金方
- 作品数：18 被引量：24H指数：3
- 供职机构：贵阳医学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金贵州省社会发展科技攻关计划项目贵州省国际科技合作计划更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学农业科学更多>>
- 新生隐球菌毒力差异基因型菌株间部分毒力相关基因分析被引量：1
- 2014年
- 目的：了解新生隐球菌格鲁比变种（ Cryptococcus neoformans var． grubii）两组毒力差异明显的多位点微卫星型（ multilocus microsatellite typing ， MLMT ）菌株间的差异基因，探讨导致新生隐球菌格鲁比变种间毒力差异的相关基因及这些基因的功能。方法根据已有基因组数据，针对可能为新生隐球菌毒力相关的基因设计特异性引物，扩增并测序，通过序列对比分析每个基因在两组微卫星基因型菌株间存在的单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphisms ，SNPs）位点，并对引起差异的蛋白质进行分析和预测。结果在成功测序的11个基因中，除2个基因序列完全相同外，其余9个基因在两组毒力差异明显的基因型菌株间分别存在1～4个规律性SNPs，其中，有2个基因中存在非同义SNPs（ non-synonymous SNPs ，nsSNPs ），这2个基因的编码产物分别为沉默信息调节因子2家族成员HST302和UV切除修复蛋白RAD23。另外，在对RAD23蛋白的系统发育分析发现，与真菌界的其他门类相比，在担子菌纲的多数RAD23蛋白与人类的同源基因亲缘关系更近。结论本研究发现了新生隐球菌两种毒力差异明显的微卫星基因型菌株间具有重要功能的两个差异基因（ Rad23和Hst302），且经预测nsSNPs对蛋白结构和功能均有一定影响，而蛋白的具体功能有待通过各项试验进一步深入研究。
- 陈玉如赵亮金方李小玲曹煜康颖倩
- 关键词：毒力
- 贵州及广西地区临床新生隐球菌微卫星分型研究被引量：1
- 2013年
- 新生隐球菌（Cryptococcus neoformans）是临床上重要的致病真菌，主要可导致艾滋病、器官移植等免疫抑制患者发生新生隐球菌病。本文采用多位点微卫星基因分型法（MLMT）对贵州及广西地区的新生隐球菌临床株进行分析，同时对不同微卫星型的菌株进行了药物敏感性的比较，以帮助临床上深入认识新生隐球菌的流行病学及发病机制。
- 康颖倩赵亮唐秀文王梅竹曹煜陈玉如金方李小玲牟丽丽
- 关键词：新生隐球菌基因分型法微卫星药物敏感性致病真菌
- 新生隐球菌毒力相关基因的重测序筛选及基因敲除实验研究
- 本研究主要探讨可用于筛选引起新生隐球菌格鲁比变种(Cryptococcus neoformans var.grubii.)毒力差异相关基因的有效方法策略,并从中筛选和验证与毒力相关的差异基因。实验中筛选了毒力差异明显的两...
- 陈玉如赵亮金方牟丽丽刘涛华吕倩王颜颜康颖倩
- 关键词：新生隐球菌毒力基因基因敲除
- 文献传递
- 贵州地区149株白念珠菌25S rDNA基因分型和抗真菌药物敏感性研究
- 目的探讨贵州地区不同来源的临床白念珠菌25S rDNA基因分型与抗真菌药物敏感性的关系。方法本研究收集贵州地区156株形态学鉴定为白念珠菌的菌株,通过ITS基因扩增进行进一步鉴定,采用PCR方法扩增白念珠菌25S rDN...
- 王颜颜王梅竹牟丽丽刘涛华金方李小玲吕倩康颖倩
- 关键词：基因型药敏实验耐药性
- 文献传递
- 贵州贵阳及广西柳州地区新生隐球菌临床株微卫星基因分型对比研究
- 目的：了解贵阳及柳州地区新生隐球菌临床株的种群分布特点及多位点微卫星基因分型(multilocus microsatellite typing,MLMT)规律,探讨微卫星分型与新生隐球菌流行分布的相关性。方法：从贵州贵阳...
- 赵亮唐秀文康颖倩罗红梅金方王梅竹陈玉如
- 粪肠球菌导致两例新生儿肠炎的病原学分析
- 目的通过形态学及分子生物学方法分离及鉴定贵阳某医院新生儿科病房新生儿便血中的病原菌,结合医院诊断,分析新生儿便血原因,辅助临床诊断与治疗:方法1.直接标本涂片镜检观察鉴定;2.采用营养肉汤培养基富集培养,通过形态学观察结...
