李欢
- 作品数：6 被引量：29H指数：4
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- 7号染色体46765080位点SNP与绵羊尾臀性状相关性研究被引量：4
- 2013年
- 绵羊尾(臀)脂性状是重要耐逆性状,其脂肪沉积的分子机制不清。旨在研究绵羊脂尾(臀)沉积脂肪的分子遗传机制,以最近文献报道的7号染色体一处SNP位点为候选分子标记,利用PCR-RFLP方法检测该位点在尾型极端差异的阿勒泰羊、哈萨克羊、湖羊、中国美利奴细毛羊以及萨福克羊群体中的多态性,并采用模型分析其与尾(臀)脂性状的相关性。结果表明,7号染色体46765080位点的G等位基因高频出现在表型分值较高的臀脂型阿勒泰羊群体中,A等位基因在长瘦尾绵羊品种中高频出现;等位基因频率G/A的比值与尾臀表型分值相关性模型表明G/A比值随着尾臀表型分值增加呈指数增长。以上结果表明,绵羊7号染色体46765080位点在尾(臀)脂与瘦尾绵羊群体中分布存在显著性差异,该SNP位点可作为一个理想的分子标记应用于高、低脂绵羊品种选育。
- 梁耀伟张伟沈敏李欢高磊杨井泉刘守仁甘尚权王新华
- 关键词：阿勒泰羊
- X染色体60149273位点在脂尾(臀)和瘦尾绵羊品种中的多态性及其基因定位被引量：13
- 2013年
- 【目的】研究绵羊X染色体60149273位点在不同沉脂尾型绵羊品种中的多态性,为解析绵羊尾脂沉积性状的遗传机制提供基础数据。【方法】首先,采用PCR-SSCP分型方法检测X染色体60149273位点在不同脂尾类型绵羊品种的多态性,并借助PCR产物直接测序的方法确认各基因型相应序列,利用卡方检验的方法检测各基因型分布在不同品种中的平衡性。其次,利用生物信息方法将该SNP定位与绵羊androgen receptor(AR),并使用电子克隆的方法克隆出绵羊AR全长编码序列。同时以阿勒泰羊臀部脂肪RNA为材料,采用RT-PCR的方克隆绵羊AR第3—8外显子序列,利用生物信息学方法分析序列同源性以及序列的物种进化保守性。【结果】①PCR-SSCP结果显示,在脂尾(臀)型绵羊品种阿勒泰羊和湖羊群体中X染色体60149273位点未检出多态性,GG基因型占100%;而瘦尾(臀)型绵羊品种中国美利奴和萨福克羊群体中则出现了多态性,GG基因型分别下降至10%和21%。②利用比较基因组学首次电子克隆出该SNP所属基因AR的全长编码区,并从阿勒泰羊臀脂mRNA中成功扩增羊源AR第3—8外显子片段,测序结果与电子克隆序列完全一致。③物种同源性比对进一步显示,AR在哺乳类动物中高度保守,哺乳动物各物种间同源性高达90%;进化树分析结果显示,牛、绵羊、海豚和猪等哺乳动物亲缘较近。【结论】首次发现绵羊AR第3内含子一处SNP在脂尾(臀)与瘦尾绵羊品种中存在较大差异,该SNP将可作为一个分子标记运用于低脂绵羊新品种的培育,同时该SNP所属AR也可作为一个重要候选功能基因应用于绵羊尾(臀)脂沉积分子机制的相关研究。
- 甘尚权沈敏李欢梁耀伟杨井泉高磊刘守仁王新华
- 关键词：阿勒泰羊多态性标记基因
- 绵羊X染色体59194976位点多态分析及其与尾(臀)脂性状相关性研究被引量：6
- 2013年
- 尾脂沉积能力在脂尾型绵羊和瘦尾型绵羊间存在很大的差异,但其沉积脂肪的遗传特性与分子机制仍不明晰。为此,本研究选择尾型极端差异的阿勒泰羊(巨型脂臀)、湖羊(短脂尾)和黑萨福克羊(长瘦尾),采用PCR-RFLP方法检测绵羊X染色体59194976位点多态性,分析其与尾(臀)脂沉积能力的相关性。结果表明:在阿勒泰羊群体中G等位基因属优势等位基因,其两等位基因比值(G/A)分别是湖羊和黑萨福克羊的6倍和68倍,且G等位基因在阿勒泰羊中趋于纯合。卡方检验结果表明,阿勒泰羊在该位点均处于HardyWeinberg平衡状态(p>0.05),而湖羊和黑萨福克羊在该位点均处于Hardy-Weinberg极不平衡状态(p<0.01)。以上结果提示,绵羊X染色体59194976位点SNP可作为理想的分子标记应用于高、低脂绵羊品种选育。
