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闫鹏程

作品数：10 被引量：11H指数：2
供职机构：北京市计算中心更多>>
发文基金：国家高技术研究发展计划国家自然科学基金北京市自然科学基金更多>>
相关领域：医药卫生生物学自动化与计算机技术农业科学更多>>

合作作者

文献类型

  • 5篇期刊文章
  • 3篇专利
  • 1篇会议论文
  • 1篇科技成果

领域

  • 5篇医药卫生
  • 2篇生物学
  • 2篇自动化与计算...
  • 1篇农业科学

主题

  • 6篇生物信息
  • 3篇生物信息学
  • 3篇基因
  • 2篇调度
  • 2篇生物信息学技...
  • 2篇数据库
  • 2篇转录
  • 2篇转录组
  • 2篇字符
  • 2篇作业调度
  • 2篇扩展性
  • 2篇脚本
  • 2篇服务层
  • 2篇服务平台
  • 2篇高通量
  • 2篇高通量测序
  • 2篇测序
  • 1篇代谢
  • 1篇代谢组学
  • 1篇序号

机构

  • 10篇北京市计算中...
  • 2篇中国疾病预防...
  • 1篇中国林业科学...
  • 1篇北京市理化分...
  • 1篇广西壮族自治...

作者

  • 10篇闫鹏程
  • 7篇陈禹保
  • 4篇吴一雷
  • 3篇陈超
  • 3篇黄劲松
  • 3篇谢威
  • 2篇刘彤
  • 2篇侯召玲
  • 2篇于伟文
  • 2篇裴智勇
  • 2篇杜鹏程
  • 2篇陈晨
  • 1篇张占江
  • 1篇王海印
  • 1篇张媛媛
  • 1篇张雯
  • 1篇李国锐
  • 1篇张静
  • 1篇赵勇
  • 1篇安云鹤

传媒

  • 3篇中国生物工程...
  • 1篇中国预防医学...
  • 1篇中华肾病研究...

