黄莉
- 作品数：14 被引量：42H指数：4
- 供职机构：南宁市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：广西南宁科学研究与技术开发计划项目更多>>
- 相关领域：医药卫生语言文字更多>>
- 2007年南宁市A(H3N2)亚型流感病毒抗原性及血凝素重链区基因特性分析被引量：2
- 2010年
- 目的:了解南宁市A(H3N2)亚型流感病毒血凝素的抗原性和基因变异情况。方法:对分离到的A(H3N2)亚型流感病毒进行单向HI试验分析抗原性,并按不同时间、不同人群选取35株进行血凝素核苷酸全长序列测定,推导出其氨基酸序列,重点对血凝素重链区进行基因特性分析。结果:单向HI试验表明,2007年度南宁市分离到的A(H3N2)亚型流感病毒抗原性与2004年WHO推荐株A/福建/411/2002(H3)相比,后者HI效价比前者高4倍以上;与2007年国内代表株A/江西东湖/312/2006(H3)相比,HI效价无≥4倍差异。核苷酸和氨基酸序列分析结果表明,与A/福建/411/2002(H3)相比核苷酸和氨基酸同源性分别为97.99%和97.81%,平均替换数分别为19.8个和7.2个,涉及2个抗原决定簇和受体结合位点左侧壁;与A/江西东湖/312/2006(H3)相比核苷酸和氨基酸同源性均为98.40%,平均替换数分别为15.8个和5.2个,涉及2个抗原决定簇。结论:2007年南宁市分离的A(H3N2)亚型流感病毒已发生抗原漂移。
- 秦剑秋刘海燕林新勤范云燕黄莉
- 关键词：流感病毒血凝素抗原
- 2005～2007年南宁市流行性感冒病原学监测分析被引量：8
- 2008年
- 目的探讨南宁市流行性感冒病例发生的病原学依据和流感毒株的型别分布、时间分布等特征，为流感的防治以及与SAILS、禽流感的鉴别诊断提供科学的实验室依据。方法采用MDCK细胞进行流感病毒的分离培养，血凝试验阳性标本采用血凝抑制试验进行流感病毒型别鉴定。结果南宁市2005～2007年流行性感冒连续3年流感季节类型均为混合型，2005年的流行期，A（H3N2）亚型流感病毒活动较强，2006年的流行期，A（H1N1）亚型和B型流感病毒均出现较强活动，A（H3N2）亚型未能检出，2007年流行期A（H3N2）亚型重新出现且活动频繁；发病以在校学生为主，以后随年龄增高发病降低；流行高峰期一般在3～6月，强度以A（H3N2）亚型为高，12月至次年1月有1个流行小高峰，B型呈长期低强度流行，其流行毒株型别发生变化；不同性别流感病毒易感程度相同，但感染型别有异。结论A型流感病毒在春夏季活动频繁，秋冬季以B型为主，且由2005～2006年的BV型（Victoria系）转向2007年的BY型（Yamagata系）。加强流感病毒的监测，针对不同季节和不同年龄人群，有的放矢，做好相应的预防控制和宣传教育工作。
- 刘海燕秦剑秋林新勤石健黄莉覃巍巍范云燕
- 关键词：流行性感冒病原学病毒型别
- 南宁市2007～2009年H3N2亚型流感病毒NA基因变异分析
- 2012年
- 目的对2007～2009年度南宁市流行性感冒病毒NA序列分析,阐明NA基因变异和进化特征。方法提取2007～2009年30株（每年10株）H3N2亚型病毒RNA,采用RT-PCR扩增病毒NA基因后进行序列测定,利用VectorNTI9.0对测序结果分析处理,并与WHO推荐疫苗株进行比对,用Mage 4.1构建系统进化树。结果南宁市2007～2009年H3N2亚型流感病毒被分为3个分枝,其中疫苗株A/Wisconsin/67/2005独立形成一个分支（类群Ⅰ）,A/Brisbane/59/2007与2007年毒株（除339外）形成类群Ⅱ,2008和2009年毒株聚集成类群Ⅲ。NA基因在质尾区域、极性跨膜区、柄部区域有个别毒株个别位点发生了替换。抗原区域328～336替换频率较高,2008年毒株抗原位点更活跃。A/nanning/242/2007在酶活性位点发生了D151E替换,可能导致NA对扎纳米韦和奥斯他韦的轻微耐药性;A/nanning/242/2007、A/nan ning/561/2008分别在非活性位点N234D,在G286D的替换则可能影响NA介导的病毒粒子的释放从而影响NA蛋白的活性。结论南宁市2007~2009年毒株NA均发生了较大变异,当年疫苗株均滞后南宁流行株。
- 范云燕刘海燕林新勤秦剑秋黄莉覃巍巍
- 关键词：流感病毒H3N2神经氨酸酶基因分析
- H3N2亚型人流感病毒神经氨酸酶基因特性研究被引量：2
- 2011年
