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北京市某区1例人感染H7N9禽流感病毒的HA和NA基因特征分析被引量：1: 2020年; 目的了解北京市某区1例人感染H7N9禽流感病毒基因特征,为禽流感病例的早期发现、疫情控制提供参考。方法提取病例临床样本病毒核酸,反转录扩增后进行病毒血凝素基因(hemagglutinin, HA)、神经氨酸酶基因(neuraminidase, NA)序列测定。获得的病毒序列与全球流感共享数据库中H7N9禽流感病毒株进行序列分析,比较该病毒与北京市既往发现株和其他省市毒株同源性,构建系统发育树,并对部分耐药位点和糖基化位点进行分析。结果北京市某区1例H7N9禽流感病毒为低致病性禽流感。HA、NA与北京既往发现的29株毒株氨基酸同源性为97.2%~100%和96.8%~100%,基于系统进化分析与之最为相近的疫苗株为A/Hunan/02650/2016。HA蛋白受体结合位点发生了G186V、Q226L突变,HA和NA的糖基化位点均未发生变化。结论该区出现的H7N9病毒与北京地区既往发现H7N9毒株具有高度同源性,部分氨基酸位点存在变异,但未发生耐药突变。; 吴杨牛桓彩庄鹏李东迅刘重程李飒舒高林潘阳; 关键词：禽流感

2020-2021年北京市昌平区诺如病毒急性胃肠炎聚集性疫情流行病学特征被引量：1: 2023年; 目的分析2020-2021年北京市昌平区诺如病毒急性胃肠炎聚集性疫情流行特征,为科学制定诺如病毒急性胃肠炎疫情防控措施提供依据。方法收集2020-2021年北京市昌平区诺如病毒急性胃肠炎聚集性疫情流调和临床资料,用实时荧光PCR方法检测诺如病毒;采用描述性的流行病学方法,分析疫情三间分布等流行病学特征。结果2020-2021年北京市昌平区共报告51起诺如病毒急性胃肠炎聚集性疫情,疫情样本中诺如病毒检出率为20.08%(303/1 509);诺如病毒疫情冬季高发,发生在冬季的疫情占52.94%(27/51),其中12月占50.98%(26/51);城乡结合部的2个镇发生疫情起数最多,占47.06%(24/51),不同地区罹患率差异有统计学意义(χ^(2)=653.553,P<0.05);托幼机构发生疫情起数最多,占58.82%(30/51),不同人群罹患率差异有统计学意义(χ^(2)=797.526,P<0.05);病例最常见的症状是呕吐,占78.61%(305/388),呕吐、腹泻和发热症状在不同人群间差异有统计学意义(P均<0.05)。结论城乡结合部和托幼机构更易发生诺如病毒疫情;一年四季均有诺如病毒疫情发生,冬季高发,12月为流行高峰;病例以呕吐为主要临床表现。; 彭华李飒银安琪李东迅王维钧舒高林严寒秋; 关键词：诺如病毒急性胃肠炎疫情防控

2012-2019年北京市昌平区散发腹泻病例四种病毒监测结果分析被引量：8: 2021年; 目的对北京市昌平区2012-2019年散发腹泻病例4种病毒监测结果进行分析,了解其流行特征。方法采集此期间辖区2家哨点医院肠道门诊散发腹泻病例便样本960份,提取核酸后用实时荧光RT-PCR方法检测A组轮状病毒、GⅠ/GⅡ组诺如病毒、星状病毒和肠道腺病毒,用描述性流行病学方法从时间、性别和年龄分布分析其流行特征。结果960份便样本的病毒总检出率为32.29%(310/960),GⅠ/GⅡ组诺如病毒、A组轮状病毒、星状病毒和肠道腺病毒检出率分别为18.96%(182/960)、10.63%(102/960)、1.98%(19/960)和0.73%(7/960);在不同年份、性别和年龄组中,均为GⅠ/GⅡ组诺如病毒检出率最高,A组轮状病毒次之;GⅠ/GⅡ组诺如病毒春季检出率最高(28.33%,68/240),冬季次之(22.50%,54/240);A组轮状病毒冬季检出率最高(25.42%,61/240),春季次之(9.58%,23/240)。结论GⅠ/GⅡ组诺如病毒和A组轮状病毒是北京市昌平区冬春季散发腹泻病例的主要病原。; 彭华李东迅李楠王维钧舒高林田祎闻艳红徐代庆银安琪严寒秋; 关键词：病毒性腹泻诺如病毒星状病毒肠道腺病毒

