钟小娟
- 作品数：10 被引量：16H指数：3
- 供职机构：吉首大学生物资源与环境科学学院更多>>
- 发文基金：湖南省重点学科建设项目湖南省高校科技创新团队支持计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学轻工技术与工程更多>>
- 小溪自然保护区非盐环境土壤嗜盐和耐盐菌多样性研究
- 从湖南小溪国家级自然保护区采集非盐环境(ordinary non-saline environment)土壤样品,用纯培养法(culture-dependent method)分离其中的嗜盐和耐盐原核生物,进而采用基于1...
- 陈奇辉刘祝祥刘荷李洪军钟小娟贺建武陈义光
- 栉江珧相关细菌抗菌活性筛选及系统发育分析被引量：2
- 2013年
- 采用8种敏感指示菌(革兰阳性和阴性菌各3株,真菌2株),利用琼脂扩散法,对分离自南海硇洲岛潮汐带栉江珧(Atrina pectinata)样品的细菌进行抗菌活性筛选,并对具有较强生物活性的菌株进行系统发育分析和生物学特征观察。结果显示,125个分离菌株中,有18株的发酵液具有抗菌活性,占受试菌种总数的14.4%,其中6株(JSM 112006、JSM 114095、JSM 114060、JSM 112019、JSM 114054、JSM 114093)具有较强的抗菌活性。基于16S rRNA基因序列的系统发育分析表明,这些活性菌株类群多样性较高,分属于4个属:菌株JSM 112006属于Marinobacter属;JSM 114095属于Halomonas属;JSM 114060和JSM 112019属于Salinivibrio属;JSM 114054和JSM 114093属于Staphylococcus属。研究结果表明,南海硇洲岛潮汐带栉江珧分离菌株中存在一定比例的抗菌活性菌株,且这些细菌具有较为丰富的类群多样性。
- 朱泓溢肖建青刘祝祥刘荷李洪军贺建武钟小娟陈义光
- 关键词：栉江珧抗菌活性系统发育分析
- 德夯风景区嗜盐及耐盐菌抗菌活性筛选及生物学特征
- 以8个敏感菌株(革兰阳性3株、革兰阴性3株、真菌2株)作为指示菌,采用琼脂扩散法对294株分离自德夯风景区的森林、耕作及溪流等普通非盐环境(ordinary non-saline environment)土壤的嗜盐及耐盐...
- 刘荷李洪军钟小娟程金莲陈义光
- 关键词：抗菌活性筛选生物学特性系统发育分析
- 文献传递
- 酒鬼酒发酵车间空气源细菌产酯酶活性菌株筛选及多样性分析被引量：3
- 2015年
- 采用平板水解圈法(plate hydrolysis spot method)对分离自酒鬼酒发酵车间空气的细菌进行产酯酶活性菌株筛选,采用基于16S r RNA基因序列的分析方法对高酶活菌株进行系统发育多样性分析。结果表明,73个受试菌株中,有51株酯水解酶活性菌株呈阳性,占受试菌株的69.9%。其中有9株(JSM 2215018、JSM 2215021、JSM2215027、JSM 2215104、JSM 2215109、JSM 2215116、JSM 2215117、JSM 2215126、JSM 2215132)具有较强的酯酶活性。系统发育分析表明,这9株菌属于细菌域(Eubacteria)的4个大的系统发育类群(Actinobacteria,DeinococcusThermus,Firmicutes,Proteobacteria)的8个科(Bacillaceae,Deinococcaceae,Microbacteriaceae,Micrococcaceae,Moraxellaceae,Nocardiaceae,Rhodobacteraceae,Xanthomonadaceae)的8个属:JSM 2215018属于Microbacterium属;JSM 2215021属于Arthrobacter属;JSM 2215027属于Bacillus属;JSM 2215104属于Xanthomonas属;JSM 2215109属于Deinococcus属;JSM 2215116属于Acinetobacter属;JSM 2215117和JSM 2215132属于Paracoccus属;JSM2215126属于Rhodococcus属。研究结果表明,酒鬼酒发酵车间空气源细菌存在较高比例的产酯酶菌株,且这些菌株具有较高的类群多样性。
- 刘荷黎有有程金莲樊林钟小娟余冰李洪军刘祝祥陈义光
- 关键词：微生物系统发育分析
- 硇洲岛潮汐带牡蛎相关可培养细菌多样性被引量：5
- 2013年
