陈红岩
- 作品数：53 被引量：50H指数：4
- 供职机构：复旦大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划上海市教育委员会重点学科基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 20q13.33,11q23.3和5p15.33染色体区域基因多态性与中国汉族人群脑胶质瘤易感性研究
- 脑肿瘤是危害人类健康的严重疾病之一,最近几年发病率呈上升趋势,尤其在发达的西方国家。在全球,每年有18-60万中青年人因胶质瘤失去生命。欧洲人群脑胶质瘤全基因组关联研究(GWAS)发现了5个脑胶质瘤易感基因:TERT,C...
- 陈红岩宋晓陈元渊赵英杰范薇薇卢大儒
- 胰高血糖素样肽-1及其类似物对糖尿病基因治疗的研究
- 朱青陈红岩卢大儒
- 关键词：糖尿病基因治疗
- 耐热DNA连接酶介导的TLCR技术在简化DNA重组实验中的应用被引量：2
- 2016年
- 传统的DNA重组方法 TypeⅡ型限制酶技术受到片段纯化的限制,无法做到复杂混合体系中DNA片段的特异性连接。为解决这个问题,本研究将耐热连接酶链式反应(Thermostable ligase chain reaction,TLCR)引入DNA片段的连接与捕获。该技术利用耐热型DNA连接酶的特性,在热循环反应中配合针对目的片段末端序列设计的单链寡核苷酸连接模板——Helper,实现目的片段的特异性连接和产物数量的指数性增长。两个质粒构建实验被用于验证TLCR技术的可行性和应用效果。首先利用TLCR技术从一个未经纯化的含有7种不同大小片段的混杂体系中特异性地将一段1.5 kb的片段捕获进载体,随机抽取的克隆样品经检验准确率达到80%,验证TLCR技术在复杂混合体系中特异性连接DNA片段的可行性和准确性。在另一个质粒构建实验中,TLCR技术从λ噬菌体基因组Hind消化物中将两段总长达27 kb的片段按顺序捕获进载体,随机抽取的克隆样品经检验同样达到了80%的准确率。结果表明,TLCR技术能够简化DNA重组实验的操作,并且适用于多片段和大片段的连接,可以为生物学研究提供便利。
- 周翔达宋晓怀聪孙海燕陈红岩卢大儒
- 关键词：HELPER
- RIT1基因作为治疗脑胶质瘤药物干预靶点的应用
- 本发明属于生物医疗技术领域，具体为一种<I>RIT1</I>基因作为治疗脑胶质瘤药物干预靶点的应用。本发明通过CGGA数据库中的数据对<I>RIT1</I>在中国脑胶质瘤人群样本中的表达量及其高低表达对脑胶质瘤病人预后的...
- 卢大儒陈红岩王煜棋
- 文献传递
- 应用HRM技术对CYP2C19*2和CYP2C19*3进行双重SNP分型被引量：6
- 2013年
- 氯吡格雷是一种广泛用于预防静脉血栓形成的抗血小板药物。研究表明,携带有CYP2C19基因功能缺失型等位基因CYP2C19*2、CYP2C19*3的病人,其体内代谢氯吡格雷成为其活性形式的能力降低,导致氯吡格雷抑制血小板聚集功能减弱。文章旨在建立一种利用高分辨率熔解曲线分析(High-resolution melting curveanalysis,HRM)技术在闭合单管中同时对CYP2C19*2、CYP2C19*3两个多态性位点进行简便、准确分型的方法。本实验针对两个SNP位点分别设计特异性的HRM引物,并在两个位点引物的5′端分别加上富含AT和GC的序列,保证两个位点的扩增产物熔解峰无重叠。利用HRM技术,快速、灵敏地对64例随机DNA样本的CYP2C19*2、CYP2C19*3两个多态性位点进行了基因分型,且HRM方法的分型结果与测序验证结果完全一致。因此,利用HRM技术可以实现在闭合单管中简便、准确地对CYP2C19*2、CYP2C19*3两个多态性位点同时进行基因分型。该方法有望应用于临床,指导氯吡格雷的个体化用药。
- 曹春鸽孙海燕周芳芳王诗铭陈红岩卢大儒
- 关键词：高分辨率熔解曲线分析氯吡格雷SNP分型
- 一种用于检测药物性耳聋相关位点的非标记探针
- 本发明涉及一组用于检测药物性耳聋相关位点的非标记探针。分别针对两个位点设计与突变型序列完全匹配、3’端氨基封闭的非标记探针，通过高分辨率熔解曲线分析(HRM)结合非标记探针，检测嵌入双链DNA的饱和染料EvaGreen荧...