- 牟丽丽王颜颜刘涛华吕倩金方康颖倩
- 关键词：粪肠球菌耐药
- 文献传递
- 新生儿肠炎粪肠球菌16S rRNA鉴定分析被引量：1
- 2014年
- 目的:分离和鉴定新生儿肠炎患儿便血中的病原菌,结合临床诊断,分析新生儿肠炎病因。方法:对2例新生儿肠炎病例的便血标本进行研究,(1)直接涂片镜检观察鉴定;(2)菌株纯化筛选;(3)采用CTAB提取法提取菌株的DNA,并通过PCR扩增菌株16S rRNA序列,将所获得的序列与Gen Bank数据库进行BLAST比对;(4)采用Kirby-Bauey纸片扩散法进行药物敏感试验。结果:(1)便血标本共分离纯化2株可疑菌株;(2)通过16S rRNA序列与Gen Bank数据库进行BLAST比对,两株菌株的序列与粪肠球菌的相似度达(99%);(3)分离的粪肠球菌对氨苄西林敏感性较高。结论:新生儿肠炎是由粪肠球菌感染引起,标本直接镜检与药敏试验有利于早期诊断及抗生素的合理应用。
- 康颖倩牟丽丽周晓明王颜颜刘涛华金方吕倩
- 关键词：肠炎粪肠球菌
- 新生隐球菌格鲁比变种表型变异菌株的基因及毒力对比研究被引量：1
- 2012年
- 新牛隐球阕（Cryptococcus neofor-mans）属于真菌界担子菌门隐球菌属，是临床上的致病真菌，可致器官移植等免疫抑制患者发生新生隐球菌病。
- 赵亮王梅竹曹煜贺娟金方陈玉如苑天红罗红梅康颖倩
- 关键词：毒力基因表型变种致病真菌隐球菌属
- 中国南方地区马尔尼菲青霉分子流行病学初步研究被引量：3
- 2014年
- 目的分离及鉴定贵州、广西、广东各地临床分离的马尔尼菲青霉(Penicillium marneffei,PM),通过微卫星基因多态性分析进行分子流行病学初步研究。方法从贵州、广西、广东地区临床病人标本中分离马尔尼菲青霉,通过形态学及ITS序列进行鉴定,运用多位点微卫星分型法(multilocus microsatellite typing,MLMT)和SPSS18.0软件对分离的马尔尼菲青霉进行基因多态性及其相关性分析。结果贵州、广西和广东共收集鉴定马尔尼菲青霉临床株50株,3个微卫星位点PMMI、PMMII、PMMIII分别检测到29、9和8种等位基因,50株菌共分为47个微卫星型(PMMT);聚类分析将贵州及广西、广东地区马尔尼菲青霉分为6大类(Cluster1-Cluster 6)。结论贵州、广西、广东地区的马尔尼菲青霉具有较高的基因多态性,我国南方地区相邻省份马尔尼菲青霉的种群基因结构与地域分布之间存在着一定的相关性。
- 赵亮唐秀文王梅竹曹煜牟丽丽金方李小玲陈玉如康颖倩
- 关键词：马尔尼菲青霉菌分子流行病学
- 贵州地区土壤中需氧放线菌的分离鉴定被引量：9
- 2015年
- 为了解贵州土壤需氧放线菌的分布特点、系统发育和物种多样性,采集贵州贵阳、遵义、安顺、铜仁、毕节、黔南、六盘水、黔东南、黔西南9个区域的农耕地、湿地、森林3个类型土壤标本进行需氧放线菌的分离纯化,扩增其16SrDNA基因序列后在GenBank中进行Blast比对分析,并以邻接法构建系统发育树。结果表明:在贵州9个区域108份土壤中分离出173株需氧放线菌,其中链霉菌属(Streptomyces)165株、北里孢菌属(Kitasatospora.)5株、诺卡氏菌属(Nocardioides)2株,在遵义农耕地土壤中分离出链霉菌属潜在新种1株(GYM8-3)。贵州土壤需氧放线菌主要为链霉菌属,在种间水平上存在分类多样性和地域差异性。
- 金方刘涛华牟丽丽吕倩王颜颜康颖倩
- 关键词：链霉菌土壤