- 【目的】了解南海硇洲岛潮汐带香港巨牡蛎(Crassostrea hongkongensis)相关可培养细菌的多样性。【方法】应用纯培养法分离样品中的细菌(含放线菌),采用基于16S rRNA基因序列的系统发育分析方法研究这些分离菌株的生物多样性。【结果】用补充0–25%(W/V)NaCl的MA、MH和NA培养基从样品中分离到102株细菌,在形态观察和部分生理生化实验结果的基础上去冗余,选取74个代表性菌株进行基于16S rRNA基因序列的系统发育分析。结果表明,这些菌株归为38个物种,属于4个大的系统发育类群(Gamma-Proteobacteria,Alpha-Proteobacteria,Bacteroidetes,Firmicutes)的16个科、18个属。大多数菌株属于Gamma-Proteobacteria亚门(45株,60.8%),其余依次是Firmicutes门(12株,16.2%)、Bacteroidetes门(11株,14.9%)和Alpha-Proteobacteria亚门(6株,8.1%)。大多数菌株与其系统发育关系最密切的有效发表种典型菌株之间(16S rRNA基因序列相似性为94.3%–99.8%)存在一定的遗传差异,其中JSM 111069可能代表Carnobacteriaceae科的潜在新属;菌株JSM 111039和JSM 111085可能分别代表Bacillus属的两个新物种,菌株JSM 111020、JSM 111072和JSM 111090可能分别代表Pseudoalteromonas、Proteus和Idiomarina属的新物种。【结论】南海硇洲岛潮汐带牡蛎中存在较为丰富的原核生物多样性,并潜藏着一定数量的微生物新类群(物种)。
- 肖建青朱泓溢刘祝祥刘荷贺建武李洪军钟小娟李文均陈义光
- 关键词：香港巨牡蛎RRNA基因系统发育分析细菌多样性
- 海洋沉积物原核微生物多样性研究进展被引量：2
- 2013年
- 海洋占地球表面积的71%,蕴藏着丰富的生物资源。随着人类探索自然的能力不断增强,海洋已不是神秘、变化莫测及人类难以驾驭的象征。由美国斯隆基金会（Sloan Foundation）发起的首次国际海洋生物普查计划（Census of Marine Life, CoML）表明,海洋环境中还有大量新的物种[1],该计划把世界海洋归纳为人类活动的边缘、隐藏的边界、中央水域、活跃的地质带、冰冷的海洋和微生物这六大领域,其中微生物作为调查难度最大的领域[2],同时也是充满大量新物种和稀有物种的领域。海洋沉积物拥有非常复杂的类型,是海洋微生物重要的栖息场所。海洋沉积物是指通过海流搬运、波浪和重力等动力搬运过程而沉积、覆盖、堆积在海底的泥、沙等无机物质和生物残骸等有机物的统称[3]。丰富的海洋环境孕育着不同种类的海洋沉积物,这些沉积物既包括受海洋潮汐、波浪和海流等海洋过程形成的滨海海岸带沉积,也包括由海洋生物成分（钙质及硅质）及非生物成分（陆源、自生、海底火山、宇宙尘埃等）[4]。事实上海洋沉积物的多样性在决定海洋环境物种数量和影响深海物种多样性等方面都起到了非常重要的作用[5]。作者统计近10年（2000年-2010年）来,微生物科学家从海洋沉积物（marine sediments）中鉴定并在《Int J Syst Evol Microbiol》、《Appl Environ Microbiol》、《Syst Appl Microbiol》、《FEMS Microbiol Lett》、《J Microbiol》、《J Mi-crobiol Biotechnol》等国际微生物权威杂志上有效发表约的160余种原核微生物。物种作为生物多样性的基本度量单位,这些海洋沉积物中微生物新物种的不断发现,是对海洋微生物资源多样性的有力扩充。
- 贺建武刘祝祥刘荷李洪军钟小娟陈义光
- 关键词：微生物多样性海洋沉积物原核微生物MARINE海洋环境
- 硇洲岛牡蛎相关细菌抗菌筛选及系统发育分析
- 2015年
- 以8个敏感菌株作为指示菌,采用管碟法对分离自湛江硇洲岛(20°52'N^20°56'N,110°33'E^110°38'E)潮汐带香港巨牡蛎(Crassostrea hongkongensis)中的72株细菌的发酵液进行抗菌筛选,并对阳性菌株进行基因组DNA提取、16S rRNA基因PCR扩增和序列测定,继而进行系统发育分析。抗菌实验结果表明,受试菌株中有23株菌的发酵产物具有抗菌活性(阳性率31.9%),其中有5个菌株(JSM 111024、JSM 111027、JSM111029、JSM 111076、JSM 111083)具有较强的抗菌活性。基于16S rRNA基因序列的系统发育分析表明,这23株菌具有较高的类群多样性和物种多样性,属于3个系统发育群/门(Alpha-Proteobacteria、Gamma-Proteobacteria、Bacteroidetes)中的8个科(Aeromonadaceae、Flavobacteriaceae、Halomonadaceae、Idiomarinaceae、Phyllobacteriaceae、Pseudoalteromonadaceae、Shewanellaceae、Xanthomonadaceae)的8个属(Idiomarina、Halomonas、Myroides、Nitratireductor、Oceanimonas、Pseudoalteromonas、Shewanella、Wohlfahrtiimonas),可分为11个物种。优势类群为Gamma-Proteobacteria亚门(14株),其中优势属为Oceanimonas属(6株);第二大类群为Bacteroidetes门(7株),都属于Flavobacteriaceae科的Myroides属。具有较强抗菌活性的5个菌株中,有4个菌株(JSM 111024、JSM 111027、JSM 111029、JSM 111083)属于Alpha-Proteobacteria亚门Phyllobacteriaceae科Oceanimonas属,而菌株JSM 111076属于Gamma-Proteobacteria亚门Aeromonadaceae科Nitratireductor属。
