徐杰 作品数:32 被引量:37 H指数:3 供职机构: 江西农业大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 江西省教育厅科学技术研究项目 江西省自然科学基金 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 经济管理 更多>>
一种沉默水稻过氧化氢酶基因OSCAT1的sgRNA 本发明公开了一种沉默水稻过氧化氢酶基因OSCAT1的sgRNA,其序列如序列表SEQ?NO.1所示。本发明首先获得OSCAT1序列设计sgRNA识别区的DNA靶标序列,然后设计OSCAT1的sgRNA表达序列并构建载体。... 胡丽芳 贺浩华 刘世强 朱昌兰 彭小松 贺晓鹏 傅军如 陈小荣 欧阳林娟 边建民 孙晓棠 徐杰 周大虎文献传递 一种籽粒低积累镉水稻品种的筛选方法 本发明属水稻栽培技术领域,具体涉及一种籽粒低积累镉水稻品种的筛选方法。该方法按照以下步骤进行:步骤1,含镉土壤处理配置;步骤2,待筛选品种的选择:以株高、生育期差异小粳稻种质资源作为待筛选材料;或以昌恢121为轮回亲本和... 孙晓棠 朱昌兰 李炜星 贺宏 奚文博 黎瑞莹 欧阳林娟 边建民 胡丽芳 徐杰 陈小荣 贺浩华文献传递 水稻白条纹叶及白穗突变体wlp6的鉴定与基因定位 被引量:4 2018年 【目的】叶色突变体是研究水稻光合作用,叶绿素生物合成和遗传发育调控机理的重要材料。发掘水稻叶色突变体,是水稻功能基因组学研究的重要遗传基础。【方法】在昌恢121中发现了一份白条纹叶及抽穗期白穗突变体,经过连续多代自交能稳定遗传,暂命名为wlp6(white striped leaf and white panicle 6)。在南昌分早、中和晚3季播种wlp6与野生型种子,考查了中稻与晚稻的部分农艺性状;测定3叶期、分蘖期、抽穗期叶片及颖壳的叶绿素含量;通过电镜观察抽穗期叶肉细胞发育情况。在光照培养箱中进行温光敏感实验;将wlp6与昌恢121及02428正反交,观察F_1植株表型,对F_2分离群体进行卡方测验,分析突变体遗传规律;以wlp6/02428衍生的F_2群体为材料,利用BSA法进行基因定位。【结果】wlp6自第1片叶到成熟,叶片均呈白条纹,抽穗期颖壳及枝梗失绿,高温天气穗转绿。突变体株高、有效穗数和每穗粒数在早稻季和中稻季均显著低于野生型,晚稻季wlp6的结实率和千粒重也显著低降低。叶绿素含量测定表明,wlp6叶片叶绿素含量在不同生育期及不同季均显著低于野生型,早稻和晚稻季种植的wlp6颖壳叶绿素含量也比野生型低。电镜观察抽穗期的叶肉细胞发现,wlp6叶绿体数目减少,体积变小,没有分化出明显的片层结构。温光敏感实验表明,突变体对光照强弱钝感,叶色受温度和日照长短影响,随着温度升高和日照时间变长突变体叶绿素含量有上升趋势。遗传分析表明,该性状受隐性核基因控制,利用wlp6/02428得到的616个F_2单株将WLP6定位于第6染色体短臂InDel标记R-7与R-8间,物理距离137kb,此区间预测了21个候选基因。经候选基因分析及测序发现,其中LOC_Os06g14620编码一个核糖核酸还原酶小亚基,编码区第142和158位碱基由T替换为C,第288位插入了碱基A,碱基的插入导致翻译提前终止,因此推测LOC_Os06g14 李玲锋 熊玉毅 欧阳林娟 彭小松 陈小荣 贺晓鹏 傅军如 边建民 胡丽芳 徐杰 贺浩华 孙晓棠 朱昌兰关键词:水稻 叶绿素 基因定位 一种沉默水稻过氧化氢酶基因OsCAT3的sgRNA 本发明公开了一种沉默水稻过氧化氢酶基因OSCAT3的sgRNA,其序列如序列表SEQ?NO.1所示。本发明首先获得OSCAT3序列设计sgRNA识别区的DNA靶标序列,然后设计OSCAT3的sgRNA表达序列并构建载体。... 胡丽芳 刘世强 贺浩华 朱昌兰 彭小松 贺晓鹏 傅军如 陈小荣 欧阳林娟 边建民 孙晓棠 徐杰 周大虎文献传递 一种低温胁迫后强反弹生长的直播早稻材料的筛选方法 本发明属于水稻筛选技术领域,具体涉及一种低温胁迫后强反弹生长的直播早稻材料的筛选方法,该筛选方法包括以下步骤:材料选择、幼苗培育及处理、初筛和复选。本发明的筛选方法通过对2叶‑3叶1心的早稻植株进行低温弱光处理,然后以叶... 