陈昌平
- 作品数：5 被引量：20H指数：2
- 供职机构：西南科技大学计算机科学与技术学院更多>>
- 发文基金：博士科研启动基金国家高技术研究发展计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术生物学更多>>
- 基于生物医学文献的蛋白质关系发现
- 2008年
- 实验提出了一种基于词频统计的蛋白质关系知识发现方法，该方法首先通过生物命名实体识别技术识别出蛋白质实体，然后统计共出现频率，形成候选实体对，从而发现最有可能的实体关联。
- 彭春艳张晖包玲玉陈昌平
- 关键词：知识发现
- 基于DC3算法的非编码区序列最大串联重复识别被引量：2
- 2009年
- 非编码区信息结构分析是目前生物信息学研究的热点之一。运用DC3算法构建的后缀数组以及最长公共前缀(LCP)作为辅助工具构造一个算法,用于对非编码区中存在的重复序列进行搜索,进而研究可能与其相关的功能元件,从而揭示出非编码区的结构信息。通过实验证明其实用性。
- 周文鹃刘自伟陈昌平
- 关键词：非编码区后缀数组
- 基于条件随机域的生物命名实体识别被引量：17
- 2009年
- 提出一种基于条件随机域模型的生物命名实体识别方法,结合单词构词特性以及距离依赖特性,在JNLPBA的GENIAV3.02数据上进行实验,测试结果表明,引入距离依赖后,系统的识别性能比只利用单特性的条件随机域方法提高2.54%,可获得较好的识别效果,提高了系统的识别效率。
- 彭春艳张晖包玲玉陈昌平
- 关键词：条件随机域隐马尔科夫模型
- 串联重复序列识别方法研究被引量：1
- 2008年
- 非编码区重复序列分析在基因组研究中起着重要作用，其基础就是在非编码DNA序列中识别和定位所有的重复结构。重复序列识别问题在计算机科学中主要体现为字符串匹配问题。在分析了后缀树和后缀数组字符串匹配算法的基础上，详细阐述了基于后缀数组的精确串联重复序列识别方法。实验表明，该方法适合用于非编码DNA序列分析。
- 陈昌平刘自伟周文鹃彭春艳
- 关键词：串联重复序列后缀树
- X染色体NC-DNA结构分析
- 随着人类基因组计划的顺利完成，生物信息学成为开启后基因组时代的“金钥匙”，其任务就是读懂人类基因组，这一研究的关键就是了解非编码区的信息结构。因此，分析非编码区信息结构是基因组分析的重要内容，已成为生物信息学研究的前沿课...
- 陈昌平
- 关键词：串联重复序列X染色体人类基因组计划
- 文献传递