- 肖建青樊林赵湖余冰易旻程金莲李洪军钟小娟陈义光
- 关键词：抗菌活性筛选系统发育分析
- 发酵车间空气源细菌淀粉酶产生菌筛选及多样性分析被引量：5
- 2015年
- 采用平板水解圈法(plate hydrolysis spot method)对分离自酒鬼酒发酵车间空气样品的细菌进行淀粉酶产生菌筛选,运用基于16S rRNA基因序列的分析方法对高酶活菌株进行系统发育多样性分析。结果表明,73个受试菌株中,有23株为淀粉酶产生菌,占受试菌株的31.5%,其中有9株为高酶活菌。23个淀粉酶产生菌类群多样性和物种多样性较高,属于4个大的系统发育类群(Actinobacteria、Deinococcus-Thermus、Firmicutes、Proteobacteria)中的10个科(Bacillaceae、Deinococcaceae、Intrasporangiaceae、Microbacteriaceae、Micrococcaceae、Nocardiaceae、Propionibacteriaceae、Pseudomonadaceae、Rhodobacteraceae、Xanthomonadaceae)的13个属,可分为21个物种。进一步分析表明,9株高酶活菌属于细菌域(Eubacteria)的4个大的系统发育类群(Actinobacteria、Deinococcus-Thermus、Firmicutes、Proteobacteria)的7个科(Bacillaceae、Deinococcaceae、Micrococcaceae、Microbacteriaceae、Nocardiaceae、Rhodobacteraceae、Xanthomonadaceae),归属于8个属。研究结果表明,酒鬼酒发酵车间空气源细菌存在较高比例的淀粉酶产生菌,且这些菌株具有较高的类群多样性和物种多样性。
- 刘荷樊林程金莲肖建青钟小娟余冰李洪军刘祝祥陈义光
- 关键词：系统发育分析
- 德夯风景区嗜盐及耐盐菌抗菌活性筛选及生物学特征
- 以8个敏感菌株(革兰阳性3株、革兰阴性3株、真菌2株)作为指示菌,采用琼脂扩散法对294株分离自德夯风景区的森林、耕作及溪流等普通非盐环境(ordinary non-saline environment)土壤的嗜盐及耐盐...
- 刘荷李洪军钟小娟程金莲陈义光
- 关键词：嗜盐菌耐盐菌抗菌活性生物学特征
- 文献传递
- 德夯嗜盐耐盐菌抗菌活性筛选和系统发育被引量：2
- 2014年
- 以8个敏感菌株作为指示菌,采用琼脂扩散法,对分离自湖南省德夯峡谷（28°15′~28°43′N,109°30′~109°45′E）普通非盐环境土壤样品中的294株嗜盐及耐盐细菌进行抗菌活性筛选,并对其中具有较强抗菌活性的菌株进行基于16S rRNA基因序列的系统发育分析.受试菌株中有109株的发酵产物具有抗菌活性（阳性率37.1%）,其中5个菌株具有较强抗菌活性（JSM 102030,JSM 102052,JSM 102054,JSM 102066,JSM 102082）.基于16SrRNA基因序列的系统发育分析表明,这5个菌株分别属于细菌域（Eubacteria）的3个门（Actinobacteria,Firmicutes,Proteobacteria）中的3个科（Bacillaceae,Halomonadaceae,Nocardiopsaceae）的4个属,菌株JSM 102030属于Halobacillus属,与该属已知种Halobacillus trueperi DSM 10404T的系统发育关系最为密切（序列相似性为99.1%）,JSM 102052和JSM 102054属于Halomonas属,与Halomonas alkaliphila 18bAGT的系统发育关系最为密切（序列相似性为98.3%）,JSM 102066属于Nocardiopsis属,与其系统发育关系最为密切的是Nocardiopsis prasina DSM43845T（序列相似性为99.3%）,JSM 102082与Oceanobacillus属的Oceanobacillus kimchii X50T以99.6%的16SrRNA基因序列相似性聚在一起.研究结果表明,分离自湖南省德夯峡谷普通非盐环境土样的嗜盐及耐盐细菌中存在较高比例的抗菌活性菌株,且这些细菌具有较为丰富的系统发育多样性.
- 李洪军肖建青程金莲刘荷钟小娟易旻贺建武刘祝祥陈义光
- 关键词：嗜盐菌耐盐菌抗菌活性筛选系统发育分析