北京市昌平区食源性单增李斯特菌特征分析被引量：6: 2018年; 目的了解北京市昌平区食源性单增李斯特菌(Lm)的毒力基因携带情况、抗生素敏感性及分子特征。方法对2010-2016年12类食品中分离的22株Lm进行血清型、毒力基因、抗生素敏感性、多位点序列分型(MLST)和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分析。结果 22株Lm分为5种血清型(以1/2c、3a血清型为主);19种毒力基因携带谱(T1~T19),毒力基因阳性数为6~12个;对氨苄西林、青霉素、美罗培南、复方新诺明、万古霉素和环丙沙星敏感,出现对四环素、红霉素耐药菌株;分为8个序列型(ST)(包括7个新型STA1~STA7),STA3为主要型别;分为17种PFGE带型,其相似系数为63.5%~100.0%,PTⅠ为主要PFGE带型。结论昌平区食源性Lm以1/2c、3a血清型为主,STA3为主要型别,PTⅠ为主要PFGE带型,其毒力基因的携带具有差异性,出现对四环素、红霉素耐药株,为食源性Lm的研究提供了参考。; 牛桓彩吴杨舒高林刘毅马文军李东迅; 关键词：单增李斯特菌血清型毒力基因多位点序列分型脉冲场凝胶电泳

北京市一些地区生肉标本中单增李斯特菌的分离及其分子流行病学特征分析被引量：25: 2015年; 目的了解北京市一些地区生肉中单增李斯特菌的污染情况及其分子流行病学特征。方法采用北欧食品分析标准(NMKL)对北京市一些地区采集的340份牛、羊、猪、鸡和鸭生肉标本进行单增李斯特菌的分离鉴定,并对分离菌株进行血清学分型(Serotyping)、脉冲场凝胶电泳(Pulsed Field Gel Electrophoresis,PFGE)分型及多位点序列分型(Multilocus Sequence Typing,MLST)分析。结果生肉标本中单增李斯特菌污染率为6.2%(21/340)。分离菌株含3种血清型(1/2a,1/2b和1/2c),以1/2c为优势血清型(占47.6%)。PFGE分析中,使用内切酶AscI酶切电泳将21株单增李斯特菌分为12个型别,可聚类为3个群。MLST分析将21株单增李斯特菌分为7个ST型,其中ST9型最多(10株)。结论北京市一些地区的生肉类食品中存在6.2%的单增李斯特菌污染率,这些单增李斯特菌以家系II菌株占据绝对优势(80.1%),其中1/2c型,GX6A16.CN0004和ST9型分别为血清型、PFGE带型以及MLST序列型的优势型别,与我国食源性单增李斯特菌的优势菌群特征一致。; 马爱静王艳王毅李东迅许华青袁雪娇刘凯叶长芸; 关键词：单增李斯特菌脉冲场凝胶电泳分型多位点序列分型

2010-2016年北京市昌平区细菌性痢疾监测与耐药性被引量：2: 2017年; 目的分析2010—2016年北京市昌平区引发病痢疾的志贺菌菌群分布及耐药特点,为细菌性痢疾临床治疗和制定防控措施提供科学依据。方法志贺菌的分离鉴定按照WS 287-2008《细菌性和阿米巴性痢疾诊断标准》进行。药敏试验参照美国临床和实验室标准化协会推荐的Kirby-Bauer法进行。结果 2 656份感染性腹泻患者粪便标本,检出志贺菌92株,总阳性率为3.46%;以D群宋内志贺菌为主(77.17%),其次为福氏2 a志贺菌(14.13%)。志贺菌对甲氧苄氨嘧啶完全耐药,对氨苄西林、萘啶酸、利福平、复方新诺明、四环素的耐药率分别为96.74%、97.83%、92.31%、90.22%、94.34%;94.57%的菌株对3种或3种以上抗生素耐药。结论 2010—2016年北京市昌平区志贺菌粪便检出率较低,主要流行菌群是宋内志贺菌;菌株耐药性呈上升趋势且多重耐药严重,提示临床用药应合理且具有针对性。; 闻艳红彭华徐代庆李楠高进玺李东迅; 关键词：细菌性痢疾志贺菌血清型耐药

两起GII.2型诺如病毒急性胃肠炎暴发疫情的病原学分析被引量：1: 2017年; 目的调查2016年10月昌平区某两所幼儿园两起急性胃肠炎暴发疫情的病原体,为疫情防控提供依据.方法采集两所幼儿园各一起急性胃肠炎暴发疫情的病例和密切接触者粪便标本,采用实时荧光RT-PCR检测方法检测病毒核酸,抽取部分阳性标本采用一步法RT-PCR扩增诺如病毒衣壳蛋白区部分基因,将PCR产物双向测序,采用Bio Edit和MEGA 6.06软件进行序列比对和进化分析.结果 70份粪便标本中37份为诺如病毒GII组核酸阳性,检出率为52.86％;未检出GI组.13份阳性标本的测序结果经序列比对均为诺如病毒GII.2基因型.两所幼儿园疫情代表毒株同源性为99.6％,与2016年北京和江苏毒株（GenBank序列号KY421122和KY421121）同源性最高.进化分析显示,两所幼儿园疫情代表毒株与诺如病毒GII.2基因型位于一个大的进化簇上,同中国的3株GII.2基因型毒株（GenBank序列号KY457736、KY421122、KY421121）亲缘关系最近.结论北京昌平区两所幼儿园出现的病毒性腹泻疫情的毒株为GII.2型,应加强日常监测与防控.; 闫革彬彭华舒高林李东迅王维钧徐代庆严寒秋; 关键词：诺如病毒进化树

