李林
- 作品数:60 被引量:613H指数:12
- 供职机构:中国动物卫生与流行病学中心更多>>
- 发文基金:青岛市科技发展计划项目公益性行业(农业)科研专项引进国际先进农业科技计划更多>>
- 相关领域:农业科学医药卫生生物学更多>>
- 貂、狐、貉源犬瘟热病毒分离株H和N基因的遗传多样性分析被引量:10
- 2007年
- 为研究鼬科动物犬瘟热病毒(CDV)毒株的变异特性,对来自不同地区的貉、狐、貂的5个CDV分离株(其中HD-m、LN-m为貂源,HTp-r、THD1-r为貉源,HB-f为狐源)和1个CDV国内弱毒疫苗株(vCh)的N基因和部分H基因进行了核苷酸测序,并构建系统发生树。结果表明,5个分离株之间H基因核苷酸序列同源性均达到97.5%以上,而N基因为94.5%-99.8%。vCh与5个分离株的H基因和N基因核苷酸序列同源性普遍较低(H基因:90.5%-91.8%;N基因:90.9%-93.5%),而与国外疫苗株vCon和vOnder的H基因核苷酸同源性达96.8%和97.2%。分离株之间H蛋白氨基酸同源性差别不大(97.1%-100%),而N蛋白氨基酸同源性差别较大(91.6%-100%)。5个CDV分离株与vCh疫苗株H蛋白和N蛋白同源性均普遍较低,H蛋白为89.7%-91.8%,N蛋白为92.8%-96.8%。vCh与vOnder、vCon有很高的同源性,其H蛋白氨基酸同源性分别为97.1%和95.6%,vCh与vOnder N蛋白氨基酸同源性达97.3%。结果显示,最近犬瘟热的流行和免疫失败现象的发生与国内所用疫苗毒株和野毒株的遗传关系甚远有关。
- 王君玮姜平王志亮张维李林赵永刚
- 关键词:犬瘟热病毒H基因N基因同源性
- 中国西藏小反刍兽疫病毒野生株China/Tib/Gej/07-30基质蛋白基因和融合蛋白基因的分子特征分析被引量:5
- 2010年
- 对我国西藏小反刍兽疫病毒野生株China/Tib/Gej/07-30进行基质蛋白(M)和融合蛋白(F)基因序列测定,并进行分子生物学特征分析。首先应用逆转录聚合酶链式反应扩增出M和F基因片段,对聚合酶链式反应产物进行直接测序,然后对测定的核苷酸和推测的氨基酸序列进行比较分析。China/Tib/Gej/07-30的M基因由1483个核苷酸组成,编码335个氨基酸,与其他分离株核苷酸和氨基酸序列同源性分别为92.4%~97.7%和97.0%~98.2%。F基因由2411个核苷酸组成,编码546个氨基酸,与其他分离株核苷酸和氨基酸序列同源性分别为85.5%~96.1%和94.3%~98.2%。China/Tib/Gej/07-30的F蛋白含有信号肽序列和跨膜结构域,序列高度变异。F蛋白第104~108位和第109~133位氨基酸位点分别是高度保守的裂解位点和融合肽结构域。F蛋白还含有序列高度保守的三个七肽重复区。China/Tib/Gej/07-30的M基因3′端的非编码区(UTR)长度为443个核苷酸,GC含量高达68.4%,与其他PPRV毒株的同源性为82.4%~93.5%。China/Tib/Gej/07-30的F基因5′UTR区长度为634个核苷酸,GC含量高达70.0%,与其他PPRV毒株序列相似性为76.2%~91.7%。
- 包静月赵文姬王志亮李林吴国珍吴晓东刘春菊王君玮刘雨田李金明王英丽
- 关键词:小反刍兽疫病毒野生株基质蛋白非编码区
- 一种羊痘病毒属病毒通用Cycleave荧光PCR检测方法
- 本发明提供一种可同时检测羊痘病毒属牛结节性皮肤病、山羊痘与绵羊痘的Cycleave荧光PCR引物对、探针及应用该引物对和探针的检测方法。本发明所提供的引物对和探针组,其正向引物的序列为SEQID NO:1;反向引物的序列...
