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牛伟
作品数:
3
被引量:6
H指数:1
供职机构:
西安电子科技大学计算机学院
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发文基金:
国家教育部博士点基金
国家自然科学基金
中央高校基本科研业务费专项资金
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相关领域:
自动化与计算机技术
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合作作者
于强
西安电子科技大学计算机学院
霍红卫
西安电子科技大学计算机学院
郭丹丹
西安电子科技大学计算机学院
张懿璞
西安电子科技大学计算机学院
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自动化与计算...
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最大团
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作者
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牛伟
2篇
霍红卫
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于强
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张懿璞
1篇
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2013
2篇
2012
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3
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基于最大团求精的模体发现算法研究
转录因子结合位点是与转录因子结合的DNA片断,负责启动基因的转录过程和控制基因的转录效率。由于转录调控是基因表达调控的关键环节,因此转录因子结合位点的预测和识别对于生物调控网络的研究具有重要意义。 本文在研究模体发现算...
牛伟
关键词:
回溯法
性能系数
文献传递
(l,d)-模体识别问题的遗传优化算法
被引量:6
2012年
转录因子结合位点识别在基因表达调控过程中起着重要的作用.文中提出了一种贝叶斯模型驱动的模体识别的遗传优化算法GOBMD(Genetic Optimization with Bayesian Model for Motif Discovery).GOBMD首先使用一个基于位置加权散列的投影过程,将输入序列中的l-mers投影到k维(k
霍红卫
郭丹丹
于强
张懿璞
牛伟
关键词:
模体识别
遗传算法
贝叶斯模型
散列
结合最大团求精的随机投影模体发现算法
2013年
模体发现是生物信息学和计算机科学中最具挑战性的问题之一,对未经比对的DNA序列中定位转录因子结合位点起着重要的作用。将模体发现问题转化为无向图中求解最大团的问题,并提出了一种结合最大团求精的随机投影模体发现算法(MCR2PA)。与原有的投影算法相比,对于大多数模体发现问题,MCR2PA的识别准确率都有所提高。多组真实生物数据上的实验结果验证了所提算法的实用性。特别地,对于酿酒酵母数据,预测准确率能够达到80%以上。
霍红卫
于强
牛伟
关键词:
转录因子结合位点
最大团
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