- 目的了解H3N2亚型人流感病毒神经氨酸酶(NA)基因变异规律方法采用狗肾传代细胞法对流感病毒进行分离培养,提取病毒RNA,逆转录-聚合酶链式反应,扩增NA基因后进行核苷酸序列测定。测序结果与WHO全球流感疫苗株序列进行氨基酸序列同源比对,并采用MEGA 4.0构建系统进化树,计算遗传距离。结果 NA氨基酸序列的系统进化树表明,南宁市2007年H3N2亚型人流感病毒株被分为4个分枝,其中大部分病毒株位于分枝Ⅰ和分枝Ⅱ中。氨基酸序列比对表明,NA没有发生氨基酸的缺失与插入,总体上比较保守,NA的酶活性中心、二硫键和糖基化位点基本保持不变。NA不同抗原决定簇变异频率不同,L370S变异出现在多数病毒株中。非结构功能位点也发生了不同程度的变异情况,其中K249E变异是导致分枝Ⅱ出现的主要因素。结论 NA基因的这些特性为流感的防控以及NA抑制剂药物的应用提供了一定的参考依据。
- 刘海燕范云燕林新勤秦剑秋黄莉覃巍巍
- 关键词：H3N2亚型神经氨酸酶
- 2008—2009年南宁市人季节性H1N1流感病毒神经氨酸酶潜在的抗原位点和抑制剂耐药位点分析被引量：1
- 2012年
- 目的了解2008—2009年南宁市人季节性H1N1流感病毒神经氨酸酶(NA)基因的遗传进化特征,探讨NA基因潜在的抗原位点和活性位点(抑制剂耐药性位点)变异规律。方法提取2008—2009年20株H1N1流感病毒RNA,采用RT-PCR扩增病毒NA基因后进行序列测定,通过CTLPred软件预测NA基因上潜在的抗原位点,并对NA分子进化和其重要功能位点的遗传变异进行分析。结果将20株H1N1流感病毒毒株与北半球疫苗推荐株A/Solomon/3/2006和A/Bris-bane/59/2007构建进化树,NA进化树共分成3个类群,10株2008年H1N1流感病毒毒株聚集成分支Ⅱ,10株2009年毒株与疫苗株A/Brisbane/59/2007聚集成分支Ⅰ,A/Solomon/3/2006则独立形成1个分支(Ⅲ)。2008年毒株抗原位点替换频率较高,相对于A/Solomon/3/2006氨基酸替换分布在不同的3个区域的3个位点,分别是N64H、Y100H、L367I;2009年度的毒株抗原决定簇位点相对保守。在已知NA的酶活性位点中,2009年所有毒株均在275位点发生了H>Y的突变,而这种变异在2008年的毒株中未有出现。结论 A/Solomon/3/2006落后于2008年毒株,A/Brisbane/59/2007对应的疫苗在2009年能起到较好的保护作用;大量H275Y耐药株的出现提示在流感病毒监测中应密切关注其耐药位点的变异。
- 范云燕刘海燕石健秦剑秋黄莉覃巍巍
- 关键词：流感病毒H1N1神经氨酸酶抗原位点
- A(H3N2)亚型流感病毒血凝素基因特性及蛋白结构分析,以南宁市2009～2012年为研究案例被引量：2
- 2015年
- 利用生物信息学软件和数据库研究南宁市2009~2012年度A(H3N2)亚型流感病HA基因的遗传变异规律及蛋白结构变化。通过RT-PCR扩增H3N2病毒HA基因并测序,同源比对统计毒株氨基酸位点的差异、构建系统进化树分析进化规律和同源建模分析蛋白结构的变化。系统进化树表明53株HA基因序列被分为4个类群,呈多侧支流行;所有毒株的二硫键和受体结合位点(RBS)高度保守;部分毒株HA在第45位点增加一个糖基化位点,在第144位点丢失一个糖基化位点;HA抗原决定簇氨基酸累计有30个位点发生变异,涉及5个抗原决定簇;HA晶体结构分析抗原决定簇突变位点主要发生在无规则卷曲处,大多数替换的氨基酸种类和性质相同或相似。南宁市A(H3N2)亚型流感病毒株变异活跃,2012年A(H3N2)亚型流感病毒与当年WHO推荐的疫苗株具有较远的进化距离,多数毒株具备了形成新变种的条件,是否形成新的流行株,有待深入研究。
- 秦剑秋裴建新林新勤王亮黄莉刘海燕
- 关键词：血凝素蛋白结构同源建模
- 南宁市同期两起A(H3N2)流行性感冒疫情中流感病毒血凝素重链区基因特性
- 2011年
- 目的了解南宁市同一时期不同县区发生的两起A(H3N2)亚型流感疫情中流感病毒血凝素基因变异情况。方法从狗肾传代细胞中(MDCK)分离的A(H3N2)亚型流感病毒提取核糖核酸(RNA),进行血凝素核苷酸全长序列测定,推导出其氨基酸序列,重点对血凝素重链区进行基因特性分析。结果两起疫情共分离到A(H3N2)亚型流感病毒5株,核苷酸和氨基酸序列分析结果表明,与2007年WHO推荐的北半球疫苗株A/Wisconsin/67/2005(H3)相比,核苷酸和氨基酸同源性分别为98.58%～98.89%和96.96%～97.87%,替换数分别为11～14个和7～10个,涉及3个重要的抗原位点。结论同期两起疫情分离到的A(H3N2)亚型流感病毒已发生抗原漂移且毒力有所改变,发生在不同县区的疫情所分离到的流感病毒性状不尽相同,同一起疫情中发病时间不同所分离出的流感病毒有一定基因差异。
