柳燕
- 作品数:20 被引量:34H指数:3
- 供职机构:安徽医科大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家科技重大专项安徽省自然科学基金更多>>
- 相关领域:医药卫生文化科学生物学更多>>
- 一种SARS-CoV-2S蛋白IgM的间接ELISA检测方法
- 一种SARS‑CoV‑2S蛋白IgM的间接ELISA检测方法,包括下列步骤:将采用ELISA包被液稀释的新冠病毒刺突蛋白加入酶标板,每孔100μL,4℃过夜,PBST缓冲液清洗;加250μL 5%的脱脂奶粉溶液进行封闭,...
- 柳燕任翠平周畅瞿明胜
- 文献传递
- 日本斑点热立克次体安徽120株ompB基因及其编码蛋白的生物信息学和B细胞抗原表位分析被引量:1
- 2020年
- 目的对从我国临床患者血液中新发现和分离出的日本斑点热立克次体安徽120株ompB基因及其编码蛋白进行系统的结构与功能预测,为深入了解其在立克次体致病机制中的作用、研发斑点热临床诊断试剂和疫苗提供理论基础。方法基于日本斑点热立克次体安徽120株ompB基因及其编码的氨基酸序列,应用生物信息学方法预测其信号肽、跨膜区、疏水性等性质和可能的B细胞抗原表位。结果日本斑点热立克次体安徽120株ompB基因在3 297~3 311处存在连续15个碱基的缺失,除此之外,该分离株还有4个碱基突变。该基因编码的氨基酸数目为1 651个,蛋白质分子量为167.69 ku,共由20种氨基酸组成,其中含量较多的氨基酸是Gly;理论等电点pI为5.15,消光系数为58 805或58 680,蛋白不稳定指数为7.15,脂肪指数为88.86,总平均亲水性(GRAVY)为0.06,为疏水性蛋白;Signal peptide (Sec/SPI) Likelihood为0.567 7,有信号肽序列;存在一个Pfam区域和自转运体区,分别与细菌黏附宿主和蛋白质转运有关;蛋白二级结构中以无规卷曲为主,其次为β-折叠和α-螺旋,分别占到53.73%、30.83%和15.45%。同源模建蛋白的三级结构中,第1 308~1 651氨基酸部分在蛋白表面形成桶状结构,可能具有丝氨酸蛋白酶的作用;蛋白分子内抗原表位较丰富,共有159个可能的抗原表位,预测分数最高(0.94)的为1 269~1 284位序列。结论成功分析和预测了日本斑点热立克次体安徽120株ompB基因及其编码蛋白的组成、蛋白质的二级结构、三级结构和B细胞抗原表位,为研究日本斑点热立克次体的致病机制、临床诊断试剂和亚单位疫苗的研发提供了理论支持。
- 刘伯玉罗婉蓉陈振余冬阳高越朱禹洪颖杨莉柳燕
- 关键词:B细胞抗原表位生物信息学
- 一种基于CRISPR/Cas系统的新型冠状病毒双靶标快速检测方法及试剂盒
- 一种基于CRISPR/Cas系统的新型冠状病毒双靶标快速检测方法及试剂盒,包括核酸提取得到待检核酸;以两组RT‑RAA引物同时扩增两个待检测位点并得到核酸产物,分别是Cas12a靶向的N基因扩增产物与Cas13a靶向的S...
- 杜忆南邢晨柳燕周静祝亚亭王小凤李倩张智康
- 文献传递
- 实时荧光定量PCR检测斑点热立克次体方法的建立被引量:1
- 2020年
- 目的建立斑点热群立克次体(SFGR)TaqMan实时荧光定量PCR(qPCR)快速检测方法。方法根据日本斑点热立克次体外膜蛋白A(ompA)基因序列设计特异性引物和探针,建立基于TaqMan探针的实时荧光定量PCR检测方法,对其特异性、灵敏性、重复性进行检测,用建立的此检测方法和常规的巢式PCR方法同时对临床收集的80份患者血标本进行检测并比较两者结果。结果成功建立了检测SFGR的实时荧光定量PCR方法,标准曲线的循环阈值与模板拷贝数均呈良好的线性关系(r>0.99),且在检测SFGR核酸样本时具有良好的灵敏度、特异性和重复性。结论该研究建立了基于TaqMan探针检测SFGR的实时荧光定量PCR检测方法,为临床实验室快速确诊SFGR疾病提供了快速、有效的技术手段。
- 罗婉蓉刘伯玉陈振任翠平高越杨莉朱禹余东阳柳燕
- 关键词:斑点热立克次体OMPATAQMAN探针实时荧光定量PCR
- 一种基于CRISPR/Cas系统的新型冠状病毒双靶标快速检测方法及试剂盒
- 一种基于CRISPR/Cas系统的新型冠状病毒双靶标快速检测方法及试剂盒,包括核酸提取得到待检核酸;以两组RT‑RAA引物同时扩增两个待检测位点并得到核酸产物,分别是Cas12a靶向的N基因扩增产物与Cas13a靶向的S...
