屈志鹏
- 作品数：16 被引量：86H指数：6
- 供职机构：西北农林科技大学植物保护学院更多>>
- 发文基金：长江学者和创新团队发展计划高等学校学科创新引智计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 小麦条锈菌cDNA文库构建和表达序列标签(ESTs)分析
- 小麦条锈菌引起的小麦条锈病是我国小麦生产最重要的病害之一,利用品种抗病性防治麦类锈病是最为经济而有效的重要措施之一。然而,由于条锈菌毒性变异频繁,新的毒性小种不断出现,往往导致小麦品种抗锈性丧失,这已成为抗病品种应用中突...
- 张永红郑文明王艳飞屈志鹏徐良胜黄丽丽康振生
- 文献传递
- 小麦TaLSD1锌指蛋白基因的电子克隆及序列分析被引量：15
- 2007年
- 采用电子克隆与RT-PCR相结合的技术,在条锈菌(Pucciniastriiformis f.sp.tritici)侵染的小麦中克隆了一个LSD1型锌指蛋白基因,命名为TaLSD1(GenBank登录号为EF553327)。序列分析表明,该基因全长1024bp,编码生成1个包含3个保守LSD1型锌指结构(CxxCxRxxLMYxxGASxVxCxxC)且长度为146个氨基酸的多肽。进化树分析表明,TaLSD1与水稻(Oryza sativa)、拟南芥(Arabidopsis thaliana)和芜菁(Brassica rapa)中部分含有3个保守LSD1型锌指结构的同源基因亲缘关系较近,而与其它包含不同数目的LSD1型锌指结构基因亲缘关系较远。推测TaLSD1在进化中丢失了部分序列,进而执行新的功能。半定量RT-PCR结果显示,该基因在亲和以及非亲和组合中的表达模式很相似,均表现在前期基因表达被抑制而后期恢复正常。初步推测TaLSD1在转录水平上的表达受光诱导,同时,作为一个细胞程序性死亡的负调控因子在小麦与条锈菌互作过程中起作用。
- 黄新杰郭军屈志鹏黄丽丽康振生
- 关键词：条锈菌电子克隆半定量RT-PCR
- 小麦与条锈菌非亲和互作的cDNA文库构建及表达序列标签分析
- ＜正＞小麦条锈病是一种重要的世界性的小麦叶部病害,培育抗病品种是控制小麦条锈病的经济有效的途径。然而,大面积推广种植单一抗病品种又常常促使条锈菌新小种的产生和发展,而最终导致小麦品种抗病性的“丧失”,目前这一状况已成为抗...
- 王艳飞屈志鹏张永红马金彪郭军韩青梅黄丽丽康振生
- 文献传递
- 小麦与条锈菌亲和互作的抑制性差减杂交文库构建及ESTs分析
- ＜正＞由条锈菌（Puccinia striiformis f．sp．tritici）引起的小麦条锈病,是一种广泛流行的世界性病害。感病品种的大面积种植、条锈菌生理小种毒性变异和高湿凉爽的气候条件是病害流行的根本原因。由于...
- 喻修道屈志鹏郭军于秀梅黄雪玲韩青梅黄丽丽康振生
- 文献传递
- 小麦条锈菌cDNA文库构建和表达序列标签(ESTs)分析(英文)被引量：8
- 2007年
- 小麦条锈菌(Puccinia striiformisf.sp.tritici)是全世界范围内小麦生产上的重要病原真菌,但是对小麦条锈菌的基因组和基因功能却了解甚少。为了促进小麦条锈菌基因组学的发展和大规模基因发现,我们以噬菌体λTrip1Ex2为载体,采用SMART技术构建了小麦条锈菌萌发夏孢子的cDNA文库。原始文库的滴度为1.1×106pfu/mL,平均插入片段长度为750 bp。从文库中随机挑取279个cDNA克隆测序,分析发现这些ESTs的平均GC含量为45.08%。通过聚类分析,279个ESTs拼接成31个contigs和80 singletons。BLASTx分析表明,47%的ESTs与GenBank中报道的功能已知或未知蛋白具有相似性。tBLASTx分析表明12个uniseqs与EST数据库中的序列具有相似性,其中9个是来自担子菌的cDNA文库。几个EST与已知的真菌致病相关基因具有高度相似性。RT-PCR分析了几个基因在小麦条锈菌侵染过程中的表达水平。这些结果为小麦条锈菌夏孢子萌发以及侵染寄主过程中的基因表达研究奠定了很好的分子生物学基础。
- 张永红屈志鹏郑文明王艳飞徐亮胜赵杰黄丽丽康振生
- 关键词：CDNA文库基因表达小麦条锈菌
- 利用cDNA-AFLP技术分析小麦成株抗条锈性差异基因表达特征被引量：16
- 2010年
