端木慧子 作品数:12 被引量:51 H指数:5 供职机构: 东北农业大学 更多>> 发文基金: 黑龙江省高校科技创新团队建设计划项目 国家自然科学基金 转基因生物新品种培育专项 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 医药卫生 更多>>
野生大豆碳酸盐胁迫应答基因GsMIPS2的克隆及功能分析 被引量:3 2015年 为挖掘野生大豆(Glycine soja L.G07256)耐碳酸盐关键功能基因,利用前期高通量转录组测序数据,从构建的碳酸盐胁迫基因表达谱中,选取了一个碳酸盐胁迫下显著上调表达的肌醇-1-磷酸合酶类基因。采用同源克隆的方法,获得该基因的全长cDNA,命名为GsMIPS2。实时荧光定量PCR结果显示该基因受碳酸盐胁迫诱导表达,并且其表达量具有组织特异性。将GsMIPS2基因转化拟南芥,并结合拟南芥中T-DNA插入突变体atmips2来验证其耐碳酸盐功能。结果表明,碳酸盐胁迫条件下,GsMIPS2超量表达拟南芥种子萌发率显著高于野生型,而拟南芥突变体atmips2种子萌发率显著低于野生型。上述结果表明,GsMIPS2基因在植物应答碳酸盐胁迫过程中起重要作用。 陈晨 孙晓丽 刘艾林 端木慧子 于洋 肖佳雷 朱延明关键词:野生大豆 大豆基因组GmSRK及其同源基因的生物信息学分析 2014年 以野生大豆GsSRK氨基酸序列为检索序列,在Phytozome数据库中查找大豆基因组中其同源基因GmSRK。利用Phytozome数据库以及MEGA5.0,ClustalX等软件挖掘大豆基因组GmSRK同源基因,最终确定同源性较高的2个基因Glyma12g21640和Glyma08g06550。对GmSRK、Glyma12g21640和Glyma08g06550这3个基因进行基因结构,染色体定位,蛋白理化性质、一级、二级结构分析,结果表明三者均含有6个内含子,7个外显子;定位于3条不同染色体上;都具有B-lectin,S_locus_glycop,PAN_AP以及S_TKc四个结构域,属于G-type外源凝集素类受体蛋白激酶。进化树分析发现GmSRK与Glyma12g21640亲缘关系最近且与四季豆、苜蓿中同源蛋白聚为一支,Glyma08g06550与拟南芥RLKs亲缘关系较近。 钱雪 孙晓丽 端木慧子 成舒飞 才华 纪巍 赵超越 朱延明关键词:大豆 类受体蛋白激酶 生物信息学 一种miRNA、miRNA的前体、以及它们的编码基因和应用 本发明公开了一种miRNA、miRNA的前体、以及它们的编码基因和应用。本发明保护一种miRNA,如序列表的序列2所示。编码所述miRNA的基因也属于本发明的保护范围。本发明还保护一种RNA(miRNA的前体),如序列表... 孙晓丽 朱延明 端木慧子 王孙婷 孙中文一种与植物抗逆性相关蛋白及其编码基因GsMSRB2与应用 本发明公开了一种与植物抗逆性相关蛋白及其编码基因GsMSRB2与应用。该蛋白质,是如下a)或b)的蛋白质:a)由序列表中序列2所示的氨基酸序列组成的蛋白质;b)将序列表中序列2所示的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取... 朱延明 孙晓丽 端木慧子 肖佳雷 孙明哲文献传递 一种miRNA、miRNA的前体、以及它们的编码基因和应用 本发明公开了一种miRNA、miRNA的前体、以及它们的编码基因和应用。本发明保护一种miRNA,如序列表的序列2所示。编码所述miRNA的基因也属于本发明的保护范围。本发明还保护一种RNA(miRNA的前体),如序列表... 孙晓丽 朱延明 端木慧子 王孙婷 孙中文文献传递 一种与植物抗逆相关蛋白GsMIOX2及其编码基因与应用 本发明公开了一种与植物抗逆相关蛋白GsMIOX2及其编码基因与应用。本发明的蛋白质GsMIOX2,是如下a)或b)或c)的蛋白质:a)氨基酸序列是序列2所示的蛋白质;b)在序列2所示的蛋白质的N端和/或C端连接标签得到的... 李强 朱延明 肖佳雷 陈晨 孙晓丽 端木慧子文献传递 大豆CML家族基因的生物信息学分析 被引量:12 2015年 CMLs蛋白是一类具有Ca2+结合的EF-hand保守结构域蛋白,广泛参与钙依赖的信号传导途径,在植物生长发育及生物胁迫与非生物胁迫响应中起着重要的作用。通过NCBI和植物基因组注释数据库等筛选并获得了68个大豆GmCML蛋白;分析了所有蛋白的基本特性;通过与拟南芥CMLs基因的进化树分析表明,GmCML家族基因属于8个亚类;对GmCML家族基因进行了染色体定位与重复基因进化关系分析,发现其具有较高的进化速率;序列比对发现GmCML类蛋白含有2~4个保守的EF-hand结构域;利用芯片数据对野生大豆在碱胁迫下的叶和根中的CMLs基因表达模式进行了分析,得到26个GsCML基因在碱胁迫下有显著的差异表达,且在根和叶中的差异表达模式不同,表明这些基因参与植物碱胁迫应答,且具组织表达特异性。 陈超 端木慧子 朱丹 刘艾林 肖佳雷 朱延明关键词:大豆 EF-HAND 生物信息学 进化分析 野生大豆叶片蛋白质组双向电泳技术体系的优化研究 被引量:5 2015年 为给野生大豆蛋白质组学分析提供技术支撑,以耐盐碱野生大豆叶片为材料,对Tris-饱和酚法、Tris-HCl法和TCA-丙酮法3种蛋白质提取方法进行了比较,并对蛋白上样量、等电聚焦参数及凝胶浓度进行了优化。结果表明:使用Tris-饱和酚法提取蛋白质,上样量为2 000μg,等电聚焦90 000 V·h,凝胶浓度为10%时,可获得背景清晰、蛋白点数较多、重复性较好的蛋白双向电泳图谱。 张宁 孙晓丽 端木慧子 于洋 纪巍 朱延明关键词:野生大豆 叶片 蛋白质提取 双向电泳 蛋白组学 大豆GST基因家族全基因组筛选、分类和表达 被引量:13 2013年 利用生物信息学手段,结合公共大豆基因组数据库和大豆发育表达芯片数据获得大豆GST家族基因序列、蛋白序列和染色体位置等信息并进一步对基因的组织表达等进行分析。结果显示大豆中含94个GST家族基因,根据系统发育分析将这些GST基因分成5个亚家族;定位分析表明,94个GST基因分布于大豆的16条染色体上。表达分析结果表明,14个不同发育阶段,大多成员至少在一个组织中表达,11差异表达的基因中有7在根中表达,另外4在其它部位优势表达,基因表达具有一定特异性。本研究为进一步研究GST家族的功能及其抗逆利用提供基础。 江董丽 才华 端木慧子 朱延明关键词:差异表达基因 一种与植物抗逆性相关蛋白及其编码基因GsMSRB2与应用 本发明公开了一种与植物抗逆性相关蛋白及其编码基因GsMSRB2与应用。该蛋白质,是如下a)或b)的蛋白质:a)由序列表中序列2所示的氨基酸序列组成的蛋白质;b)将序列表中序列2所示的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取... 朱延明 孙晓丽 端木慧子 肖佳雷 孙明哲文献传递