陈小荣 王珲 钟蕾 贺浩华 朱昌兰 彭小松 贺晓鹏 傅军如 边建民 胡丽芳 欧阳林娟 徐杰 孙晓棠 周大虎 蔡怡聪 李炜星 付海辉水稻PAL基因的全基因组分析及胁迫表达研究 被引量:10 2018年 苯丙氨酸酶(phenylalanine enzyme,PAL)是催化苯丙烷次级代谢过程中的重要限速酶,对植物生长发育意义重大。为进一步探讨水稻OsPAL基因的功能,利用生物信息学的方法,在水稻全基因组水平上对OsPAL基因家族进行了进化树、基因结构、染色体定位等方面的分析。数据表明,水稻基因组中共存在9个PAL基因,命名为OsPAL1-Os PAL9,编码681-719个氨基酸,都含有一个保守性很高的Lyase aromatic结构域,集中分布于第2、4、5、11和12号染色体上。进化树的分析表明,9个Os PAL基因可分为三类亚家族:Ⅰ类(Os PAL2-4,OsPAL6-7),Ⅱ类(OsPAL8-9)和Ⅲ类(OsPAL1,OsPAL5),3类比较明显的区别是蛋白N端的前30个氨基酸。荧光定量q RT-PCR分析表明,除Os PAL8外,其它8个基因的表达至少受干旱、低温、Na Cl和ABA等4种胁迫中的一种响应。 曾嘉丽 欧阳林娟 刘家林 贺浩华 贺浩华 彭小松 朱昌兰 傅军如 彭小松 边建民 贺晓鹏 孙晓棠 傅军如 胡丽芳关键词:水稻 全基因组分析 一种低温胁迫后强反弹生长的直播早稻材料的筛选方法 本发明属于水稻筛选技术领域,具体涉及一种低温胁迫后强反弹生长的直播早稻材料的筛选方法,该筛选方法包括以下步骤:材料选择、幼苗培育及处理、初筛和复选。本发明的筛选方法通过对2叶‑3叶1心的早稻植株进行低温弱光处理,然后以叶... 陈小荣 王珲 钟蕾 贺浩华 朱昌兰 彭小松 贺晓鹏 傅军如 边建民 胡丽芳 欧阳林娟 徐杰 孙晓棠 周大虎 蔡怡聪 李炜星 付海辉一种定点敲除水稻OsAUR2基因的sgRNA的oligo DNA组 本发明提供一种敲除水稻OsAUR2基因的sgRNA的oligo DNA组。针对水稻OsAUR2基因设计基于CRISPR/Cas9的sgRNA序列,将含有编码所述sgRNA序列的DNA片段连接到携带CRISPR/Cas9的... 徐杰 姜志树 贺浩华 林小丽 周大虎 林小玲 刘嘉龙 吴慧 朱昌兰 边建民 贺晓鹏 蔡怡聪 孙晓棠水稻SOD基因家族的全基因组分析及逆境胁迫下表达研究 被引量:11 2018年 超氧化物歧化酶(SOD)是植物体内活性氧清除系统中的关键酶。为进一步研究水稻SOD基因家族的特点,利用生物信息学的方法,在水稻全基因组水平上对SOD基因家族进行了基因结构、染色体定位及进化树等方面的分析。结果表明,水稻基因组中共有9个OsSOD基因,包括6个Cu/Zn-SOD、2个Fe-SOD和1个Mn-SOD,可分为2个亚家族。9个OsSOD基因含有5~9个内含子不等,分布在6条染色体上。荧光定量qRTPCR分析表明,在NaCl、干旱、ABA和低温等4种逆境条件下,8个OsSOD基因的表达量会受其中三种胁迫而发生变化。 刘家林 欧阳林娟 曾嘉丽 傅军如 傅军如 朱昌兰 贺浩华 贺晓鹏 朱昌兰 边建民 彭小松 孙晓棠 贺晓鹏 胡丽芳关键词:水稻 超氧化物歧化酶 利用CRISPR/Cas9技术定向编辑水稻过氧化氢酶基因OsCAT 被引量:3 2018年 过氧化氢酶(catalase,CAT)作为重要的抗氧化酶,可催化细胞内过氧化氢的分解,为了研究水稻过氧化氢酶基因OsCAT2的功能,首先根据在线软件http://crispr.mit.edu/搜寻向导sg RNA序列,选择OsCAT2基因第三外显子上的"GTGGAGAACCGAACAATAACTGG"作为目标靶序列,然后构建了OsCAT2的CRISPR/Cas9载体BGK03-OsCAT2,将目的载体转化水稻粳稻9522后共获得了7个独立的转基因株系,其中包括在PAM附近发生编辑的独立转基因株系2个,编辑方式主要表现为缺失和错配。与野生型相比,转基因植株较矮、分蘖数增加、叶片呈明显的病叶状、成熟时期育性明显降低,这为深入研究水稻OsCAT2基因的作用机制提供了帮助。 刘家林 欧阳林娟 曾嘉丽 傅军如 傅军如 朱昌兰 贺浩华 贺晓鹏 朱昌兰 边建民 彭小松 孙晓棠 贺晓鹏 胡丽芳关键词:水稻 过氧化氢酶 转基因