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向闱
作品数:
1
被引量:9
H指数:1
供职机构:
中国科学院武汉植物园
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发文基金:
中国科学院知识创新工程重要方向项目
国家自然科学基金
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相关领域:
农业科学
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合作作者
黄宏文
中国科学院华南植物园
康明
中国科学院武汉植物园
宁祖林
中国科学院华南植物园
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中国板栗
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2010
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中国板栗EST-SSR信息分析及其通用性
被引量:9
2010年
从已公布的壳斗科(Fagaceae)基因组数据库中获得48501条中国板栗(Castanea mollissima)EST序列,其中8479条EST含有12116个长度大于10 bp的SSR,EST-SSR的出现频率为24.98%。二核苷酸重复和三核苷酸重复是中国板栗EST-SSR最主要的重复类型,分别占总数的38.05%和42.20%。对中国板栗EST-SSR标记在茅栗(C.seguinii)和锥栗(C.henryi)上的通用性检测表明,677对中国板栗EST-SSR引物皆能扩增,证实这些引物在栗属中国特有种间具有很高的通用性。115个位点的多态性分析表明,中国板栗、茅栗和锥栗分别有106、108和101个位点表现出多态性。在575个等位基因中,有260个(45.22%)是3物种的共有等位基因,各物种都有各自特有的等位基因。这项研究为中国栗属植物EST-SSR标记的建立及应用奠定了基础。
向闱
宁祖林
康明
黄宏文
关键词:
中国板栗
EST-SSR
栗属
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