孙健
- 作品数:4 被引量:10H指数:2
- 供职机构:河南师范大学生命科学学院更多>>
- 发文基金:河南省杰出青年科学基金河南省高等学校创新人才培养工程国家教育部博士点基金更多>>
- 相关领域:生物学更多>>
- 日本三角涡虫河南八种群基于COⅠ基因片段的分子系统学研究被引量:1
- 2010年
- 对采自河南4大山系8产地的日本三角涡虫线粒体DNA细胞色素C氧化酶Ⅰ亚基(COⅠ)基因进行PCR扩增和测序,用MEGA4.0、PAUP*4.0等程序对所得序列进行分析和系统树重建。结果表明,采自大别山系商城县的两个种群XYshangcheng1和XYshangcheng2的COⅠ片段序列同源性最高,为100%;而采自伏牛山系嵩县的种群LYsongxian与其它7种群的COⅠ片段序列同源性最低,在84.3%~89.0%之间。NJ树、MP树和贝叶斯树拓扑结构完全一致,从系统树上可以看出LYsongxian种群与其它7种群的亲缘关系最远;另外7种群又聚为2支。该聚类结果基本和各种群的山系分布相符合。同时结合基于Hsp70基因的分子系统学研究以及涡虫形态学、细胞遗传学等方面的证据初步推测:LYsongxian种群可能不是日本三角涡虫,而是三角涡虫属另外一个种,该推测是否正确尚待进一步的组织解剖学验证。
- 张合彩孙健陈广文刘德增
- 关键词:日本三角涡虫系统发育树
- 三肠亚目(扁形动物门:涡虫纲:序列目)涡虫系统发育研究进展被引量:5
- 2009年
- 比较分析了基于形态特征和分子序列数据的三肠亚目涡虫的系统发育关系,总结出现今大家公认的该亚目的系统发生关系:Tricladida是一个亚目级阶元,即三肠亚目,隶属于扁形动物门、涡虫纲、序列目.该亚目下分4个次目:海栖次目、陆栖次目、沼栖次目和穴居次目,其中海栖次目是一个单系,为亚目内较原始的类群;沼栖次目是一个并系,其内的三角涡虫科和陆栖次目有最近共同祖先;陆栖次目为单系起源.三肠亚目涡虫的演化路线是由海生到淡水再到陆生,之后又有逆转现象,即个别类群(如Spathula、Romankenkius)又返回淡水生活.文中还对未来该亚目系统发育研究的焦点进行了展望和预测.
- 张合彩陈广文孙健刘德增
- 关键词:涡虫系统发育
- 云南省日本三角涡虫不同地理种群mtDNA COⅠ基因序列分析及其系统发育被引量:4
- 2011年
- 对采自中国云南省的日本三角涡虫(Dugesia japonica)13个地理种群的细胞色素C氧化酶Ⅰ亚基基因(COⅠ)的部分片段进行PCR扩增、克隆和测序,以采自河南省的日本三角涡虫Luoyang种群为外群,用Clustal X 1.80、MEGA 4.0、PAUP*4.0、MrBayes 3.1.1等程序对其进行序列分析和系统树构建。结果表明:13种群的COⅠ基因片段A+T的含量差异很小,稳定在67.1%~68.8%之间,明显高于G+C的含量。序列间的成对遗传距离介于0.000~0.199之间,其中Yuxi、Dali2、Lincang1 3个种群间的遗传距离最小,为0;Puer和Xishuang种群间的遗传距离最大,为0.199。最大简约树和贝叶斯树拓扑结构基本一致,均以较高支持率聚为两支。结合云南省的地形地貌及丰富的水系特征,推测云南省日本三角涡虫可能是中部起源,扩散至边缘,也可能相反。究竟哪种推测更为可靠,尚待进一步研究。
- 张合彩陈广文孙健刘德增
- 关键词:日本三角涡虫系统发育
- 3种提取淡水涡虫基因组DNA方法比较
- 2009年
- 分别用试剂盒法、改良的CTAB法、改良的酚-氯仿抽提法提取活体涡虫和95%酒精固定的涡虫标本的基因组DNA.结果显示:试剂盒法提取的基因组DNA质量最好,主要表现在分子完整,几乎无降解,并且该方法所得DNA的产率也比另外两种方法的产率要高,试剂盒法是最适合涡虫基因组DNA制备的方法.相同起始物质量条件下,3种方法从活体涡虫中提取的DNA量和纯度均高于95%酒精固定的涡虫标本,但试剂盒法提取95%酒精固定半年以上的涡虫标本,所得DNA产率较高、质量较好,可满足PCR扩增等分子生物学实验的要求.
- 孙健张合彩陈广文刘德增
- 关键词:淡水涡虫DNA提取改良CTAB法