徐进
- 作品数：41 被引量：325H指数：11
- 供职机构：国家食品安全风险评估中心更多>>
- 发文基金：北京市自然科学基金国家高技术研究发展计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生轻工技术与工程农业科学经济管理更多>>
- 乳酸菌细菌素的生物合成与应用被引量：18
- 2002年
- 乳酸菌产生的细菌素是一类具有抑菌活性的多肽或蛋白质物质 ,大部分细菌素只对近缘关系的细菌有抑制作用 ,少数细菌素的抑菌谱较广 ,对多种革兰氏阳性细菌有很强的抑制作用。细菌素可分为热稳定的小分子肽、热敏感的大分子蛋白和羊毛硫抗生素三类。本文综述了细菌素的理化性质 。
- 徐进冉陆罗雪云
- 关键词：乳酸菌细菌素生物合成
- 2013年夏季北京市售整鸡沙门菌分离株耐药性及耐药机制研究被引量：4
- 2017年
- 目的了解2013年夏季北京市售整鸡样品中分离的166株沙门菌耐药性及耐药机制。方法采用微量肉汤稀释法对166株沙门菌进行9类11种抗生素的耐药性检测,挑选头孢类耐药株进行超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)检测,并对环丙沙星和头孢噻肟双耐药株进行耐药机制分析。结果 94.6%(157/166)的沙门菌至少对一种抗生素耐药,多重耐药株占58.4%,对萘啶酸耐药率最高,为92.2%(153/166),其他依次为氨苄西林(48.8%)、氨苄西林-舒巴坦(44.0%)和四环素(44.0%)。共有27种耐药谱,常见的耐药谱为萘啶酸(n=46,29.3%)、萘啶酸-氨苄西林-氨苄西林/舒巴坦(n=28,17.8%)。47株头孢噻肟耐药株中有41株(87.2%)ESBLs阳性,其中有38株同时对环丙沙星耐药。这38株环丙沙星和头孢噻肟双耐药且ESBLs阳性的沙门菌中存在喹诺酮耐药决定区(QRDRs)、质粒介导喹诺酮耐药(PMQR)和ESBLs等耐药机制,37株测试菌株的GyrA的第83位、87位氨基酸和ParC的57位、80位氨基酸存在不同程度突变。38株测试菌株均检测到不同种类和数量的PMQR基因,如qnrB、qnrS、oqxAB和aac(6’)-Ib-cr等,部分基因存在突变。主要存在的β-内酰胺酶类型为CTX-M型(35株)、TEM型(20株)和OXA型(36株),未检测到SHV型和AmpC型。结论北京市售整鸡中沙门菌整体耐药水平较严重,需强化对肉鸡养殖、屠宰、运输、销售等环节中沙门菌耐药性监测,分析耐药机理及传递机制,同时注意临床感染治疗用药监管。
- 胡豫杰赫英英白瑶李凤琴徐进
- 关键词：沙门菌耐药性耐药机制
- 全自动测序仪PCR产物测序影响因素研究被引量：2
- 2015年
- 目的对影响ABI3500xl全自动测序仪测序过程的因素进行研究,以提高测序的准确度和成功率并降低成本。方法对PCR反应体系、产物纯化方法进行优化。将Big Dye分别稀释8、16和32倍进行测序PCR反应,比较不同的Big Dye稀释倍数对PCR产物测序结果的影响;使用CENTRI-SEP柱纯化法、Big Dye Cleaning Beads磁珠法和乙醇乙酸钠EDTA法对测序PCR产物进行纯化,比较不同纯化方法对测序结果的影响。