李治
- 作品数:23 被引量:37H指数:4
- 供职机构:山西医科大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金山西省教育科学“十一五”规划课题博士科研启动基金更多>>
- 相关领域:医药卫生文化科学生物学更多>>
- 基于生存结局加权多组学数据整合的胶质瘤分子分型
- 2024年
- 目的探讨将生存结局加权的多组学数据整合方法survClust应用于胶质瘤(glioma)数据,以识别具有显著分子异质性和预后差异的胶质瘤分子分型。方法采用survClust方法对中国胶质瘤基因数据库(Chinese glioma genome atlas,CGGA)的胶质瘤多组学数据进行结局加权整合分型,并拟合Cox比例风险模型评估不同分型患者预后。对不同分型间的差异表达基因(DEmiRNAs,DEmRNAs,DMGs)进行筛选,对DEmiRNAs靶基因、DEmRNAs、DMGs的重合基因进行GO功能注释;最后对不同分型患者进行免疫浸润分析。结果survClust将胶质瘤患者分为高危组和低危组,高危组患者的死亡风险是低危组的2.931倍。不同分型差异基因的分布存在差异,共筛选出194个DEmiRNAs,3396个DEmRNAs,1230个DMGs。将189个重合基因进行GO功能注释,得到52条差异具有统计学意义的GO生物项。此外,不同分型在B淋巴细胞、CD4+T细胞、CD8+T细胞、中性粒细胞、巨噬细胞和髓样树突状细胞的免疫浸润水平存在统计学差异。结论结局加权整合算法survClust能够有效识别兼具分子异质性和显著预后差异的胶质瘤亚型,同时基于分型结果筛选出的潜在生物标志物将为胶质瘤的个性化治疗提供科学理论依据。
- 贾聪聪杜港赵鑫师国京房瑞玲李治张岩波曹红艳
- 关键词:分子亚型胶质瘤
- 山西省与全国城市男学生身高曲线拟合后生长趋势对比研究被引量:1
- 2012年
- 运用曲线拟合的方法,将全国和山西省城市汉族6-22岁男学生各年龄段断面的身高数据纵向拟合,选取最佳曲线拟合模型,对优化数据比较分析,揭示其内在的变化规律。结果显示:城市汉族6-22岁男学生身高趋势一致,山西省各年龄学生生长速度高于全国水平,20岁趋于稳定,成年男学生身高均值有降低趋势。
- 巫国贵郎贺李治
- 关键词:身高
- 对基因组内不同序列分布差异进行量化的探讨
- 2014年
- 目的针对DNA词频分析中序列分布问题,探讨对基因组内不同序列的分布差异进行量化的可行性。方法该研究采用数值模拟的方法对Kolmogorov-Smirnov检验的统计量和累积概率曲线下图形的图心进行了比较。结果随着样本含量的增加,两个指标的离散趋势逐渐减小,但其集中趋势并没有受到明显影响,且不同的分布集中于不同的位置;当样本含量为100时,所能判别的最小统计量差异约为0.1,图心差异约为0.02;使用统计量指标时,需采用两个基准分布才能将5个待测分布分开,而图心指标可以直接将5个待测分布分开。结论两个指标都可以看作分布差异的量化指标,但在大多数情况下样本含量应该大于100;当需要在同一坐标系表示不同分布时,图心可能是一个较好的选择。
- 李治崔跃华张岩波
- 关键词:基因组序列数值模拟
- 山西省与全国城市男生身高变化趋势对比分析
- 2012年
- 身高是反映人类不同群体身体形态结构和生长发育水平尤其是纵向发育水平的重要生理指标。分析学生身高生长发育的现状、规律及其有关特征,是学生体质健康状况调查研究不可缺少的重要组成部分。文献资料显示,大面积、权威的体质调查通常为横断面数据资料,
- 巫国贵郎贺刘定一李治
- 关键词:身高
- 侧脑室注射L-硝基-精氨酸甲酯对大鼠运动能力和运动疲劳后下丘脑一氧化氮表达的影响被引量:2
- 2011年
- 一氧化氮(NO)作为一种不同于经典递质的信息传递物质,介导了许多生理过程.在运动中,它对运动系统、心血管系统、免疫系统以及神经系统的功能都有重要影响.一氧化氮合酶(NOS)作为NO的生物合成酶广泛存在于下丘脑[1-4].