- 王世银张伟张伟张伟沈敏李欢梁耀伟杨井泉高磊
- 关键词：等位基因基因型分子标记
- 绵羊X染色体59571364与59912586位点在脂尾、瘦尾绵羊群体中的多态性检测及分析被引量：10
- 2013年
- 为了探讨绵羊X染色体上两处SNP(59571364和59912586)与绵羊尾脂沉积性状的关系,继而为利用分子标记辅助选择育种技术培育低脂绵羊品种提供依据,文章以尾型极端差异的阿勒泰羊、湖羊、中国美利奴细毛羊以及萨福克羊为研究对象,利用PCR-RFLP检测两位点在群体中的多态性,并分析了两个SNP位点在阿勒泰羊群体中的单倍型。结果表明:59571364位点的TT基因型和59912586位点的GG基因型在瘦尾中国美利奴与萨福克羊群体中属于优势基因型,而两种基因型在脂尾(臀)阿勒泰羊与湖羊群体中比率均不足2%;两位点在阿勒泰羊群体中的单倍型分析结果显示,CA单倍型为主单倍型,比率高达55%,CA与TA两单倍型约占88.33%。以上结果提示,绵羊X染色体59571364与59912586位点在脂尾(臀)与瘦尾绵羊群体中分布存在较大差异,可作为理想的分子标记应用于高、低脂绵羊品种选育。
- 张伟张伟张伟沈敏李欢高磊梁耀伟杨井泉刘守仁
- 关键词：阿勒泰羊SNP位点多态性
- 绵羊X染色体59578440位点多态分析及其与尾(臀)脂性状相关性研究被引量：2
- 2013年
- 【目的】检测绵羊X染色体59578440位点在尾型极端差异的阿勒泰羊、湖羊和中国美利奴细毛羊群体中的多态性,并验证该位点是否可作为一个有效的分子标记应用于低脂绵羊新品种培育。【方法】采用PCR-RFLP方法进行SNP分型,并使用卡方检验的方法验证各基因型在群体中的Hardy-Weinberg平衡性。【结果】扩增出了含绵羊X染色体59578440位点SNP的296 bp片段,经AatⅡ核酸内切酶酶切分型后鉴定出了三种基因型(CC、TT和TC)。C/T等位基因的比值显示阿勒泰羊群体中C等位基因属优势等位基因。【结论】X染色体59578440位点SNP可作为阿勒泰羊选育的一个实用性分子标记。
- 甘尚权张伟张伟沈敏李欢梁耀伟杨井泉高磊刘守仁
- 关键词：等位基因基因型分子标记
- 绵羊X染色体59383635位点多态性与脂尾性状的相关性分析被引量：20
- 2013年
- 脂尾(臀)性状是绵羊逆境生存的必要性状,其脂肪在尾臀部大量沉积的遗传特性与分子机制仍不明晰。为此,文章以筛选的X染色体59383635位点SNP为候选分子标记,利用PCR-SSCP技术检测该位点在我国尾型极端差异的阿勒泰羊、小尾寒羊、湖羊、中国美利奴细毛羊以及引入品种萨福克羊群体中的多态性,并采用模型分析其与尾(臀)性状的相关性。结果表明,X染色体59383635位点T等位基因高频出现在表型分值较高的阿勒泰群体中,而C等位基因则在瘦尾型绵羊品种中高频出现;等位基因频率T/C的比值与尾臀表型分值相关性模型表明T/C比值随着尾臀表型分值增加呈指数倍增长。以上结果提示,绵羊X染色体59383635位点多态性在脂尾(臀)与瘦尾绵羊群体中分布存在较大差异,该SNP可作为一个理想的分子标记应用于高、低脂绵羊品种选育,但其生物功能仍有待进一步深入研究。
- 甘尚权张伟张伟张伟沈敏李欢杨井泉梁耀伟高磊
- 关键词：阿勒泰羊多态性基因型