结果 Big Dye稀释8倍和16倍时,PCR反应体系的测序结果正常,而稀释32倍时测序结果出现碱基误读;3种不同的测序PCR产物纯化方法均可得到满意的测序结果。相比之下,CENTRI-SEP Kit纯化方法所需时间最短(0.5 h),但是成本较高;乙醇乙酸钠EDTA纯化方法成本最低,但耗时较长(2 h);磁珠纯化法所需时间(1 h)和成本介于CENTRI-SEP Kit法和乙醇乙酸钠EDTA法之间,但不适于高通量操作。结论 ABI3500xl全自动测序仪测序过程中,Big Dye稀释16倍时所得测序结果准确且成本较低;3种测序PCR产物纯化方法均可得到准确的测序结果 ,实际工作中应根据操作者具备的实验条件选择最适纯化方法 ,以减少测序时间和成本。
- 闫韶飞王伟徐进白莉甘辛李凤琴
- 关键词：DNA测序
- 北京地区牛、羊肉片中鸭、鸡、猪源性成分调查被引量：26
- 2014年
- 目的建立生肉制品中鸭、鸡、猪源性成分的荧光PCR检测方法,对北京地区出售的牛、羊肉片进行成分调查。方法合成检测鸭、鸡、猪源性成分的特异性引物和探针,建立实时荧光PCR检测方法,测定方法的特异性、灵敏度,在北京部分超市、农贸市场、餐馆采集牛、羊肉片进行成分调查。结果所建立的实时荧光PCR方法对鸭、鸡、猪源性成分具有较好特异性,与常见食用肉类DNA在Ct 30以内无交叉反应;对混合肉中鸭、鸡、猪成分DNA的检出限是0.1%。北京市场上采集的86份牛、羊肉片中,30份检出上述成分,占34.9%;羊肉片的掺假率高于牛肉片;农贸市场采集样品掺假率明显高于超市和餐馆。结论所建生肉制品中鸭、鸡、猪源性成分的检测方法简单、特异,对样品的检测结果显示,北京市售牛、羊肉中存在掺入鸭、鸡、猪肉的现象。
- 李楠王佳慧沈青李凤琴徐进江涛
- 关键词：实时荧光PCR牛肉片
- 肉鸡养殖场中环丙沙星和头孢噻肟双重耐药沙门菌耐药机制的研究被引量：21
- 2015年
- 目的阐明养殖场肉鸡及其环境中环丙沙星和头孢噻肟耐药沙门菌的分布和耐药机制特点。方法对河南省4个不同地区肉鸡养殖场及环境中分离的沙门菌进行环丙沙星和头孢噻肟双重耐药菌株的筛选和鉴定,并对分离株进行药敏试验、喹诺酮类和超广谱β内酰胺酶耐药机制研究。结果从52株养殖场肉鸡肛拭子及环境中筛选出5株耐环丙沙星和头孢噻肟的沙门菌,均为印第安纳沙门菌,有AMP-CAZ-CHL-CIP-CTX-GEN(n=1)和AMP-CAZ-CHL-CIP-CTX-GEN-SXT-TET(n=4)两种耐药谱。喹诺酮耐药机制研究显示,5株菌的拓扑异构酶编码基因gyr A和par C均有点突变出现,均携带了质粒介导的喹诺酮耐药基因,包括oqx AB、aac(6')-Ib-cr基因,而qnr A、qnr B、qnr S、qnr C、qnr D和qep A基因则未检出。超广谱β-内酰胺酶耐药机制显示,5株菌均为blaCTX-M-65型。结论耐环丙沙星和头孢噻肟的菌株存在于肉鸡养殖环节及其环境中,并具有复杂的喹诺酮耐药机制和可传播的超广谱β内酰胺酶耐药机制。为阐明农场-餐桌-感染者传递链条中耐药关联性,为社区感染防控、临床抗生素用药提供科学依据,我国应该加强肉鸡等养殖业沙门菌多重耐药菌株的监测。
- 白莉张秀丽甘辛王伟胡豫杰侯君李凤琴徐进
- 关键词：肉鸡养殖场沙门菌环丙沙星头孢噻肟食源性致病菌
