邢俊杰
- 作品数：18 被引量：61H指数：5
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- 低温诱导东乡野生稻幼苗期叶片cDNA文库的构建和鉴定
- 2010年
- 从8℃低温诱导的东乡野生稻幼叶中提取总RNA,以总RNA为模板,利用SMART技术合成第1链,再经LD-PCR扩增合成第2链后,将获得的双链cDNA与双元表达载体YPL3连接,重组质粒电转入大肠杆菌,成功构建了东乡野生稻cDNA文库。经测定,原始文库滴度平均为4.4×107cfu/mL,平均插入片段约1kb,重组率为100%,符合cDNA文库构建要求,为后续利用酵母功能互补技术筛选东乡野生稻有利基因奠定了基础。
- 李玲龙邢俊杰崔玲玲韩小霞阳志刚李丁谢灵灵曹孟良
- 关键词：东乡野生稻CDNA文库构建SMART技术
- 小粒野生稻STK类抗病基因同源序列的克隆与分析被引量：5
- 2009年
- 根据丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶类(serine-threonine kinase,STK)抗病基因结构中保守结构域,设计引物,以小粒野生稻基因组DNA为模板,扩增获得10条STK类抗病基因同源序列.同源性分析表明其都具有STK保守结构域,与已克隆的STK类抗病基因有不同程度的相似性,为进一步克隆小粒野生稻中的STK类抗病基因提供依据.
- 崔玲玲韩小霞邢俊杰李玲龙阳志刚罗秀娟李丁谢灵灵曹孟良
- 关键词：小粒野生稻抗病基因同源序列
- 携带大片段BIBAC克隆在不同农杆菌中的遗传稳定性研究被引量：1
- 2006年
- 大片段克隆在农杆菌中的稳定性是利用可转化大片段载体进行农杆菌介导遗传转化的关键问题.选用插入片段分子质量分别为150kb和50kb的BIBAC克隆,测定了在3种农杆菌AGL-1,EHA105和LBA4404中的遗传稳定性.从第1、3、5次继代培养的农杆菌中抽提的质粒及酶切结果显示,由于农杆菌背景质粒的干扰,难以判断质粒的降解与否.将农杆菌质粒再转化到大肠杆菌宿主中,发现来自农杆菌AGL-1和EHA105的质粒出现了明显的降解,片段变小,而来自农杆菌LBA4404的质粒没有变化.结果表明,大片段BIBAC质粒在不同农杆菌菌株中的稳定性不同,在农杆菌LBA4404中比较稳定,适合用于遗传转化.
- 邢俊杰杨剑梁铃李强李磊张朝良杲修杰曹筑荣曹孟良
- 关键词：根癌农杆菌
- 小粒野生稻酵母双杂交cDNA文库的构建被引量：5
- 2010年
- 采用酵母双杂交系统,利用SMART技术,在酵母菌株AH109中构建了小粒野生稻全长cDNA文库,文库容量约为1×106,插入片段平均大小约为640bp。该文库可以用于进一步的酵母双杂交筛选。
- 邢俊杰陶小平李玲龙阳志刚唐丽李丁谢灵灵李莉曹孟良
- 关键词：小粒野生稻酵母双杂交CDNA文库构建
- 水稻光温敏核不育基因表达产物初步研究被引量：7
- 2008年
- 光温敏核不育基因在杂种优势利用中具有重大价值,了解其转录和翻译过程对解析温敏核不育机理和分离温敏核不育基因非常重要.利用基因芯片、蛋白质组技术结合遗传分析的方法,以不同温度条件下处理的培矮64S及两优培九自交后得到的F2群体为材料,从转录水平和翻译水平上分别筛选出可能与温敏核不育基因相关的24个特异表达基因以及6个特异表达蛋白质,并分析了这些产物的功能.
