徐晓刚
- 作品数:74 被引量:507H指数:13
- 供职机构:复旦大学附属华山医院更多>>
- 发文基金:国家重点基础研究发展计划国家自然科学基金卫生部部属(管)医院临床学科重点项目更多>>
- 相关领域:医药卫生化学工程农业科学一般工业技术更多>>
- 一种快速同步检测肺炎支原体及其大环内酯类耐药突变的新方法被引量:7
- 2010年
- 目的 建立基于CycleavePCR技术的肺炎支原体及其大环内酯类耐药突变株快速检测方法.方法 收集102株分离自2005-2008年上海市交通大学附属儿童医院住院患儿的肺炎支原体及136份2009年11-12月上海市交通大学附属儿童医院呼吸道感染的住院患儿经鼻采集鼻咽部痰标本,根据肺炎支原体无突变敏感株与突变耐药株23S rRNA基因2063/2064位的碱基差异及上下游保守序列分别设计新型特异性探针(Cycling探针)及引物,建立肺炎支原体及其大环内酯类耐药突变株检测方法,以含有被检测靶序列的重组质粒为阳性对照,以常见呼吸道病原菌DNA为阴性对照,评价其敏感度及特异度.采用自建方法检测所有标本,并与常规PCR及测序结果比较.结果 该方法可准确检出并鉴别大环内酯类敏感及耐药突变株阳性对照,102株临床分离株中83株对大环内酯类耐药,测序表明82株发生23S rRNA基因A2063G突变,1株A2064G突变,与CycleavePCR检测结果相符,136份痰标本检测结果也与常规PCR扩增及测序结果相符.所有阴性对照样品均未出现假阳性.与常规PCR及测序方法相比,CycleavePCR法的敏感度和特异度均达100%.该方法的检测下限为10拷贝/PCR反应,扩增检测可在1.5 h内完成.结论 建立了一种基于CycleavePCR技术的肺炎支原体及其大环内酯类耐药突变株快速检测方法,可同步提供病原菌及其耐药性信息,为肺炎支原体感染诊断及临床合理选用抗菌药物提供参考.
- 徐晓刚刘杨张泓叶信予李万华朱德妹王明贵
- 关键词:大环内酯类突变聚合酶链反应
- 一种快速同步检测肺炎支原体及其大环内酯类耐药突变的新方法
- 徐晓刚刘杨张泓叶信予李万华朱德妹王明
- 肺炎链球菌临床分离株PBP2b基因序列分析及其应用探索
- 2007年
- 目的通过分析肺炎链球菌PBP2b基因转肽酶编码区的序列差异,建立可区分对青霉素敏感肺炎链球菌(PSSP)与青霉素不敏感肺炎链球菌(PNSSP)的分子生物学方法。方法检测青霉素对肺炎链球菌的最低抑菌浓度(MIC),对菌株PBP2b转肽酶编码区进行PCR扩增和序列分析,根据序列差异设计相应引物和探针,并采用PCR-反向杂交方法区分PSSP与PNSSP。结果43株肺炎链球菌(42株临床分离株及1株标准株)中8株为PSSP,30株为青霉素中介株(PISP),5株为青霉素耐药株(PRSP)。经PBP2b基因限制性片段长度多态性分析(RFLP)及测序分析,PSSP与PNSSP (PISP+PRSP)存在谱型及序列差异。根据序列差异建立的检测方法可正确区分PSSP与PNSSP。结论肺炎链球菌PSSP和PNSSP菌株的PBP2b基因转肽酶编码区之间存在可供鉴别的序列差异,据此可建立快速、特异的分子生物学方法,有望为该菌耐药基因的快速诊断提供客观依据。
- 徐晓刚林东防张婴元杨帆朱德妹汪复
- 关键词:链球菌肺炎基因扩增聚合酶链反应
- 用于抗万古霉素耐药菌的药物组合物
- 本发明公开了一种用于抗万古霉素耐药菌的药物组合物,所述药物组合物为含有2,3,4‑三羟基二苯甲酮或其药学上可接受的盐及药学上可接受的载体,其化学结构如式(I)所示:<Image file="DDA000164222966...