- 南文龙陆游陈义平吴晓东王永杰哈达特木尔巴根巩明霞李林张永强赵永刚屈海龙邹艳丽张雨初王志亮
- 文献传递
- 非洲猪瘟病原学检测方法研究进展被引量:15
- 2020年
- 目前,非洲猪瘟(ASF)尚无有效疫苗可以预防,快速、准确的病原学检测是防控该病的重要技术手段。本文综述了ASF病原学检测方法:免疫荧光、ELISA、免疫层析试纸条等抗原检测方法,其使用方便、快速,目前主要应用于急性发病或病死猪的快速诊断及群体筛查;PCR、荧光定量PCR、环介导等温扩增等分子生物学检测方法仍是ASF病原检测的主要手段,特别是荧光定量PCR方法以其敏感、特异、快速、稳定的优点在我国实践中广泛应用。随着微流控、化学发光、基因芯片等新技术不断应用,各种自动化、一体化、便携式设备不断研发,将会为ASF防控提供有效技术支持。
- 南文龙李林巩明霞陆游吴晓东陈义平
- 关键词:非洲猪瘟病原学检测
- PRRSV血清抗体间接ELISA检测方法的建立被引量:5
- 2006年
- 用亲和层析纯化的猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)重组核衣壳蛋白GST-N作为诊断抗原,建立检测PRRS血清抗体的间接ELISA方法。抗原最佳包被量为每孔400 ng,待检血清最佳稀释度为1∶100,待检血清样品的D_(490 nm)≥0.43D_(po■)+0.57D_(neg)判为阳性,反之判为阴性。对采自14个猪场的364份猪血清样品进行检测,PRRS阳性率为51.4%,略高于HerdChek ELISA的阳性检出率49.7%。与HerdChek ELISA相比,间接ELISA的敏感性为94.5%,特异性为91.3%,总符合率为92.9%,Youden指数为0.86。同时还证明该方法具有良好的批间和批内重复性,并且不与猪瘟、猪伪狂犬病等阳性血清发生反应。该方法的成功建立将为我国PRRS的防制工作作出贡献。
- 陈义平邓珣彭长凌刘文博吴晓东李林王志亮刘秀梵
- 关键词:猪繁殖与呼吸综合征病毒间接ELISA
- 一种对非洲猪瘟病毒基因I型和II型的快速鉴别诊断方法
- 本发明提供一种基于探针导向的重组酶介导的等温扩增技术对非洲猪瘟病毒基因I型和II型的鉴别诊断方法,所述方法能够用于快速诊断和区分非洲猪瘟病毒基因I型和II型。所述基于探针导向的重组酶介导的等温扩增法检测不同基因型特异差异...
- 樊晓旭吴晓东赵洋蔡禹希王清华包静月赵明胡永新戈胜强李林刘春菊应清界
- 一种鉴别小反刍兽疫病毒疫苗株和基因4系野毒株的方法
- 本发明提供了一种荧光定量RT-PCR方法用于鉴别小反刍兽疫病毒疫苗毒株和基因4系野毒株,其包括检测小反刍兽疫病毒的引物以及鉴别疫苗株和基因4系野毒株的TaqMan探针。先提取待检样品中的RNA,将其加入到含有上述引物和探...
- 李林吴晓东王志亮刘春菊王清华
- 文献传递
- 犬瘟热病毒貉、狐、貂分离株N蛋白基因的遗传多样性和功能分析被引量:4
- 2007年
- 为分析从不同地区分离的犬瘟热病毒(CDV)毒株的抗原性差异,对5个CDV分离株和1个CDV弱毒疫苗株的N蛋白基因进行了核苷酸测序,并与11个参考毒株进行了比较。结果表明,5个分离株之间核苷酸序列同源性达94.5%-99.8%。China(国内疫苗株)与分离株的核苷酸序列同源性普遍较低(90.9%-93.5%)。分离株之间氨基酸序列同源性差别大(87.9%-100%),其中,HT-P与THD1的氨基酸序列同源性为100%;而与China疫苗株氨基酸同源性普遍较低,为89.7%-91.8%。China疫苗株与Onderstepoort有着很高的同源性,同源性比例分别为97.1%。分析结果显示,最近CDV的流行和免疫失败现象发生,与国内所用疫苗毒株和野毒株的遗传关系甚远有关。
- 王君玮张维李林赵永刚姜平王志亮孙承英任炜杰王珊
- 关键词:犬瘟热病毒N基因
- 一种检测牛结节性皮肤病的Cycleave荧光PCR方法
- 本发明提供一种Cycleave荧光PCR引物对、探针及应用该引物对和探针的检测方法;所提供的引物对和探针,其中引物对的正向引物的序列为SEQ ID NO:1,反向引物的序列为SEQ ID NO:2;探针的序列为SEQ I...
- 南文龙陆游陈义平吴晓东王永杰哈达特木尔巴根巩明霞李林张永强赵永刚屈海龙邹艳丽张雨初王志
- 文献传递
- 牛结节性皮肤病病毒Cycleave PCR检测方法的建立被引量:1
- 2023年
- 将GenBank中牛结节性皮肤病病毒与同属的山羊痘病毒和绵羊痘病毒全基因组进行比较,筛选设计特异性引物和探针,建立Cycleave PCR检测方法。结果显示,建立的方法在40 min内即可特异性地检出牛结节性皮肤病病毒核酸,与山羊痘病毒、绵羊痘病毒、口蹄疫病毒、牛病毒性腹泻/黏膜病病毒、牛传染性鼻气管炎病毒、蓝舌病病毒均无交叉反应,该方法的最低检出限为1.13拷贝/μL。平行检测89份临床样本,与国标荧光定量PCR方法相比,本方法敏感性100.0%,特异性90.0%,总符合率为95.5%。结果表明,本试验建立的Cycleave PCR检测方法敏感、特异且操作简便,适用于牛结节性皮肤病病毒的高通量、快速检测。
- 南文龙巩明霞陆游李金明王永杰哈达李林杜秋明陈义平吴晓东