- 肉制品中马源性成分实时荧光PCR检测方法的建立被引量：4
- 2013年
- 目的建立肉制品中马源性成分的实时荧光PCR检测方法。方法参考欧盟实验室推荐的方法设计引物和探针,建立实时荧光PCR检测方法并验证方法的特异性、灵敏度,在北京部分超市、农贸市场、餐馆随机采集国产和进口牛、羊肉制品进行马源性成分检测。结果实时荧光PCR方法对马源性成分具有较高的特异性,与羊、猪、鸡、鸭、兔DNA均无交叉反应,与牛DNA在Ct 33.81出现交叉反应;所建方法对牛、羊肉中人工掺入马肉成分的检测灵敏度是0.1%。对北京市场上随机采集的122份牛、羊肉制品的检测结果显示,所有样品均未检出马肉成分。结论所建肉制品中马源性成分的检测方法简单、特异,检测灵敏度完全达到欧盟对肉类食品中掺入马源性成分比例的要求。
- 李楠王佳慧沈青韩春卉张靖李凤琴徐进江涛
- 关键词：实时荧光PCR牛肉制品羊肉制品
- stx-PCR方法、Vero细胞毒性试验和酶联免疫试剂盒3种方法检测产志贺毒素大肠埃希菌的评估被引量：4
- 2014年
- 目的评价stx-PCR方法、Vero细胞毒性试验和酶联免疫试剂盒3种方法在检测产志贺毒素大肠埃希菌的特异性和敏感性的差异。方法运用stx-PCR方法、Vero细胞毒性试验和酶联免疫试剂盒分别对29株大肠埃希菌参考菌株和45株食品分离大肠埃希菌株进行检测。结果 stx-PCR方法可以判定50株菌携带stx基因,同时Vero细胞毒性试验可以判定这些菌株具有细胞毒性,两者的一致性为100%;酶联免疫试剂盒能判定其中38株菌具有志贺毒素。结论 3种方法都具有很好的特异性。stx-PCR方法和Vero细胞毒性试验较酶联免疫试剂盒具有更高的敏感性,试剂盒适用于食源性疾病暴发事件中产志贺毒素大肠埃希菌的快速筛选,stxPCR方法推荐作为实验室常规快速检测方法,Vero细胞毒性试验是检测产志贺毒素大肠埃希菌是否具有志贺毒素生物学活性的金标准方法。
- 白莉胡豫杰王佳慧吴青赫英英王伟甘辛韩春卉李凤琴徐进
- 关键词：产志贺毒素大肠埃希菌志贺毒素
- 食品和腹泻患者分离耐环丙沙星大肠埃希菌耐药特征及耐药机制的比较研究被引量：2
- 2017年
- 目的从食品和腹泻患者中分离耐环丙沙星大肠埃希菌进行耐药性及相关分子特征的研究。方法从645株食品和腹泻患者来源的大肠埃希菌中确定21株(3.3%)环丙沙星耐药菌株,并对分离株进行药敏试验,采用聚合酶链式反应和核苷酸序列分析技术对环丙沙星耐药菌株进行喹诺酮类染色体、质粒编码耐药机制、超广谱β-内酰胺酶耐药机制及系统发育分型研究。结果 21株环丙沙星耐药菌株均为多重耐药菌株,所有菌株分别在gyrA、parC和parE发生1~4个点突变,其中16株菌携带了质粒介导的喹诺酮耐药基因,包括oqx A、oqxB、qnrS、aac(6')-Ib-cr和qepA,同时所有分离株均携带bla基因。结论本研究提示食品和腹泻患者来源的耐环丙沙星大肠埃希菌耐药机制具有多样性的特点,编码耐药基因质粒存在潜在的传播可能,对公众健康产生巨大威胁。需进一步开展此类耐药菌株的监测,为研究此类菌株在食品和人群中的可能传播和评估其对人群的健康风险提供基础数据。
- 白莉甘辛王丽丽杨小蓉张秀丽陈倩李凤琴徐进
- 关键词：环丙沙星大肠埃希菌耐药机制
