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沈龙珠

作品数：4 被引量：3H指数：1
供职机构：北京工业大学生命科学与生物工程学院更多>>
发文基金：北京市自然科学基金国家教育部博士点基金国家自然科学基金更多>>
相关领域：生物学理学更多>>

合作作者

文献类型

  • 2篇会议论文
  • 1篇期刊文章
  • 1篇学位论文

领域

  • 3篇生物学
  • 1篇理学

主题

  • 3篇蛋白
  • 3篇蛋白质
  • 3篇白质
  • 2篇蛋白质复合物
  • 2篇分子对接
  • 2篇复合物
  • 2篇CAPRI
  • 2篇打分函数
  • 1篇蛋白质-蛋白...
  • 1篇快速傅立叶变...
  • 1篇计算机
  • 1篇计算机模拟
  • 1篇傅立叶变换
  • 1篇OTHER

机构

  • 4篇北京工业大学

作者

  • 4篇沈龙珠
  • 3篇王存新
  • 3篇陈慰祖
  • 3篇李春华
  • 2篇常珊
  • 2篇马晓慧
  • 1篇龚新奇

传媒

  • 1篇物理化学学报
  • 1篇第二届国际理...
  • 1篇第十次中国生...

年份

  • 4篇2006
共 4 条 记 录，以下是 1-4
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排序方式：
针对蛋白质复合物Other类型的打分函数被引量：3
2006年
在不同类型复合物结合界面的物理化学特征不同的基础上,针对较难预测的Other类型复合物设计出特异性打分函数,用于在对接过程中挑选出有效结构.该函数由原子接触能(EACE)、范德华和静电相互作用能组成,通过多元线性回归方法获得各项的权重系数.对来自CAPRIbenchmark1中17个Other类复合物例子进行打分测试.结果表明,组合打分能够刻画出Other类型复合物单体间相互作用的特征,反映出复合物形成前后的能量变化,具备一定的从众多样本中筛选出有效结构的能力.相对于残基成对势(RP),该组合打分获得了更高的打分成功率.对CAPRI第八轮竞赛中两个结构预测模型进行打分排序,该组合打分也体现出强于RP的鉴别有效结合模式潜力.
沈龙珠李春华马晓慧常珊陈慰祖王存新
关键词：打分函数CAPRI
蛋白质-蛋白质对接中打分函数的研究
继人类基因组计划在本世纪初落下帷幕以后，生命科学研究已跨入了后基因组时代，揭示蛋白质结构功能关系和相互作用规律成为新时期的科学主题。广泛深入的学科领域交叉蓬勃发展，已成为后基因组时代生命科学发展的内在要求和发展动力。特别...
沈龙珠
关键词：蛋白质分子对接打分函数蛋白质复合物CAPRI
文献传递
蛋白质-蛋白质分子对接方法的研究
＜正＞蛋白质分子间相互作用与识别是二十一世纪生命科学研究的前沿和热点。细胞内各种重要的生理过程,如基因的复制、转录、翻译以及细胞周期调控和免疫反应等都是以蛋白质分子间相互作用为纽带进行的。分子对接方法是研究分子间相互作用...
李春华沈龙珠龚新奇常珊陈慰祖王存新
文献传递
BESGDOCK:一种有效的蛋白质-蛋白质对接方法
蛋白质分子间相互作用与识别是二十一世纪生命科学研究的前沿和热点。分子对接方法是研究这一课题有效的计算机模拟手段。所谓分子对接，是指已知受体和配体的结构，预测复合物结合模式的方法。本文利用快速傅立叶变换算法发展了考虑生物学...
李春华马晓慧沈龙珠陈慰祖王存新
关键词：分子对接计算机模拟快速傅立叶变换
文献传递
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