魏桂芳
- 作品数:21 被引量:149H指数:7
- 供职机构:上海交通大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:医药卫生农业科学生物学环境科学与工程更多>>
- 肠道微生物群落结构的分子分析
- 肠道菌群对宿主的消化、免疫和抗病等功能具有重要的影响。传统的分离培养技术不能客观全面地反映肠道菌群的结构特征。本研究应用分子生物学技术对人和动物(昆虫和大熊猫)肠道微生物群落结构进行了研究。
过去的研究表明,人...
- 魏桂芳
- 关键词:肠道微生物群落结构分子生物学
- 文献传递
- 软腐欧氏杆菌的Ⅲ型分泌系统对harpin蛋白的识别与分泌被引量:1
- 2002年
- 本文研究软腐欧氏杆菌分泌致病蛋白的Ⅲ型分泌系统的组分是否能识别梨火疫欧氏杆菌存在于mRNA上的分泌识别信号。用PCR的方法 ,将带有上游 75bp可以在其mRNA的5′端形成一个典型的作为Ⅲ型分泌识别信号的茎环结构的梨火疫欧氏杆菌的诱导植物过敏反应的harpin的基因hrpN ,从带有hrp基因簇的质粒pCPP43 0上克隆到pGEM T载体上 ,获得重组质粒pWGF1 ,经化学法转化到hrpN基因的转座突变体DH5α(pCPP43 0hrpN- )中 ,同时将pWGF1电击转化到胡萝卜软腐欧氏杆菌Se9R中 ,转化子的无细胞抽提物 (CFEP)经Western blot检测到harpin蛋白已被表达 ;带有双重质粒的DH5α(pCPP43 0hrpN- pWGF1 )在番茄植物上可以引起过敏反应 ,Se9R(pWGF1 )在大白菜上的致病力明显低于Se9R ,初步表明一种植物病菌的harpin蛋白可被另外一种病菌的Ⅲ型分泌系统所识别。
- 魏桂芳赵淑清赵立平
- 关键词:软腐欧氏杆菌HARPIN蛋白分泌
- 软腐欧氏杆菌的Ⅲ型分泌系统对梨火疫欧文氏杆菌harpin蛋白的识别与分泌
- 该文研究软腐欧氏杆菌(Erwinia carotovora)分泌致病蛋白的Ⅲ型分泌系统的组分是否能识别梨火疫欧氏杆菌(Erwinia amylovora)存在于mRNA上的分泌识别信号.用PCR 的方法,将带有上游75b...
- 魏桂芳
- 关键词:软腐欧氏杆菌
- 文献传递
- 健康儿童与FTT儿童肠道菌群结构的比较研究
- 人类的胃肠道定植着一个十分复杂而又相对稳定的微生物区系,肠道的微生态系统一般由专性厌氧菌组成。研究表明,粪便中的微生物含量达1010-1011CFU/g,在结肠处大约含有400种以上的细菌类型。固有的肠道微生物在人类的健...
