兰干球
- 作品数:222 被引量:417H指数:9
- 供职机构:广西大学动物科学技术学院更多>>
- 发文基金:国家现代农业产业技术体系建设项目国家自然科学基金广西壮族自治区自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学医药卫生文化科学更多>>
- 广西巴马小型猪Lin28基因的克隆与序列分析
- 据Gene Bank中公布的人、猪等物种的Lin28核苷酸序列设计合成一对引物,以广西巴马小型猪肠道组织总RNA为模板,采用RT-PCR法,扩增出Lin28成熟蛋白编码cDNA序列,将此扩增产物克隆入pMD18-T载体,...
- 农微蒋钦扬郭亚芬兰干球蒋和生
- 关键词:广西巴马小型猪诱导多功能干细胞
- 文献传递
- 杜长大猪UCP3基因克隆及白藜芦醇对其表达的影响被引量:3
- 2019年
- 【目的】明确白藜芦醇对杜长大猪UCP3基因表达及脂肪代谢的影响,为揭示猪优良肉质性状形成机制打下基础。【方法】提取2月龄杜长大猪皮下脂肪组织RNA,采用RT-PCR扩增杜长大猪UCP3基因编码区(CDS)序列,运用在线软件对其进行生物信息学分析,并以实时荧光定量PCR检测白藜芦醇(400 mg/kg,饲喂30 d)对杜长大猪脂肪中UCP3基因表达的影响。【结果】从杜长大猪皮下脂肪组织中成功克隆获得UCP3基因CDS序列,全长927 bp,共编码308个氨基酸,其蛋白分子质量33673.09 Da,理论等电点(pI)9.44;与普通猪的UCP3基因序列相比,杜长大猪UCP3基因编码序列共有9处发生碱基突变,其中4处为错义突变,导致UCP3蛋白有4处氨基酸突变,分别为第74位脯氨酸(Pro)→亮氨酸(Leu)、第150位甘氨酸(Gly)→精氨酸(Arg)、第203位Arg→Gly和第259位缬氨酸(Val)→Leu。杜长大猪UCP3基因CDS序列与普通猪UCP3基因CDS序列的同源性为99.0%,其UCP3蛋白二级结构中以α-螺旋占比最高(46.43%)、β-转角占比最低(7.47%),属于亲水性蛋白。饲喂白藜芦醇(400 mg/kg)能极显著上调杜长大猪皮下脂肪UCP3基因表达(P<0.01),其相对表达量是对照组(不饲喂白藜芦醇)的2.06倍。【结论】白藜芦醇是通过上调杜长大猪UCP3基因表达而影响其脂肪代谢。
- 崔悦悦张广杰徐晓芙夏琴邹辉江雨航瞿秋红蒋钦杨黄艳娜郭亚芬兰干球
- 关键词:生物信息学分析白藜芦醇
- 陆川猪MYL9基因克隆及其表达差异分析被引量:5
- 2019年
- 【目的】克隆陆川猪肌球蛋白调节轻链9基因(MYL9),并进行生物信息学分析及检测其在不同猪种中的表达差异,为明确陆川猪骨骼肌生长规律及研究MYL9的生理功能打下基础。【方法】根据NCBI上的家猪MYL9基因序列设计特异性引物,采用RT-PCR克隆陆川猪MYL9基因,利用在线软件对其进行生物信息学分析,并以实时荧光定量PCR检测陆川猪和杜洛克猪背最长肌中MYL9基因的表达情况。【结果】陆川猪MYL9基因编码区(CDS)序列长519bp,共编码172个氨基酸;与NCBI上已公布的家猪MYL9基因(NM_001244472.1)CDS序列比对,陆川猪MYL9基因存在2处碱基突变,分别是195 bp处C→A和498 bp处T→C,均为同义突变;陆川猪MYL9基因推导氨基酸序列与家猪MYL9基因推导氨基酸序列的同源性最高,为99.6%,与鸡的同源性最低,为88.4%。陆川猪MYL9蛋白存在3个N糖基化位点和15个磷酸化位点,不存在跨膜结构域和信号肽,符合一般EFh-PEF超家族的结构特征。陆川猪MYL9蛋白二级结构中α-螺旋占54.65%,无规则卷曲占35.47%,β-转角占8.14%,延伸链占1.74%。MYL9基因在杜洛克猪背最长肌中的相对表达量极显著高于陆川猪背最长肌(P<0.01)。【结论】MYL9基因序列在不同物种中具有较高的保守性,其在10周龄陆川猪背最长肌中的相对表达量极显著低于杜洛克猪,与其在不同猪种背最长肌中的磷酸化程度有关,也说明MYL9基因对猪肌肉生长速度有一定影响。
- 焦迪谢婉潘鹏丞陈宝剑关志惠杨秀荣兰干球郭亚芬谢炳坤
- 关键词:陆川猪克隆生物信息学分析肌肉磷酸化
- 广西巴马小型猪α-1,3半乳糖转移酶基因真核表达载体的构建及鉴定
- 目的:通过RT-PCR扩增巴马小型猪GGTA1基因,分析其序列的机构特点并构建真核表达载体,为生产GGTA1基因沉默的广西巴马小型猪奠定基础。方法:根据NCBI上发布的猪α-1,3半乳糖转移酶基因cDNA序列(AF221...
- 郭晓萍陈时锦兰干球蒋钦杨郭亚芬
- 关键词:巴马小型猪真核表达载体CDNA序列
- 文献传递
- 一种与小型猪2型糖尿病有关的SNP标记、其检测方法和用途
- 本发明公开了一种与小型猪2型糖尿病有关的SNP标记、其检测方法和用途,本发明的SNP标记是位于Leptin基因的1号外显子325bp处的G/A多态,有该SNP标记的Leptin基因的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示...