- 薛金娟刘鸿宇李治崔建梅
- 关键词:L-硝基-精氨酸甲酯侧脑室注射
- 结构方程混合模型在SNP分析中的应用被引量:1
- 2013年
- 采用结构方程混合模型(SEMM)对实际SNP数据进行分析,为遗传统计学提供一种新的有效的分析方法。本研究的数据是由GAW17提供的,包含697个个体的22条常染色体的上万个SNP和根据这些SNP所模拟的697个个体的性状特点。随机挑选了1号染色体上的4个SNP和3个定量性状作为研究变量,分别进行潜在类别分析和结构方程混合模型分析。根据4个SNP数据,人群被分为3个潜在类别,概率分别为0.53,0.34,0.13。潜在类别1、2和3中的因子均值Q分别为-4.029、-2.052和0,潜在类别1、2的因子均值均低于3(<0.001)。研究表明:结构方程混合模型(SEMM)综合了结构方程模型和潜在类别模型的思想,形成了自己的优势,可用于处理同时包含分类潜变量和连续潜变量的数据。
- 杨圆圆贾志杰李治罗艳虹张岩波
- 低频神经肌肉电刺激联合血流限制训练对手指屈肌力量及形态特征的影响
- 研究目的:本研究旨在探讨低频神经肌肉电刺激(Neuromuscular Electrical Stimulation,NMES)联合血流限制(Blood Flow Restriction,BFR)训练对手指屈肌力量及形态...
- 冯慧文贾谊姚添元韩潇张一凡李鸣曦宋晋亮李治
- 关键词:神经肌肉电刺激握力
- 基于多组学数据的透明细胞肾细胞癌预后分子分型研究被引量:2
- 2022年
- 目的探讨关联-信号-注释增强的相似网络融合(association-signal-annotation boosted similarity network fusion,ab-SNF)方法在透明细胞肾细胞癌(clear cell renal cell carcinoma,ccRCC)多组学数据整合分子分型中的应用,识别ccRCC不良预后患者,研究不同分型患者的潜在致病基因、通路活性及相关免疫浸润细胞。方法从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库中下载ccRCC的miRNA、mRNA表达数据及DNA甲基化数据。利用ab-SNF对ccRCC患者多组学数据进行整合分型;采用Cox回归分析模型研究不同分型患者的预后风险;针对不同分型,筛选差异表达mRNA(DEmRNAs)、miRNA(DEmiRNAs)及差异甲基化基因(differentially methylated genes,DMGs),并对重合基因进行相关分析与基因本体(gene ontology,GO)富集分析;最后对不同分型患者进行免疫细胞浸润和通路活性分析。结果ab-SNF将ccRCC患者分为低危组和高危组,其中高危组患者的死亡风险是低危组的1.903倍;筛选出5218个DEmRNAs,107个DEmiRNAs及2625个DMGs。其中,20个差异表达基因受到DEmiRNA调控,567个基因差异表达的同时伴有异常甲基化;588个重合基因富集于有统计学意义的10个GO生物项。此外,筛选出有统计学意义的6种免疫浸润细胞和9条通路。结论ab-SNF能够有效地识别ccRCC亚型,筛选出的ccRCC潜在致病基因、重要通路及相关免疫浸润细胞,可为ccRCC靶向治疗提供新的参考。
- 魏亿芳李灵梅李治房瑞玲曹红艳曹红艳
- 关键词:分子亚型
- 骨髓间充质干细胞对心肌梗塞修复机制的研究
- 本实验通过对骨髓间充质干细胞分离、培养及诱导分化的研究来检验其向心肌细胞分化的潜能,同时对骨髓间充质干细胞移植治疗心肌梗死的时机及移植细胞的数量作了一定的探讨。
利用ficoll进行密度梯度离心获得间充质干细胞后...
- 李治
- 关键词:间充质干细胞心肌梗死骨髓
- 文献传递
- 基于DNA一级结构中碱基序列分布的DNA分词研究
- 基因组是遗传信息的载体,对于生物性状具有重要影响。基因组即细胞内的全部DNA分子,其功能主要是由其一级结构,即碱基序列来决定。当前越来越多的基因组完成了测序,但基因组功能的解读却并没有获得相应的进展。因此解读这些生命密码...
- 李治
- 关键词:整体性