北京市昌平区腹泻患者弯曲菌感染现状及其分子特征分析被引量：3: 2022年; 目的了解北京市昌平区腹泻患者弯曲菌感染现状及其分子流行特征,为该地区弯曲菌腹泻病的预防控制提供科学依据。方法收集2019年北京市昌平区某哨点医院腹泻患者粪便样本382份,进行弯曲菌、沙门菌、致泻大肠埃希菌、副溶血性弧菌检测,并对分离到的空肠弯曲菌进行脉冲场凝胶电泳分型(PFGE)分析。结果382份样本中,弯曲菌(58株,15.18%)检出率高于致泻大肠埃希菌(37株,9.69%)、沙门菌(24株,6.28%)和副溶血性弧菌(21株,5.50%),差异有统计学意义(χ^(2)=26.735,P=0.000)。季节分析显示:弯曲菌春季(14.71%)、夏季(18.33%)、秋季(15.00%)、冬季(10.00%)四季均有检出,但其差异无统计学意义(χ^(2)=2.197,P=0.533)。PFGE分析显示:30株空肠弯曲菌具有26种PFGE带型,相似系数为31.00%~100.00%,其PFGE带型具有多样性。结论弯曲菌检出率居于首位,四季检出,提示昌平区弯曲菌感染较严重,应引起重视,并制定相应的方针政策,防止由弯曲菌感染引起的疫情发生。; 李东迅王维钧彭华银安琪舒高林牛桓彩; 关键词：腹泻患者弯曲菌空肠弯曲菌脉冲场凝胶电泳

多重巢式PCR应用于1起聚集性发热疫情的病原诊断被引量：3: 2018年; 目的增强实验室对突发发热疫情的快速诊断能力,完善、优化聚集性发热的病原检测方法。方法采用多重巢式PCR扩增法,对1起聚集性发热疫情样本进行病原筛查,同时对扩增产物测序,进行BLAST比对,进行血清型分型,比较不同引物的扩增效果。结果采集7份病例咽拭子标本,以呼吸道病毒核酸多重联检试剂盒进行14种病毒筛查,其中4份为腺病毒阳性,阳性率为57.1%。采用3组巢式引物进行扩增,腺病毒阳性样本6份,均为腺病毒3型;测序成功的5株核苷酸、蛋白质序列同源性均为100.0%。第3组巢式引物扩增、分析效果较好,阳性率为71.4%。结论成品试剂盒可进行不明原因发热疫情的病原筛查;多重巢式PCR扩增法可增加病毒检出率,对病毒分型和序列分析。; 吴杨高进玺庄鹏李东迅刘重程舒高林牛桓彩; 关键词：呼吸道感染腺病毒基因分型

1株分离于肿物积液的单增李斯特菌的病原学特点及分子特征被引量：2: 2018年; 目的了解1株分离于肿物积液的单增李斯特菌的病原学特点和分子特征。方法对该菌株进行血清型、毒力基因、耐药性、脉冲场凝胶电泳(PFGE)和多位点序列分型(MLST)等分析。结果该菌株属于1/2b血清型、ST87型,携带12种毒力基因(actA,hlyA,prfA,flaA,plcA,plcB,Inl 1A,Inl 1B,Inl 1C,Inl J,iap,Mpl)。该菌株与LM263(江苏)、LM417(上海)的PFGE带型一致,与2株北京分离株(LM188、LM403)的PFGE带型相差一条带,相似性为95%。该菌株对青霉素G、苯唑西林、氨苄西林、头孢克洛、头孢噻肟、克拉霉素等6种抗生素耐药,对其他18种抗生素敏感或中介。结论该菌株属于引起李斯特菌病的常见血清型(1/2b)和ST型(ST87),具有强致病性,其PFGE型别已在中国其他地区出现。该菌对青霉素类抗生素耐药,应选用其他药物进行治疗。; 李东迅舒高林王维钧刘毅孙伟何秀娟; 关键词：单增李斯特菌脉冲场凝胶电泳多位点序列分型

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