- 郭亚芬兰干球蒋钦杨杨辉
- 文献传递
- 大白猪不同脂肪部位脂质代谢相关基因的表达差异分析
- 2024年
- 脂肪沉积决定于脂肪酸合成、转运和分解代谢的动态平衡。为比较猪(Sus scrofa domesticus)不同脂肪部位脂质代谢差异和不同性别间的差别,筛选与脂肪沉积能力显著关联的相关酶基因,本研究检测大白猪(Large White pigs)脂质代谢相关生化指标、肌内脂肪(intramuscular fat)含量,皮下脂肪、腹部脂肪和肾周脂肪组织间脂肪酸合成酶基因ACC,脂肪酸转运酶基因CPT1A和CD36,以及脂肪酸分解酶基因HSL和LPL的转录表达水平,分析目标基因与血清生化指标和肌内脂肪含量的相关性,比较在不同脂肪组织间的基因表达差异。结果表明,血清甘油三酯(triglycerides)、总胆固醇(total cholesterol)和肌内脂肪含量在不同性别大白猪中均无显著性差异(P>0.05)。相关性分析表明,大白猪公猪腹部脂肪中ACC基因表达量与甘油三酯含量呈显著正相关(P<0.05),皮下脂肪中HSL基因表达量与甘油三酯含量呈显著负相关(P<0.05);大白猪母猪腹部脂肪中ACC基因表达量与甘油三酯含量呈极显著正相关(P<0.01)。实时定量PCR结果表明,在大白猪公猪中,ACC基因在腹部脂肪中的表达丰度最高;CPT1A基因在腹部脂肪中的表达量极显著高于皮下脂肪和肾周脂肪的(P<0.01);LPL基因在肾周脂肪中的表达量极显著高于腹部脂肪和皮下脂肪的(P<0.01);CD36基因和HSL基因在不同脂肪组织中未见显著差异(P>0.05)。在大白猪母猪中,ACC基因在腹部脂肪中的表达丰度最高;CPT1A基因和HSL基因在皮下脂肪中的表达量极显著低于腹部脂肪的(P<0.01),显著低于肾周脂肪的(P<0.05);CD36基因在皮下脂肪中的表达量极显著低于腹部脂肪和肾周脂肪的(P<0.01);LPL基因在不同脂肪组织中未见显著差异(P>0.05)。本研究初步揭示了不同性别大白猪脂质代谢相关基因在不同脂肪部位的表达差异,提示ACC基因可能正向调控腹部脂肪沉积,HSL基因在大白猪公猪皮下脂肪分解代谢中可能�
- 王钰滨陈奎蓉王梦影张坤许迪兰干球梁晶
- 关键词:大白猪脂肪代谢
- 广西巴马小型猪ANK1基因启动子克隆及其活性分析被引量:1
- 2017年
- 【目的】克隆广西巴马小型猪ANK1基因启动子,确定其活性核心区,为研究ANK1基因启动子与肉质性状的相关性及构建动物疾病模型打下基础。【方法】通过在线软件对ANK1基因启动子的转录因子结合位点进行预测,根据转录因子结合位点设计特异引物扩增不同长度的ANK1基因启动子片段,并利用双荧光素酶试剂盒检测其荧光值,以确定不同ANK1基因启动子片段的活性。【结果】发现ANK1基因启动子存在1个转录起始位点(TSS)、2个Cp G岛和多个转录因子结合位点,并以此作为ANK1基因启动子的分段依据,将其分割为P638、P791、P1113、P1163、P1648、P1694、P1796和P2074等8个不同长度的目的片段。成功克隆获得的8个ANK1基因启动子片段经KpnⅠ和HindⅢ双酶切、T4真核表达载体连接、细胞转染等方法构建8个双荧光素酶重组报告基因,双荧光素酶试剂盒检测结果显示,广西巴马小型猪ANK1基因启动子在P1796片段活性最强,与其他片段存在显著差异(P<0.05)。【结论】成功克隆获得广西巴马小型猪ANK1基因启动子的8个片段,且利用双荧光素酶试剂盒检测确定其核心启动子区域出现在P1796片段。
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- 关键词:广西巴马小型猪启动子活性分析
- 一种动物专用静脉采血器
- 本实用新型提供了一种动物专用静脉采血器,包括针头固定帽、采血钢针、塑料软管护套和双孔连接针头,针头固定帽包括通血腔体和通气腔体,通血腔体上设有通血接口,通气腔体上设有通气接口和注射器接口,通血腔体和通气腔体隔断;采血钢针...
- 张广杰兰干球
- 文献传递
- 尼里——拉菲奶水牛的RAPD分析
- 本文以尼里-拉菲奶水牛基因池为模板,从22条10bp的随机引物中筛选出17条具有清晰多态条带的引物,从中选取5条,对尼里-拉菲奶水牛基因组DNA进行RAPD扩增,结果得到53条带,其中12条表现多态,多态频率23.85﹪...
- 郭亚芬兰干球杨秀荣莫毅李凤
- 文献传递
- 广西巴马小型猪肌肉生长抑制素(Myostatin)cDNA克隆和序列分析
- 目的:通过RT-PCR扩增广西巴马小型猪Myostatin cDNA序列,经过连接、转化、克隆测序后,与NCBI中发表的猪Myostatin序列进行同源性比较,分析广西巴马小型猪Myostatin的cDNA序列结构特点及...
- 王世凯兰干球罗琴郭亚芬王爱德
- 关键词:肌肉生长抑制素碱基突变小型猪
- 文献传递