吴硕
- 作品数：6 被引量：48H指数：4
- 供职机构：中国林科院更多>>
- 发文基金：国家林业公益性行业科研专项引进国际先进农业科技计划河南省科技攻关计划更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 柿EST-SSR引物的开发及筛选被引量：11
- 2012年
- 为丰富柿树SSR引物来源,利用从NCBI下载的9 474条柿属EST序列开发柿EST-SSR引物,并用于分析7个柿品种的遗传多样性。EST序列经去除低质量及冗余片段后拼接成1 390条重叠序列和4 097条无重复序列。共搜索到601条EST序列中含有540个SSR。SSR出现频率为10.96%,其中以2核苷酸为主(61.06%)。利用检出的SSR-ESTs序列设计SSR引物100对,对7个柿样品进行了PCR扩增,31对引物有扩增带,占设计引物的31%,其中14对引物有多态性,占可扩增引物的45.2%。同时发现引物68是临潼板柿的特异引物。引物68的P68-115、P68-160和P68-210处为临潼板柿的3个特异性标记位点,而引物28的P28-225是麻城秋艳的特异性标记位点。
- 吴硕傅建敏乌云塔娜梁玉琴李芳东
- 关键词：ESTSSR标记
- 柿属（Diospyros L.）EST-SSR引物开发
- Simple Sequence Repeat（SSR，简单重复序列）标记由于具有重复性好、多态性高、呈共显性遗传、数量丰富和遍布整个基因组等优点而成为近年来使用最广泛的分子标记之一。传统的SSR标记的开发方法费时费力而且...
- 吴硕
- 关键词：柿属EST-SSR引物设计
- 文献传递
- 柿属植物基因组DNA提取方法比较被引量：21
- 2012年
- 针对柿属植物叶片富含单宁,常规CTAB法提取DNA质量低等问题,为了获得符合柿属植物SSR-PCR扩增要求的DNA,分别采用改良CTAB法和植物基因组DNA提取试剂盒两种方法,提取柿属植物DNA,结果显示:两种方法均可得到满足SSR-PCR扩增要求的DNA;试剂盒较改良CTAB法提取的DNA质量高、杂质少,DNA得率略低,但其操作步骤简单,耗时短,毒害小,因其费用较改良CTAB法高,各实验室可根据自身条件选择适宜方法提取柿属植物DNA。
- 梁玉琴李芳东傅建敏乌云塔娜吴硕
- 关键词：柿属植物DNA提取改良CTAB法
- 华仁杏EST-SSR标记引物设计与开发被引量：2
- 2013年
- 随着生物科技的进步,ESTs(表达序列标签)已经成为开发SSR(简单重复序列)标记的重要资源。本文利用NCBI公共数据库下载蔷薇科EST序列22 458条,使用SSRHunter1.3软件进行了SSR搜索,从中获得22 527条SSR,应用Primer5.0软件设计并经由Oligo7.0软件检测,共得到61对EST-SSR引物。利用这些引物对8个华仁杏品种进行了PCR扩增及检测,得到10对能产生清晰多态性条带的EST-SSR标记,标明了10对引物的序列,为进一步开展华仁杏SSR分子标记辅助育种研究奠定了基础。
- 秦玥傅大立吴硕刘梦培朱高浦赵罕马履一
- 正交设计优化柿属植物SSR-PCR反应体系被引量：17
- 2011年
- 为了快速有效地确定柿属植物SSR-PCR反应体系,给柿属植物遗传多样性的SSR标记研究奠定基础,采用正交设计的方法,利用2×Taq PCR Master Mix,将Taq酶、dNTPs和Mg2+3个因素作为整体,综合评价其对柿属植物SSR-PCR反应体系的影响。结果显示:反应各因素水平对PCR反应均具有显著影响,其中Mix影响最大,引物次之,模板DNA最小;确定柿属植物SSR-PCR反应体系为模板DNA 2μL(40～100 ng)、2×TaqPCR Master Mix 10μL、引物1μL,总体积25μL;反应体系具有较高的重复性和稳定性,筛选出20对多态性较高的柿属植物SSR引物。
- 梁玉琴李芳东傅建敏乌云塔娜吴硕
- 关键词：柿属植物正交设计SSR-PCR反应体系MASTERMIX
- 柿属EST-SSR引物设计及遗传多样性研究被引量：9
- 2012年
- 利用从NCBI上下载的9 474条EST(Expressed Sequence Tags)序列,设计并开发EST-SSR引物,用于柿属种质资源的遗传多样性研究。下载的初始序列拼接成1 390条重叠序列和4 097条无重复序列。用SSRHunter软件搜索到601条EST序列中含有540个SSR。SSR出现频率为10.96%,其中以2核苷酸为主。依据检出的SSR-ESTs序列设计SSR引物100对,对9个柿属(Diospyros L.)种质资源样品进行了PCR扩增,其中42对引物有扩增带,占设计引物的42%,其中30对引物有多态性,占可扩增引物的71.4%。同时发现引物15是美洲柿(雄)的特异引物;引物30是青化北野柿的特异标记;引物69和引物80为美洲柿的特异引物;引物99是无核软枣的特异引物。
- 吴硕傅建敏乌云塔娜梁玉琴
- 关键词：柿属ESTSSR标记