- 鼠伤寒沙门菌婴幼儿分离株耐药基因及毒力基因研究被引量：11
- 2016年
- 目的基于全基因组测序结果,分析鼠伤寒沙门菌耐药表型和耐药基因的关系,研究其耐药发生机制和毒力因子。方法利用美国临床和实验室标准委员会(CLSI)推荐的微量肉汤稀释法对5岁以下腹泻患儿粪便中分离的321株鼠伤寒沙门菌开展药物敏感性试验,从中选择不同耐药表型的3株鼠伤寒沙门菌(S1:敏感;S2:TET耐药;S3:ESBLs阳性,10重耐药)进行全基因组测序,通过与抗生素抗性基因数据库(ARDB)和病原毒力因子数据库(VFDB)比对以及美国国立生物技术信息中心(NCBI)核酸数据库人工检索,对耐药基因和毒力基因进行注释。结果 321株鼠伤寒沙门菌对IPM和MEM均敏感,对TET和AMP的耐药率最高,分别为84.4%(271/321)和83.8%(269/321),206株菌株显示为耐3类以上抗生素(64.2%,206/321),11株CIP-CTX耐药株均为ESBLs阳性(3.4%,11/321);全基因组测序结果显示,S1、S2和S3的全基因组大小依次为4 876 427、4 970 690、5 133 380 bp,预测编码基因数分别为4 825、4 936和5 082个,GC含量依次为52.18%、52.14%、51.87%;对S1、S2和S3基因组中18、20和32个耐药基因进行注释,除共有基因外,S2主要携带tet A和sul2基因,S3主要携带sul1/2/3、tetB、AAC(3)-IV、AAC(6')-I、ANT(2″)-I、ANT(3″)-I、aph A1、bla_(CTX-M-14)、bla_(OXA-1)、catB3、cml_e1和cml_e3基因。与阳性鼠伤寒沙门菌株LT2的gyr A基因进行序列比对发现,S3 gyr A基因第87位密码子由GAC突变为AAC(Asp87→Asn);分别注释S1、S2和S3基因组的130、129和120个毒力基因,发现主要以三型分泌系统和粘附因子为主。结论 5岁以下腹泻患儿粪便样品中鼠伤寒沙门菌耐药现象严重;全基因组测序分析发现耐药基因与耐药表型一致,且存在多种毒力因子;为后续开展耐药基因传播机制和菌株致病性研究,评估其对人群的健康风险,防控鼠伤寒沙门菌感染提供技术支持。
- 王伟胡豫杰徐进彭子欣张宏元赵熙许学斌李凤琴
- 关键词：婴幼儿鼠伤寒沙门菌耐药基因全基因组测序食源性致病菌
- B型婴儿肉毒中毒的实验室诊断被引量：4
- 2016年
- 目的对1例疑似肉毒毒素中毒的婴儿病例灌肠液样品进行实验室检测并确证。方法对患儿的灌肠液样品进行肉毒梭状芽胞杆菌分离及肉毒毒素检测。结果患儿灌肠液样品TPGY培养物腹腔注射小鼠后可致小鼠出现类似肉毒毒素中毒表现(竖毛、呼吸困难并出现典型的蜂腰、四肢麻痹)继而死亡。培养物经胰酶处理后小鼠仍出现中毒并死亡,但培养物经100℃加热处理后再次染毒动物,小鼠不出现中毒和死亡。A、B、C、D、E、F六种混合型肉毒毒素诊断血清及B型单价肉毒毒素诊断血清可对小鼠起到保护作用。患儿灌肠液样品中分离到梭状芽胞杆菌,该菌经表型、生化、PCR肉毒毒素产毒基因鉴定,结果为产B型肉毒毒素的肉毒梭状芽胞杆菌。结论患儿疾病与B型肉毒毒素中毒相关。
- 董银苹李颖徐进王伟江涛韩春卉闫韶飞张迪李凤琴
- 关键词：肉毒毒素食源性致病菌食源性疾病基因检测
