陈静珊
- 作品数：3 被引量：4H指数：1
- 供职机构：广西医科大学第一附属医院更多>>
- 发文基金：广西壮族自治区自然科学基金教育部“新世纪优秀人才支持计划”国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 鼻咽癌患者在放疗过程中鼻咽部细菌群落结构的动态变化被引量：2
- 2017年
- 目的:探索鼻咽癌患者在放射治疗过程中鼻咽部细菌群落结构的动态变化情况。方法:取7例鼻咽癌患者在放疗过程中不同时点的鼻咽拭子样本,利用T-RFLP技术对其鼻咽部菌群结构进行分析。结果:在放疗不同时点的鼻咽拭子样本中共获取115种末端限制性片段(T-RFs),其中以放疗前的数目最多(91种),放疗结束时最少(49种),片段62bp、65bp、77bp、120bp、146bp、253bp、333bp、398bp、400bp、469bp所代表的菌群贯穿于整个放疗周期中。鼻咽部菌群结构随放疗时间变化而改变,至放疗结束时T-RFs数量下降46%,香农指数(H)下降5%,均匀度指数(E)增高5%,辛普森指数(D)变化趋势不明显。结论:放疗可影响鼻咽癌患者鼻咽部菌群的生长,致群落中的T-RFs数目减少,优势细菌分布发生变化,菌群结构多样化程度下降。
- 张勇黄婷婷陈静珊何峰
- 关键词：鼻咽癌细菌群落结构
- 拭子提取黏膜部细菌DNA方法的优化被引量：1
- 2015年
- 目的:探索一种适合于黏膜部微生物组学分析的DNA抽提方法。方法:评价玻璃珠机械破碎法+溶菌酶裂解法结合DNA提取试剂盒法(Beads+Lysozyme+QIA法)和溶菌酶裂解法结合DNA提取试剂盒法(Lysozyme+QIA法)对9例鼻咽拭子和5株常见细菌的DNA提取效果。利用NanoDrop 2000测定DNA的浓度;以末端限制性片段长度多样性(T-RFLP)分析DNA的生态结构多态性。结果:两种方法对鼻咽拭子总DNA提取量无明显差别(P=0.288);T-RFLP结果显示,Beads+Lysozyme+QIA法可得到92种末段限制性片段(T-RF),高于Lysozyme+QIA法所得的43种,Beads+Lysozyme+QIA法SDI为(2.34±0.43)明显高于Lysozyme+QIA法(1.61±1.09)(P=0.03),Beads+Lysozyme+QIA法可以获得更丰富的TRF;Beads+Lysozyme+QIA法在表皮葡萄球菌、金黄色葡萄球菌、大肠埃希菌中可获得更高的DNA提取量(均P<0.05),在甲型溶血性链球菌和枯草芽孢杆菌中两种方法无明显差异(P>0.05)。结论:优化的拭子提取细菌DNA的方法可以更大程度地反映样本中微生物的多样性,减少偏倚;有利于黏膜部微生物组学的研究。
- 明慧馨何峰陈静珊周晓莹杜春平肖雪张哲李萍黄光武
- 关键词：细菌拭子DNA提取
- VEGF-1154G/A基因多态性与EB病毒在鼻咽癌发生中的交互作用研究被引量：1
- 2014年
- 目的探讨广西人群中鼻咽癌的发病与VEGF-1154G/A基因多态性、EB病毒的交互作用。方法选择鼻咽癌的患者197例为病例组,另选择在体检中心进行体检的健康人群197例为对照组,采用病例-对照研究方法分析鼻咽癌发病与VEGF-1154G/A基因多态性、EB病毒的交互作用。结果 VEGF-1154基因型GG、GA+AA在病例组中的频率分别为40.0%、60.0%,在对照组中的频率为55.8%、44.2%,差异有统计学意义(P<0.05)。等位基因A在病例组中的分布(40.4%)明显高于对照组(26.9%)(P<0.05),与等位基因G相比,携带有等位基因A的基因型可增加鼻咽癌的发病风险(P<0.05)。但VEGF-1154等位基因A与EB-VCA-IgA、肿瘤家族史在鼻咽癌的发病过程中无交互作用(P>0.05)。结论 VEGF-1154等位基因A是鼻咽癌发生的风险因素,但其与EB病毒感染、肿瘤家族史在鼻咽癌的发生过程中无交互作用。
- 程小伟姜力陈静珊张勇
- 关键词：单核苷酸多态性EB病毒