- 采用cDNA-AFLP技术,对成株抗条锈小麦品种兴资9104在成株期受条锈菌生理小种CY32侵染后5d内9个时间点的基因表达谱进行了分析。共筛选64对引物,产生32320个转录本(TDF);用37对引物检测到2201个(6.81%)差异TDF,其中926个TDF诱导表达,1275个下调表达。经大规模克隆、测序分析,最终获得330个差异TDF,聚类分析得到259个EST(unigenes),命名为aTaPST1至aTaPST259(GenBank登录号为FL645754～FL646011和FL646262)。经Blastx比对和功能分类分析,其中96条EST(37.07%)未找到同源性匹配,68条(26.25%)与未知功能蛋白同源性较高;其余95条ESTs主要涉及能量(11.20%)、基础代谢(4.63%)、转录调控(3.86%)、抗病与防御(3.86%)、蛋白质运输和储存(3.09%)、蛋白质合成和细胞生长(各2.32%)以及信号转导(1.54%)等。选取抗病与防御、转录调控及信号转导类等相关的6个差异基因,qRT-PCR分析结果显示其表达模式符合cDNA-AFLP表达谱。小麦成株抗条锈性分子机制涉及植物多方面生理生化反应,包括抗病与防御、转录调控、蛋白质代谢、信号转导、以及非生物胁迫等多种途径相关基因的协同控制。
- 张岗董艳玲夏宁张毅王晓杰屈志鹏李依民黄丽丽康振生
- 关键词：小麦条锈菌CDNA-AFLPQRT-PCR
- 三个小麦抗条锈病相关基因的全长cDNA克隆及生物信息学分析
- 本实验室在前期的工作中,构建了受条锈菌生理小种 CY23侵染的小麦品种水源11的抑制性差减杂交文库。对文库中包含的2,606个阳性克隆全部提取质粒后测序,共得到2,167 条高质量的 ESTs。本研究从中挑选了3个感兴趣...
- 黄新杰郭军徐亮胜王晓杰屈志鹏韩青梅黄丽丽康振生
- 关键词：小麦条锈菌生物信息学分析电子克隆
- 文献传递
- 条锈菌诱导的小麦抑制差减杂交文库构建及其表达序列标签研究被引量：32
- 2007年
- 利用抑制差减杂交技术构建了条锈菌(Puccinia striiformis)诱导的小麦叶片cDNA文库。文库质量检测表明:差减杂交效率较高,质量较好。用DNAStar5.0对172条高质量的ESTs进行聚类,共获得120个contigs。对功能已知的contigs分类,能量和初级代谢类占32.5%,其中与光合作用相关的基因出现频率最高;参与膜及转运、抗病与防御的基因分别位于第二、三位;次生代谢、蛋白质合成加工和细胞结构建成的基因较少。通过分析抗病相关基因,初步推测HR和SAR可能为小麦抗条锈病过程中的2种抗性形式。最后利用RT-PCR对4条感兴趣基因进行分析,明确其在抗病过程中的表达模式。
- 于秀梅喻修道屈志鹏韩青梅郭军黄丽丽康振生
- 关键词：小麦条锈菌
- 小麦成株抗条锈性抑制差减杂交文库构建及表达序列标签分析
- ＜正＞由条形柄锈菌（Puccinia striiformis f．sp．tritici）引起的条锈病是世界范围内小麦重要的真菌病害之一, 流行年份常常造成小麦严重减产。国内外大量实践证明,选育并合理利用抗锈病品种是控制小...
- 黄雪玲喻修道屈志鹏王晓杰韩青梅黄丽丽赵杰康振生
- 文献传递
- 小麦与条锈菌非亲和互作的cDNA文库构建及表达序列标签分析被引量：4
- 2008年
- 【目的】了解小麦受条锈菌诱导后的基因表达情况,从分子水平揭示寄主与病原菌非亲和互作机理。【方法】以小麦品种水源11和条锈菌CY23号小种组成的非亲和组合为材料,利用SMART技术构建条锈菌诱导的小麦叶片cDNA文库。随机挑取克隆测序,对其中获得的507条高质量表达序列标签(EST)进行生物信息学分析。【结果】得到原始文库的滴度为1.2×106pfu·ml-1,扩增文库滴度2×109pfu·ml-1,重组率97%,插入片段大小为0.4～3kb。对获得的237个非重复序列进行BLAST分析,已知功能基因大部分与能量代谢、蛋白质合成修饰及加工、转运、信号转导、防卫反应等相关。【结论】该cDNA文库质量较高,信息丰富,获得的已知功能基因中能量和代谢相关约占40%,抗病与防御相关约占17.1%,这些信息有利于在分子水平上研究小麦与条锈菌互作机制,为进一步克隆小麦与条锈菌互作中的相关重要基因及功能分析奠定基础。
- 王艳飞屈志鹏张永红马金彪郭军韩青梅黄丽丽康振生
- 关键词：小麦条锈菌CDNA文库
