胡姣
- 作品数：8 被引量：44H指数：4
- 供职机构：中南林业科技大学更多>>
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- 相关领域：农业科学生物学化学工程更多>>
- 油茶乙酰CoA酰基转移酶基因cDNA克隆及序列特征分析被引量：21
- 2011年
- 在已知油茶乙酰COA酰基转移酶基因EST序列基础上,设计6条特异引物,以油茶优良无性系‘湘林1号’种仁总RNA为模板,通过反应体系和反应条件优化,最终扩增出一条700 bp左右的目的片段,将该片段回收、克隆、测序,获得718 bp的cDNA序列,将该序列与油茶乙酰COA酰基转移酶基因进行序列拼接,确定了油茶乙酰COA酰基转移酶基因的全长cDNA序列,将该序列提交至GeneBank,登录号为GU594059。油茶乙酰COA酰基转移酶基因全长cDNA序列为1 495 bp,含有一个1 227 bp的ORF,编码408个氨基酸残基。在氨基酸序列水平上,该基因与胡黄连(P.kurrooa)的乙酰COA酰基转移酶基因的相似性最高,为86%,与稻瘟病菌(M.grisea)的最低,为65%。通过在线预测,油茶乙酰COA酰基转移酶基因编码蛋白的等电点pI为6.19,分子量Mw为41 628.6 Da。本研究为揭示油茶油脂合成规律和油茶的分子育种提供了理论依据和科学基础。
- 张琳谭晓风胡姣姚小华林萍
- 关键词：油茶快速扩增CDNA末端生物信息学分析
- 油茶种子胚乳总RNA提取方法研究及改良
- 以油茶种子胚乳为实验材料,在试剂盒的基础上应用改良的CTAB法提取总RNA。针对油茶种子胚乳中富含多糖多酚的特点,改良后的CTAB法提取得到的RNA,条带整齐、清晰,并通过检测其纯度、得率以及RT-PCR后得出结论,使用...
- 胡姣谭晓风张琳龙洪旭田晓明
- 关键词：油茶RNA提取改良CTAB法RT-PCR
- 文献传递
- 油茶AACT基因和FAD6基因的全长cDNA克隆及原核表达
- 油茶是我国南方重要的木本油料树种,也是世界四大木本油料树种之一。茶油是优质的食用油,主要由油酸、亚油酸等不饱和脂肪酸组成,其含量一般在90%以上。在油脂合成过程中,乙酰辅酶A酰基转移酶(AACT)催化蛋白质的酰基化和去酰...
- 胡姣
- 关键词：油茶CDNA克隆RACE原核表达
- 文献传递
- 7个砂梨品种S基因型的确定及1个新S-RNase基因的分离鉴定(英文)被引量：1
- 2008年
- 砂梨是重要的经济树种,表现出典型的配子体自交不亲和性,在生产和育种上需鉴定品种的S基因型以确定品种间的亲和性。选取7个砂梨品种为试验材料,使用梨S-RNase(S基因)通用引物进行基因组PCR扩增,产物通过1.8%的琼脂糖凝胶电泳分析。结果表明:‘楚比香’等4个品种中产生了预期的2条电泳条带,而其他3个品种都只产生1条带产物,通过6%的聚丙烯酰胺电泳对该3个品种的PCR产物进一步分析,结果产物被成功分离。将7个品种中分离到的14个条带分别回收、克隆、测序及序列分析,从中鉴别出10个具有梨S-RNase基因序列特征的S基因,其中‘政和大雪梨’中494bp的基因片段被鉴定为新的S基因,暂命名为S43-RNase(GenBank接受号EF566873)。RT-PCR试验证明S43-RNase仅在花柱中特异表达,符合S-RNase的表达特征。通过比对S43-RNase的基因组序列和cDNA序列,确定其内含子大小为294bp。在推导氨基酸水平上,S43-RNase与苹果亚科其他S-RNase表现出65%～92%的相似性。
- 张琳谭晓风周建何小勇袁德义胡姣龙洪旭
- 关键词：砂梨PCRS-RNASE
- 中国白梨PbSFBB 13-gamma基因的分子克隆与序列特征(英文)被引量：2
- 2009年