年份

  • 1篇2018
  • 2篇2017
  • 1篇2015
  • 2篇2014
  • 2篇2013
  • 2篇2012
共 10 条 记 录，以下是 1-10
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排序方式：
基于BLAST的分布式基因序列比对方法
本发明涉及计算机和生物信息学技术领域，公开了一种基于BLAST的分布式基因序列比对方法，包括：S1、程序对用户参数进行解析，并确定MPI线程个数，读取查询序列文件，根据任务个数分割查询序列，每个MPI线程读取各自的MPI...
吴一雷闫鹏程刘充李国锐陈禹保黄劲松谢威
文献传递
基于生物信息云平台的作业调度方法
本发明公开了一种基于生物信息云平台的作业调度方法，涉及云平台构建技术领域，包括以下步骤：S1：表达层传输参数字符流至服务层；S2：根据所述参数字符流中的参数变量及参数字符流头部的程序名称生成以程序命名的参数文件；S3：最...
吴一雷闫鹏程陈超侯召玲黄劲松谢威
文献传递
miRDOA:集数据存储与在线分析于一体的综合型microRNA数据库
2014年
miRNA(microRNA)是一类小的非编码RNA,普遍存在于动物、植物等多个物种中,研究表明在原生生物以及病毒中也有miRNA。miRNA在生物的成长、发育、细胞凋亡、神经紊乱、癌症等多个方面都起到至关重要的作用,miRNA还可作为Biomarker应用于癌症等疾病的诊断和治疗。miRDOA(miRNA Database and Online Analysis)数据库存储了二百多个物种的miRNA相关信息,提供了基本的浏览和搜索功能。用户可以通过物种来浏览miRNA相关数据,也可以通过miRNA、靶基因或者序列进行检索。除此之外,miRDOA还提供了在线分析模块,主要对高通量测序数据进行初步分析,在此基础上,添加了靶基因预测、表达谱数据差异分析,以及在线BLAST功能。miRDOA是一个完全免费的开源的数据库网站,并实时更新。
李俊娥贾利鹃闫鹏程闫学青谢国云陈禹保
转录组从头组装软件比较
高通量的转录组测序(RNA-seq)在模式和非模式物种的研究中已开始得到广泛应用。然而，在没有参考基因组序列的情况下，将海量的转录组短序列组装成正确的基因集面临很大困难。如今，已经出现不少针对转录组组装的工具。本研究利用...
闫鹏程曾艳飞陈禹保
关键词：高通量测序转录组测序
利用系统进化树对H7N9大数据预测传播模型的评估被引量：7
2014年
活禽贸易和H7N9禽流感病毒传播之间存在关联,应用大数据技术分析活禽交易网络数据,可进行疫情溯源并预测未来传播趋势。从流感研究数据库中获取了截止至2013年分离得到的H7N9毒株的血凝素基因核酸序列,构建系统进化树推断2013年上半年疫情中H7N9在各省及城市间的传播情况,并与大数据推断结果进行对比分析。结果表明,系统进化树推断结果更为准确,但大数据分析能够提供更多地区的信息且具有更好的时效性,同时推断的传播模型准确度较高,在H7N9疫情的应对中具有较高的应用价值。
杜鹏程于伟文陈禹保闫鹏程安云鹤陈晨
关键词：系统进化树大数据
生物信息学技术及其在肾脏病研究中的应用被引量：2
2017年
高通量组学技术的快速发展获得了海量不同类型的生物分子数据。生物信息学技术的快速发展则帮助我们可以深入解读如此庞大的数据,理解生命或疾病发生过程中潜在的分子机制。高通量组学技术与生物信息学技术已经在肾脏病研究中得到了广泛应用,帮助我们更好地理解肾脏病发生的遗传基础和背后的生物学过程。随着高通量组学技术和生物信息学技术的快速发展,多种组学数据的整合生物信息学分析将为肾脏病的病理过程、早期诊断及治疗决策研究提供帮助。本文中,主要讨论生物信息学技术与高通量组学技术应用的进展,并以多种肾脏病研究为例介绍了相关方法的应用。
陈禹保闫鹏程
关键词：生物信息分析基因组学转录组学代谢组学肾脏病
病原菌特异基因数据库系统的开发及应用
2013年
利用前期研究获得的病原菌各分类水平特有同源基因,构建了病原菌特异基因数据库,采用四层架构模型和单向依赖结构构建了在线展示及查询系统,为科研工作者提供了病原菌特异基因基础数据。可通过简洁直观的方式进行查询和展示,为分型位点筛选、检测芯片设计、核心基因组研究等工作提供相应位点选择依据,为病原菌相关研究工作提供了便捷工具,可加快相关病原菌检测和分型方法的建立。在目前新型病原菌不断出现、治疗愈加困难等越来越严峻的传染病预防控制形势下,具有重要应用价值和现实意义。
陈晨杜鹏程吴一雷王海印张雯闫鹏程张媛媛陈禹保于伟文
关键词：病原菌特异基因数据库
基于生物信息云平台的作业调度方法
本发明公开了一种基于生物信息云平台的作业调度方法，涉及云平台构建技术领域，包括以下步骤：S1：表达层传输参数字符流至服务层；S2：根据所述参数字符流中的参数变量及参数字符流头部的程序名称生成以程序命名的参数文件；S3：最...
吴一雷闫鹏程陈超侯召玲黄劲松谢威
药用植物保育云服务平台设计与实现被引量：2
2017年
药用植物资源是中医药事业和生物医药产业赖以生存和发展的重要资源,同时也是我国的中医药文化遗产的载体。而药用植物资源的保育工作是药植资源可持续性开发与应用的基础。随着生物信息学与信息化技术的快速发展,利用包括云计算在内的新兴信息化技术,在传统种质资源保护与管理等方面的应用越来越多,然而,在药用植物资源保育方面还有待开发与应用。利用云计算、数据库应用及生物信息学等相关技术,对我国药用植物资源的保育数据进行信息化及平台建设,构建药用植物保育云服务平台系统。该系统通过收集、整理和加工药用植物资源信息,开展药用植物数据信息化与应用开发,完成药用植物保育云服务平台,可提供药用植物保护及新物种培育等方面信息查询服务。该平台对于药用植物研究相关的数据标准化、保育学科研究,以及信息共享与服务,具有较为重要的应用价值与社会意义。
闫鹏程张占江裴智勇付延婷陈禹保刘彤
关键词：药用植物保育WEB应用生物信息学
基于高性能计算的生物医药数据服务关键技术及应用
赵勇陈禹保刘彤刘光明缪剑华裴智勇闫鹏程张占江陈超菅晓东李晓刘满姣孟祥飞卜祥霞张静
该成果属于计算机与现代服务业。 1.研究目的：随着生物科技和医疗技术的迅猛发展，以及高通量测序技术的成熟，生物医药领域的数据量急剧增加且数据类型复杂。该研究将高性能计算、大数据分析技术与生物医药应用进行深度耦合，以“云+...
关键词：
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