菌种的或分类关系不明确的序列。结论:以系统发育方法对种系发生关系密切的病原菌序列进行鉴别,具有较好的分辨力和准确度。
- 曹清毅侯晓丽吴昊陈智
- 关键词：细菌基因系统发育树BLAST
- 应用系统发育分析方法鉴别近缘病原菌
- 临床常见的感染性疾病涉及的病原菌范围广泛、种类繁多,快速准确地鉴定细菌对临床诊断与治疗有重要的指导作用。常规的病原学诊断方法包括细菌培养、分离及生化反应鉴定,耗时久,一
- 曹清毅侯晓丽吴昊陈智
- 关键词：病原菌气单胞菌属志贺菌属数据库搜索标准菌株
- 文献传递