- 以5个已知S基因型的中国白梨品种为试材,设计分别对应于梨SFBB-alpha,SFBB-beta和SFBB-gamma基因的3对引物对这5个品种进行基因组PCR扩增。结果仅引物组合PSFBG-F/PSFBG-R从‘金花’（S13S18）,‘金花四号’（S13S18）和‘鹅梨’（S13S34）中扩增出一约1300bp的条带,经回收、克隆、测序后,鉴定其为SFBB-gamma基因,命名为PbSFBB13-gamma（Pyrus bretschneideri SFBB13-gamma）,GenBank登录号为EU081892。逆转录PCR结果表明PbSFBB13-gamma仅在花粉中特异表达;序列分析表明该基因不含内含子,编码区含1191个核苷酸,编码396个氨基酸,预测分子质量与等电点分别为45.4ku、4.63。PbSFBB13-gamma表现出典型的花粉SFB/SLF基因的基本结构特征,即1个F-box结构域及4个可变区;在推导氨基酸水平上,其与蔷薇科SFB/SLF基因的相似性为17.8%-97.7%。试验结果充分表明PbSFBB13-gamma应为花粉S基因的候选基因。选取蔷薇科34个SFB/SLF基因的全长氨基酸序列,构建进化树研究基因间的进化关系。结果表明,34个SFB/SLF基因形成2个亚科特异的类群,但不形成种特异的类群,其进化规律与蔷薇科S-RNase基因一致,即花粉SFB/SLF基因的形成也是在亚科形成之后、种形成之前。研究结果有助于从分子水平上揭示中国白梨的自交不亲和性机制。
- 张琳谭晓风胡姣乌云塔娜袁德义何小勇龙洪旭李秀根
- 关键词：白梨进化树
- 火把梨及其后代育成品种的S基因型鉴定
- 本研究以火把梨及其三个后代品种红酥脆、满天红及美人酥为实验材料,通过S-RNase基因的特异PCR扩增,产物通过1.5%的琼脂糖凝胶电泳分析,结果发现火把梨具有三条电泳条带,红酥脆、满天红与美人酥都只产生了两条电泳条带,...
- 张琳谭晓风胡姣龙洪旭袁德义李秀根
- 关键词：自交不亲和性S基因型
- 文献传递
- 油茶种子总RNA提取及Cod8FAD基因的鉴定被引量：5
- 2010年
- 油茶种子胚乳中富含脂肪、多糖和酚类公合物,要获得高质量的RNA难度较大。本研究以油茶优良无性系湘林1号近成熟种子的胚乳为实验材料,在试剂盒的基础上应用改良的CTAB法提取总RNA。结果表明,使用改良后的CTAB法配合试剂盒提取RNA操作简单,且能够有效去除油茶种子中多糖和多酚类等次生物质,从而得到高质量的RNA。以获得的RNA为模板,设计简并引物,通过RT-PCR,成功从油茶种子中鉴定出了油脂合成的关键酶基因之一△8脂肪酸脱饱和酶基因,命名为Cod8FAD(Camellia oleifera delta 8 fatty acid desaturase),该基因与茶树△8脂肪酸脱饱和酶基因相似性最高,为97%,与耧斗菜△8脂肪酸脱饱和酶基因相似性最低,为62%。
- 胡姣谭晓风张琳龙洪旭
- 关键词：油茶RNA提取改良CTAB法RT-PCR
- 油桐油体蛋白基因的克隆及序列分析被引量：15
- 2010年
- 油桐油体蛋白与油桐脂肪酸储藏密切相关。通过构建油桐cDNA文库和EST文库,用分子生物学手段分离克隆出两个油桐油体蛋白基因的全长cDNA序列。通过分析表明,两个油体蛋白基因的全长cDNA分别为738 bp、838 bp,各包含1个完整的CDS,分别编码137个、154个氨基酸。分别命名为VF_oleⅠ,VF_oleⅡ。通过与其它物种的19条油体蛋白氨基酸序列比对,油桐油体蛋白基因分别与麻疯树oleosin 3和麻疯树oleosin 2的相似性最高,分别为84%、82%。通过软件预测表明,油桐油体蛋白等电点分别为10.315、10.335,都存在跨膜结构域,且存在信号肽剪切位点,中部都存在一个较长的疏水区,C末端都是以α-螺旋为主。
- 龙洪旭谭晓风陈洪张琳胡姣
- 关键词：油桐全长CDNA克隆