- 卢大儒陈红岩陈弘远丁嘉琦王超
- 胰高血糖素样肽-1及其类似物对糖尿病基因治疗的研究
- 胰高血糖素样肽-1(glucagons-like peptide-1,GLP-1)作为胰高血糖素基因编码的一种胃肠激素,能够促进胰岛β细胞的功能再生和防止其凋亡,明显改善糖尿病人的血糖水平。这对Ⅰ型和Ⅱ型糖尿病的治疗都具...
- 朱青陈红岩卢大儒
- 关键词：糖尿病基因治疗
- 文献传递
- 自发性早产肝功能检测指标全基因组关联分析
- 2023年
- 目的探究自发性早产孕妇全基因组范围内单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与肝功能检测指标之间的联系。方法纳入2018年8月~2020年10月在上海国际和平妇幼保健院成功分娩的344例自发性早产孕妇,利用PLINK和MAGMA软件针对孕妇DNA基因分型数据和肝功能检测指标数据进行全关联研究。结果验证了DNAJB3基因、UGTA1基因簇与中国人群血液中的总胆红素相关,基因ABO与中国人群血液中碱性磷酸酶相关。在中国早产孕妇人群中发现基因MROH2A、ATG16L1与总胆红素的关联,基因ATP8B1、MICAL3、PKHD1、EDAR与早产孕妇人群血液中的γ-谷氨酰转肽酶相关,基因SMAD6、ZNF883、LAMA2与早产孕妇人群血液中的天冬氨酸氨基转移酶相关。另外发现一些基因与自发性早产和肝功能检测指标同时相关。结论中国人群中肝功能检测指标的遗传具有群体差异性,部分基因与自发性早产和肝功能检测指标均显著相关,但其影响机制有待于进一步研究。
- 周方蒋永红陈松长陈红岩卢大儒
- 关键词：全基因组关联分析
- 内质网应激通路基因多态性与非小细胞肺癌含铂化疗的相关性研究
- 非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者占肺癌患者总数的约80%,大多数非小细胞肺癌患者确诊时已到晚期,不适合进行外科手术治疗而主要依靠化疗治疗。以铂类药物为主的联合用药化疗方...
- 彭靖赵雪莹钱吉陈红岩卢大儒
- 关键词：晚期非小细胞肺癌内质网应激单核苷酸多态毒副反应
- 文献传递
- 人染色体8p11(CHRNB3-CHRNA6)区域基因多态性与中国汉族人群肺癌易感性的相关性被引量：2
- 2011年
- 为探讨人染色体8p11（CHRNB3-CHRNA6）区域基因多态性与中国汉族人群肺癌遗传易感性之间的关系,文章采用病例-对照研究,对784例肺癌患者和782例性别、年龄、籍贯频数与之相匹配的健康对照中该区域6个标签SNP位点进行基因分型,并统计分析其基因型频率分布与肺癌易感性的关系,以及吸烟在其中的影响。结果发现rs16891561位点TT基因型在60岁以上人群（校正OR=0.42,95%CI=0.20-0.88;P=0.022）、女性人群（校正OR=0.34,95%CI=0.13-0.87;P=0.025）、非吸烟人群中（校正OR=0.32,95%CI=0.13-0.79;P=0.013）对肺癌发生具有保护效应;rs4236926位点TT基因型在60岁以上人群（校正OR=0.48,95%CI=0.23-0.99;P=0.048）、非吸烟人群（校正OR=0.32,95%CI=0.13-0.80;P=0.014）中对肺癌发生具有保护效应,这两种保护效应主要是与腺癌相关。对这两个位点进行累积效应分析发现,含有3-4个变异等位基因型的非吸烟者罹患肺癌的风险显著降低（校正OR=0.29,95%CI=0.11-0.71;P=0.007）,并且,含有3-4个变异等位基因型的个体累计吸烟量（＂包-年＂平均数=13.2）与其他个体相比显著降低。由此可见人染色体8p11（CHRNB3-CHRNA6）区域基因多态性与中国汉族人群肺癌易感性和吸烟行为相关。
- 张晓博赵振宏陈红岩王久存钱吉杨亚军魏庆义黄建卢大儒
- 关键词：单核苷酸多态性肺癌易感性