- 张美玲魏桂芳郭美蕻赵立平
- 关键词:ERIC-PCRDNA指纹图谱
- 文献传递
- 健康儿童与发育不佳儿童肠道菌群结构的比较研究被引量:9
- 2005年
- 目的对健康儿童与发育不佳(FTT)儿童肠道中微生物区系的ERIC-PCR指纹图谱异同进行研究。方法根据美国疾病预防控制中心(CDC)对儿童生长发育的评价指标对某幼儿园200例4~6岁儿童进行评价,筛选出16例健康儿童和13例FTT儿童,每周1次连续3周跟踪取样,提取粪便样品中细菌总DNA,获得其ERIC-PCR指纹图谱,再将其中一个样品的ERIC-PCR产物作为混合探针通过杂交对指纹图谱上DNA条带序列的异同进一步比较。结果同一个体的肠道菌群结构在取样期间稳定性较好;虽然健康儿童间的肠道菌群结构也有一定差异,但它们却有着共同的结构特征;而健康儿童与FTT儿童的肠道菌群结构差异较大。结论儿童发育状况与肠道菌群结构有一定的关系。
- 张美玲魏桂芳郭美蕻赵立平
- 关键词:健康儿童群结构ERIC-PCRPCR产物总DNAFTT
- 用PCR指纹图技术分析焦化废水接触氧化池中悬浮污泥和生物膜的微生物种群组成被引量:26
- 2004年
- 目的 :应用分子生物学方法 ,以处理焦化工业废水 (A2 /O生物膜工艺 )中的悬浮污泥和生物膜的微生物群落作为研究对象 ,分析不同环境微生物群落的组成差异。方法 :首先提取群落的总DNA ,获得ERIC PCR和LP RAPD指纹图谱并进行对比分析 ,然后结合群落探针杂交的技术 ,检查同样迁移率的条带的序列同源性 ,运用UVIBAND/MAP软件比较所得群落指纹图谱的相似性指数 ,从而可以得到群落差异的量化结果。结果 :焦化废水接触氧化池中 ,悬浮污泥和生物膜的微生物群落组成存在相当大的差异。结论 :通过这种差异的比较分析 ,有可能让我们更准确地了解氧化池中微生物的群落组成情况 。
- 李亮魏桂芳童耕雷赵立平
- 关键词:分子生物学悬浮污泥生物膜微生物群落
- 应用TGGE技术分析人肠道中双歧杆菌的组成被引量:16
- 2005年
- 用温度梯度凝胶电泳(TGGE)技术结合16SrDNA克隆、测序,对健康人肠道中双歧杆菌的组成进行了分析。10例健康人肠道双歧杆菌的TGGE分析显示:人肠道内双歧杆菌的组成具有宿主特异性,不同人肠道双歧杆菌种的多样性和种类不同。通过对一健康儿童肠道双歧杆菌属特异性PCR扩增产物的测序及TGGE电泳行为的分析发现,该个体双歧杆菌TGGE图谱中的条带分别代表Bifidobacteriumbifidum、B.infantis、B.longum、B.adolescentis、B.pseudocatenulatum等种和一新种,其中B.pseudocatenulatum(假小链双歧杆菌)是大多数个体共有且较优势的种类。用传统培养方法只检出B.pseudocatenulatum和B.longum两种。基于双歧杆菌属特异性PCR基础上的TGGE方法结合16SrDNA克隆文库分析可较灵敏、直观地反映人肠道中双歧杆菌的组成。
- 庞小燕张宝让魏桂芳赵立平
- 关键词:双歧杆菌
- 应用PCR与温度梯度凝胶电泳分析龈上菌斑微生物群落被引量:3
- 2005年
- 目的应用PCR与温度梯度凝胶电泳(PCRTGGE)分子技术对成年健康口腔的龈上菌斑中微生物群落组成进行分析。方法8例成年个体包括4男4女,年龄19~29岁,分别采取每例个体上下颌牙周龈上菌斑样品,共18份(个体Subl间隔10天采集2次样品)。提取菌斑DNA,PCR扩增16SrDNAV3可变区,产物经TGGE后进行相似系数分析。结果同一个体的上下颌微生物群落组成相似性系数为81%~95%,而不同个体的龈上菌斑微生物群落组成相似性系数,均在60%以下。结论不同个体具有其独特的牙周微生物群落,而且在一定时期内组成稳定。
- 洪纬魏桂芳庞小燕王凌华赵立平
- 关键词:菌斑牙周PCR成年TGGE微生物群落
- 软腐欧氏杆菌的III型分泌系统对梨火疫欧文氏杆菌harpin蛋白的识别与分泌
- 魏桂芳
- 关键词:软腐欧氏杆菌HARPIN蛋白分泌ERWINIA
- 分析比较微生物群落结构的监测方法
- 一种微生物生态学领域的监测方法,具体是一种分析比较微生物群落结构的监测方法。具体如下:选定一对LP-RAPD引物,长度15-24bp,(G+C)含量50%;环境样品中混合微生物总基因组DNA的提取;LP-PCR循环反应,...
- 赵立平魏桂芳
- 文献传递