- 秦剑秋刘海燕林新勤黄莉范云燕
- 关键词：流感病毒血凝素基因
- 南宁市2012—2015年流行性感冒流行特征分析被引量：10
- 2017年
- 目的分析南宁市2012—2015年流行性感冒(简称流感)监测结果,为流感防制策略提供依据。方法采用实时荧光RT-PCR方法对采集的流感样病例(Influenza-like Illness,ILI)咽拭子标本进行流感病毒核酸检测,并运用描述性流行病学方法对流感流行特征进行分析。结果 2012—2015年共采集ILI咽拭子标本共6 664份,经流感病毒核酸检测,阳性标本988份,阳性率为14.83%。4年中流感病毒优势株交替变化,2012年和2014年的优势毒株为甲3型,2013年优势毒株为新甲型H1N1,2015年优势毒株是甲3型和B型;0~<11岁组和21~<31岁组的阳性人数占阳性总数的50.30%。流感暴发疫情61起,其中59起疫情发生在中小学校。结论南宁市2012—2015年流感的流行特征有明显的季节性,主要易感人群为婴幼儿、小学生和青壮年。加强对重点人群的监测及疫苗预防接种工作,对控制流感疫情的暴发具有重要意义。
- 农皓刘海燕秦剑秋尹刘江杨丞詹鑫婕裴建新黄莉
- 关键词：流行性感冒流感样病例病原学监测
- 2013-2014年南宁市A(H3N2)亚型流感病毒病原学特征分析被引量：3
- 2017年
- 目的分析南宁市2013-2014年A(H3N2)亚型流感病毒的病原学特征及流行趋势。方法通过RT-PCR扩增毒株A(H3N2)病毒血凝素(HA)基因和神经氨酸酶(NA)并进行同源比对,采用Mega5.1(N-J法)构建系统进化树,统计氨基酸位点的差异,同源建模后分析蛋白结构的变化。结果构建系统进化树,20株毒株HA基因与NA基因均分为4个类群,呈多侧支流行;部分毒株的HA蛋白A抗原决定簇144位点及B抗原决定簇156和158位点发生突变,二硫键和糖基化位点高度保守,未发生变化;NA蛋白抗原基本稳定,只有A/Nanning/43/2014(H3N2)毒株抗原决定簇312位点发生突变,二硫键、酶活性位点、糖基化位点及耐药性位点均未发生变化;HA和NA蛋白晶体结构分析显示氨基酸突变位点主要发生在β折叠部位和无规则卷曲处。结论南宁市A(H3N2)亚型流感病毒株变异活跃,在HA基因和NA基因进化树上疫苗株明显滞后于南宁市流行株,抗原决定簇位点出现氨基酸的替换,但关于疫苗的预防效果尚需进一步验证。
- 秦剑秋王亮刘海燕黄莉
- 关键词：血凝素神经氨酸酶蛋白结构同源建模
- 2008～2009年南宁市季节性H1N1亚型流感病毒血凝素HA1基因变异分析
- 2013年
- 目的分析南宁市2008～2009年度流行性感冒的病原学监测结果,探讨其季节性H1N1亚型流感病流行情况和HA1基因变异规律及进化趋势。方法根据流感病原学监测和疫情挑选2008～2009年中分离到的季节性H1N1亚型毒株20株(每年10株),提取病毒RNA,采用RT-PCR扩增病毒HA基因后进行核苷酸序列测定,利用VectorNTI 9.0分析处理,并与WHO推荐疫苗株进行比对,用Mage 4.1构建系统进化树。结果 2008～2009年南宁市季节性流感流行主要集中在夏秋季节,H1N1成为2008年度的优势毒株。进化树分析表明,南宁市2008～2009年毒株被分为2个分支(Ⅰ和Ⅱ),A/Solomon/3/2006和A/Brisbane/59/2007分别分布在分支Ⅰ和Ⅱ内。对H1N1HA1氨基酸序列分析表明,20份毒株二硫键和糖基化位点比较保守,受体结合位点(RBS)和抗原决定簇位点相对活跃,其中RBS 188、189、222、224均发生了不同程度的变异。与A/Solomon/3/2006相比,2008年毒株抗原决定簇存在4个氨基酸的替换并且分布在两个抗原决定簇区域,2009年毒株除A/nanning/473/2009外,抗原决定簇区氨基酸变异未达到4个。结论南宁市2009年H1N1流感病毒HA1基因特性与A/Brisbane/59/2007疫苗株接近,2008年毒株与两疫苗株相比变异较大,这可能是导致2008年南宁市H1N1亚型流感病毒流行强度明显增加的原因。
- 范云燕刘海燕林新勤秦剑秋黄莉覃巍巍
- 关键词：H1N1血凝素类基因变异