- 徐晓刚姚小军
- 文献传递
- 金黄色葡萄球菌临床分离株磷霉素耐药性及f os耐药基因的检测被引量:5
- 2015年
- 目的了解金黄色葡萄球菌(金葡菌)对磷霉素的耐药性及其相关耐药基因fos分布。方法连续收集2014年1—3月复旦大学附属华山医院临床分离金葡菌109株;采用琼脂稀释法测定药敏,聚合酶链反应(PCR)检测磷霉素耐药基因fosA、fosB、fosC。筛选得到的fos基因阳性菌株进行多位点序列分型(MLST),并采用步移测序法分析磷霉素耐药基因周边序列。结果 109株金葡菌临床株中,磷霉素耐药菌株(MIC>32 mg/L)44株。计有13株fosB基因阳性金葡菌,均对磷霉素耐药。未检出fosA及fosC基因。fosB基因阳性的金葡菌以ST1型为主,3株磷霉素MIC>512 mg/L的金葡菌分属于3个不同的ST型别。耐药基因周边序列分析结果显示,fosB基因位于一含转座酶基因的移动元件。结论磷霉素耐药金葡菌中耐药基因fosB检出率高,可能与金葡菌磷霉素耐药性形成有一定相关性。
- 傅祝英杰吴湜郭燕马莹杨洋林东昉胡付品朱德妹刘杨徐晓刚
- 关键词:磷霉素耐药基因金黄色葡萄球菌
- 耐药菌检测芯片及其制备方法和应用方法
- 本发明属微生物检验领域,涉及一种常见耐药菌检测芯片及其制备方法和应用方法。本发明利用DNA芯片的方法,将已经合成的用于检测临床常见耐药菌的寡核苷酸探针固定于载玻片表面形成点阵,通过将待测样本的DNA片断与芯片杂交,可获取...
- 林东昉徐晓刚毛红菊赵建龙赵辉朱德妹张婴元汪复
- 文献传递
- 基于单晶氟化钙材料的细胞培养装置及其应用
- 本发明涉及基于单晶氟化钙材料的细胞培养装置及其应用,基于单晶氟化钙材料的细胞培养装置包括用于细胞培养的细胞培养皿和匹配细胞培养皿的细胞爬片,所述细胞培养皿的底部为单晶氟化钙材质,所述细胞爬片为单晶氟化钙材质。与现有技术相...
- 衣晓飞徐晓刚王明贵
- 一种介导万古霉素耐药的基因及其用途
- 本发明属生物医学技术领域,涉及一种介导万古霉素耐药的基因及其用途。本发明所述的耐药的基因具有SEQ ID.1的核苷酸序列,其编码的蛋白具有SEQ ID.2的氨基酸序列。所获得的该基因序列为新的万古霉素耐药肠球菌的耐药决定...
- 徐晓刚王明贵林东昉胡付品吴湜叶信予郭燕刘杨朱德妹张婴元
- 文献传递
- 一种介导受体菌对喹诺酮类抗菌药物敏感性下降的质粒
- 本发明属微生物学领域,涉及一种可介导受体菌对喹诺酮类抗菌药物敏感性下降的质粒,该质粒携带的可介导革兰阴性杆菌对喹诺酮类的耐药基因,及该基因的制备方法和用途。本发明从喹诺酮类药物耐药性产生的机制着手,寻找可介导细菌耐药的新...
- 王明贵王明华徐晓刚张婴元
- 文献传递
- 药物组合物及其应用
- 本发明公开了一种药物组合物及其应用,所述药物组合物为含有2,3,4-三羟基二苯甲酮或其药学上可接受的盐及药学上可接受的载体,其化学结构如式(I)所示:<Image file="DDA0000742689690000011...
- 徐晓刚姚小军
- 文献传递