- 邢俊杰李莉李磊李强杲修杰曹孟良
- 关键词：水稻基因芯片蛋白质组
- 野生稻基因组抗性基因富集文库的构建被引量：2
- 2008年
- 通过集成候选抗性基因克隆技术和磁珠富集文库技术以及可转化基因组文库技术,提出了基于野生稻基因组富集文库克隆野生稻新抗性基因的策略。包括构建野生稻可转化基因组文库,利用RecA重组蛋白介导生物素标记的探针对文库进行磁珠富集,构建野生稻基因富集文库,然后对富集文库的克隆进行鉴定分析,包括点杂交和克隆末端测序分析,最后对富集文库的阳性克隆进行全序列测定和功能验证。按照上述方法,构建了东乡普通野生稻和小粒野生稻可转化基因组文库,库容量分别达到1.58×105和2.68×105个克隆,进而构建了东乡野生稻基因组候选抗性基因富集文库,单克隆总数1 152个,对富集文库的菌落原位杂交筛选获得12个阳性克隆,对其中5个阳性克隆全序列测定结果表明,4个阳性克隆含有已克隆抗性基因的保守序列,证实构建候选抗性基因富集文库克隆野生稻新抗性基因的策略是可行的。
- 曹孟良李磊韩小霞田志坚邢俊杰李强崔玲玲张朝良李玲龙罗秀娟杨志刚李丁谢灵灵陶小平罗泽宇唐丽
- 关键词：野生稻富集文库新基因克隆
- 植物功能基因组研究进展被引量：3
- 2005年
- 随着植物基因组计划的深入,植物基因组学研究的重点已经转变为基因组功能的研究,即利用基因组序列的信息和高通量的系统分析技术,在基因组水平研究植物结构和组织与植物功能在细胞、有机体和进化上的关系.对功能基因组学研究的内容、方法以及最新研究进展进行了综述.
- 邢俊杰梁铃曹孟良
- 关键词：植物功能基因组学生物芯片蛋白质组生物信息学
- 东乡野生稻苗期抗寒性QTL的初步定位被引量：16
- 2012年
- 以9311/东乡野生稻F2群体为材料,用108对SSR标记构建连锁图谱,以苗期分蘖叶片相对电导率为抗寒性鉴定指标,采用完备区间作图法检测抗寒性QTL。结果在第3号和11号染色体上定位到2个与抗寒性相关的QTL qSCR3和qSCR11,其表型贡献率分别为16.3%和19.2%。
- 左佳高婧贺荣华李丁韩小霞邢俊杰李祺曹孟良
- 关键词：东乡野生稻抗寒性QTL定位相对电导率
- 优化菌落原位杂交体系筛选野生稻基因组文库被引量：3
- 2008年
- 菌落原位杂交仍是当今筛选基因组文库的重要方法之一,但难以保持背景清晰和阳性杂交点明显的稳定的杂交体系.通过对杂交膜不同处理方法的对比,表明利用溶菌酶处理杂交体系进行菌落原位杂交筛选,其杂交结果背景较干净,且能根据杂交信号的强弱很清晰地显色阳性黑点.采用该法筛选野生稻基因组文库,已筛选出22个阳性克隆,并测序分析均为阳性克隆.
- 陶小平李磊李强韩小霞邢俊杰崔玲玲李玲珑张朝良张秋平曹孟良
- 关键词：基因组文库溶菌酶阳性克隆
- 东乡野生稻RPS2类候选抗病基因的克隆与分析被引量：5
- 2009年
- 利用NBS保守结构域获得的探针及基于RecA文库富集方法的试剂盒筛选东乡野生稻液体pCAMBIA1301质粒文库,杂交筛选获得阳性克隆,在NCBI上进行BLASTN序列比对后,设计相关引物,扩增获得编码区,并利用生物信息学方法预测其编码蛋白序列,与已克隆的NBS-LRR类抗性基因建立进化树.结果分析表明,其预测蛋白除了部分氨基酸缺失及2个氨基酸不同外,与粳稻大部分序列一致,分子进化树表明其与粳稻、拟南芥RPS2基因的关系最近.
- 崔玲玲李磊韩小霞邢俊杰李玲龙阳志刚罗秀娟李丁谢灵灵曹孟良
- 关键词：东乡野生稻生物信息学