- 杜忆南邢晨柳燕周静祝亚亭王小凤李倩张智康
- 文献传递
- 一种SARS-CoV-2N蛋白IgA的间接ELISA检测方法
- 一种SARS‑CoV‑2 N蛋白IgA的间接ELISA检测方法,包括(1)包板、(2)封闭、(3)一抗孵育、(4)二抗孵育、(5)弃去酶标二抗,TMB单组分显色液100μl/孔,37℃避光显色5 min,每孔加入ELIS...
- 柳燕任翠平周畅瞿明胜
- 文献传递
- 日本斑点热立克次体近缘株重组OmpB蛋白抗原性研究被引量:2
- 2017年
- 目的探讨关于斑点热立克次体的临床诊断及流行病学调查而进行的诊断方法学研究。方法构建R.Japonica Anhui 120 strain OmpB原核表达质粒,表达、鉴定并纯化重组蛋白,用其作为抗原建立间接ELISA检测方法,检测120份临床样本中日本斑点热立克次体特异性IgG抗体,并评价方法的敏感性和特异性。结果获得了高表达、高纯度的OmpB重组蛋白,建立的间接ELISA方法体系与美国食品和药物管理局认可的诊断试剂盒相比有良好的特异性和敏感性,两者的特异性为100%,敏感性为96.7%,符合率为99.2%,Kappa值为0.98。结论 OmpB重组蛋白具有很好的免疫反应性,能特异地检出斑点热立克次体IgG抗体,间接ELISA方法可作为临床诊断的技术储备及流行病调查和科学研究。
- 宗佳刘伯玉陈振Adams李嘉嘉章孝成刘晓宁任翠平柳燕
- 关键词:包涵体
- 人巨细胞病毒IE抗原快速免疫荧光检测法在先天性人巨细胞病毒感染筛查中的应用被引量:2
- 2019年
- 目的探讨人巨细胞病毒(HCMV)IE抗原快速免疫荧光检测法在先天性HCMV感染筛查中的应用价值。方法收集2017年1至12月安徽省妇幼保健院产科352例新生儿唾液标本和足底干血片标本。使用病毒分离培养和HCMV IE抗原快速免疫荧光检测法检测新生儿唾液标本;使用荧光定量聚合酶链反应(PCR)检测足底干血片标本HCMV-DNA。以病毒分离培养的结果作为标准,比较HCMV IE抗原快速免疫荧光检测法和足底干血片标本荧光定量PCR法在检测先天性HCMV感染中的检验效能。结果352例唾液标本共分离5例阳性标本,阳性率为1.42%;而荧光定量PCR检测足底干血片标本仅4例阳性,阳性率为1.14%;HCMV IE抗原快速免疫荧光检测法检测的结果与病毒分离完全一致。足底干血片荧光定量PCR检测的敏感度为80%,特异度为100%;HCMV IE抗原快速免疫荧光检测的敏感度为100%,特异度为100%。HCMV IE抗原快速免疫荧光检测的敏感度高于足底干血片荧光定量PCR检测,但差异无统计学意义(Z=0.94,P=0.350)。结论HCMV IE抗原快速免疫荧光检测可能是更准确的先天性HCMV感染早期诊断方法。
- 江龙凤金艳柳燕
- 关键词:巨细胞病毒荧光免疫测定先天畸形
- 一种检测筛查新冠病毒N501Y突变的方法及试剂盒
- 一种检测筛查新冠病毒N501Y突变的方法及试剂盒,包括核酸提取得到待检核酸;以设计的引物进行扩增反应,得到核酸扩增产物;配置CRISPR反应混合液,2μL核酸扩增产物加入到CRISPR反应混合液,37℃孵育30分钟,通过...
- 杜忆南邢晨柳燕祝亚亭李倩王小凤张智康张宁王悦晨
- 文献传递
- 一种检测筛查新冠病毒N439K突变的方法及试剂盒
- 一种检测筛查新冠病毒N439K突变的方法及试剂盒,包括核酸提取得到待检核酸;以设计的引物进行扩增反应,得到核酸扩增产物;配置CRISPR反应混合液,2μL核酸扩增产物加入到第一CRISPR反应混合液或第二CRISPR反应...
- 邢晨杜忆南柳燕周静祝亚亭王小凤李倩张宁王悦晨
- 文献传递