宋丽娜
- 作品数：7 被引量：21H指数：3
- 供职机构：军事医学科学院放射与辐射医学研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学理学医药卫生更多>>
- 基于液相色谱-串连质谱的糖基化蛋白质组研究策略
- 人体内50％以上的蛋白质是糖基化修饰蛋白质。糖基化对于蛋白质的折叠、运输、定位起着重要作用，免疫系统中几乎所有的关键分子都是糖蛋白，蛋白质糖基化程度及糖链结构的异常变化也常常是癌症及其他疾病发生的标志。本文以标准糖基化蛋...
- 贾伟卢庄米薇宋丽娜应万涛蔡耘钱小红
- 关键词：液相色谱质谱分析糖基化蛋白质组
- 文献传递
- 天冬氨酸作为非特异性吸附抑制剂在二氧化钛选择性富集磷酸肽中的应用被引量：6
- 2010年
- 二氧化钛富集法作为目前使用最为广泛的金属氧化物富集磷酸肽的方法,在富集过程中常常对富含天冬氨酸和谷氨酸的酸性非磷酸化肽段存在一定的非特异性吸附作用。这些肽段与磷酸化肽段一同被富集,降低了磷酸肽富集的选择性。传统方法中使用的非特异性吸附抑制剂常会对质谱的电喷雾离子源造成污染,因而限制了其在液相色谱-质谱联用(LC-MS)系统中的应用。本研究将天冬氨酸作为一种新型的非特异性吸附抑制剂加入到二氧化钛富集体系中,并分别对3种和9种标准蛋白质酶切肽段混合物进行富集实验,同时与添加另一种非特异性吸附抑制剂——谷氨酸以及不添加任何非特异性吸附抑制剂的富集体系进行了富集效果的比较。结果表明,天冬氨酸可以有效地提高二氧化钛对磷酸肽富集的选择性。将添加天冬氨酸的二氧化钛富集体系应用于鼠肝全蛋白质磷酸肽的富集中,同样取得了很好的效果,表明天冬氨酸在复杂的生物样本的磷酸肽富集中也同样具有良好的应用前景。此外,由于天冬氨酸在反相色谱中极易被洗脱去除,从而避免了传统抑制剂对LC-MS系统离子源的污染问题。
- 迟明毕炜卢庄宋丽娜贾伟张养军钱小红蔡耘
- 关键词：二氧化钛天冬氨酸鼠肝
- 基于膜超滤的糖肽富集新方法被引量：1
- 2009年
- 建立了一种用于糖肽富集的新型超滤方法,采用截留相对分子质量为3 000 u的超滤膜,截取相对分子质量大于3 000 u的组分,同时完成糖肽的富集、样本的脱盐及浓缩,简化了操作过程并减少了样本损失。用4种标准蛋白酶切肽段混合物测试方法的有效性,结果表明,采用超滤方法富集后的样品可以多鉴定1个糖肽,且所有鉴定的糖肽丰度远高于未富集的样品。将该方法用于人血浆样本,血浆全酶切肽段的1个SCX组分用超滤法富集后,其鉴定的糖肽数量超过未富集组分的6倍,且糖肽富集的选择性大于85%。该方法为糖蛋白质组学的研究及糖相关生物标志物的开发提供了有力的技术支持。
- 卢庄贾伟宋丽娜蔡耘邓玉林张玉奎钱小红
- 关键词：超滤
- 免疫共沉淀联合质谱对肝细胞核因子3β蛋白复合体的分离鉴定被引量：5
- 2011年
- 目的:利用免疫共沉淀联合质谱分析方法,在人肝癌细胞系细胞株HepG2内筛选与肝细胞核因子(HNF)3β相互作用的蛋白质。方法:通过免疫共沉淀,用特异抗体分离出HNF3β蛋白复合体,质谱鉴定其成分,NCBI数据库检索各个蛋白质的功能,分析筛选与HNF3β相互作用的蛋白质。结果:利用免疫共沉淀联合质谱分析筛选到32个与HNF3β相互作用的候选蛋白质,数据库检索发现LMNA与HNF3β具有相同功能注释,参与转录调控。结论:在细胞内HNF3β与多种蛋白质有相互作用,协同参与转录调控,推测HNF3β/LMNA之间相互作用的变化与葡萄糖及脂肪代谢及相关疾病的发生有关。
- 孙婷婷宋丽娜于淼李长燕杨晓明汪思应
- 关键词：免疫共沉淀质谱蛋白质相互作用
- 等电聚焦分离与^18O稳定同位素标记联用的磷酸化蛋白质组学定量方法研究被引量：6
- 2008年
- 磷酸化蛋白质组学定量分析,要对磷酸化修饰富集技术和定量技术进行研究。基于此,本研究采用18O稳定同位素标记技术对胰蛋白酶酶解肽段混合物进行标记,并对其标记时间和标记后胰蛋白酶的变性条件进行优化。结果表明:在pH=4～5的KH2PO4缓冲体系中,37℃,标记反应持续19～24h,除了C-端肽之外,几乎所有的肽段都可达到100%标记;采用TCEP可以有效地抑制16O-18O回标现象。建立了与18O标记技术兼容性良好的IPG-IEF技术对磷酸化肽段进行选择性富集,富集后共从HepG2细胞中鉴定到491个磷酸化位点、362个磷酸化肽段和356个磷酸化蛋白,表明IPG-IEF在大规模磷酸化肽段分离富集中是有效的;最后与高准确度高灵敏度高分辨率的LTQ-FTICR质谱仪联用,建立了基于18O-IPG-IEF-LTQ-FTICR的磷酸化蛋白质组定量技术。实验结果表明,该技术可以实现磷酸化肽段的有效定性和定量。本研究为磷酸化蛋白质组学定量研究提供了实用技术。
- 隋少卉王京兰贾伟卢庄刘金风宋丽娜蔡耘钱小红
- 关键词：等电聚焦
- O-GlcNAc修饰蛋白质的生理功能和研究方法被引量：3
- 2007年
- 氧连N-乙酰葡糖胺(O-GlcNAc)修饰是与磷酸化相类似的蛋白质翻译后修饰方式,它主要发生在细胞核和细胞质中的蛋白质上,与细胞信号通路密切相关,成为近年来的研究热点。该文主要从O-GlcNAc修饰蛋白质的生理功能和研究方法两方面介绍该领域近年来的研究成果。
- 宋丽娜王京兰钱小红蔡耘
- 关键词：蛋白质组学
- C57小鼠肝脏内质网蛋白质翻译后修饰研究
- 内质网是细胞中重要的细胞器结构,细胞无论是自身正常的生理变化还是由于对环境的应激反应而使蛋白质产生上调或下调的变化,大部分都要通过内质网来实现,这是因为细胞内质网负责合成分泌到细胞外或是定位到细胞膜、线粒体和溶酶体等细胞...
- 宋丽娜
- 关键词：内质网糖基化磷酸化
- 文献传递
